遗传修饰基因对Hb H病临床表型多样性的作用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81200403
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H08.血液系统
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

αthalassemia is one of the most common single gene disorder in the Southern China. Hemoglobin H (Hb H)disease is used to indicate a clinical condition of intermediate gravity ofα thalassemia, which encompasses a wide phenotypic spectrum spanning from asymptomatic to embryonic lethality. The mechanism of phenotypic diversity remain confused. Here we try to provide new information of the genotype-phenotype correlation in the Hb H disease patients from the prospective of genetic modifier genes. Deletional and undeletional Hb H disease patients are recruited for this study, and they are divided into three groups according to their clinical severity: Mild, Moderate and Severe. In these three patients groups and normal congtrol groups, analysis of the molecular characterization of some specific SNPs of some tag genes(HBB,GATA1,NF-E2 and EKLF) and haplotype formed by these SNPs are performed to evaluatiing their genetic contribution towards the clinical phenotype. Next, in order to discover novel functional variants,some selected target genes(Brg1,PIP4KIIA and AHSP) are sequenced in the samples of selected patients.The influence of these functional variants on the mRNA expression level of the target gene are anlayzed. The expression impact of α globin and other erythroid development factor caused by the expressed alteration of the target gene are analyzed in the erythroid progenitor cells. According to above analysis results, the molecular mechanism of the functional variants aggravate the clincal phenotype of Hb H disease is clarified. This study analyzed the mechanism of how the genetic modifer genes modifing the phenotype from both SNPs sites/haplotype and functional variants directions.It will be useful in prenatal diagnosis and genetic counseling of Hb H disease.
α地中海贫血是对我国南方人群健康影响最大的单基因病之一。中间型α地中海贫血又称Hb H病,其患者表型从无症状到胚胎期致死,显示高度的临床异质性。这一现象用现有知识尚不能加以解释。本课题首次从遗传修饰基因的角度为阐明此类患者基因型与表现型的对应关系增添新的信息。通过分析表型为轻度、中度和重度的三组Hb H病例与正常对照组中HBB、GATA1、NF-E2和EKLF等基因的tagSNPs位点及单倍型的结构特点,评估这些位点修饰疾病表型的遗传贡献度。在选定病例中对Brg1、PIP4KIIA和AHSP基因进行测序以发现新的功能性变异;在红系祖细胞平台上分析该功能性变异对α珠蛋白和红系发育因子表达的影响;从而阐明该变异加重Hb H病表型的分子机制。本研究同时从SNPs位点及单倍型和功能性变异两个方向分析修饰基因影响表型的作用机制,可为HbH病的产前诊断和针对性遗传咨询提供理论依据。

结项摘要

α地中海贫血是对我国南方人群健康影响最大的单基因病之一。中间型α地中海贫血又称Hb H 病,其患者表型从无症状到胚胎期致死,显示高度的临床表型多样性。其临床处置具有较大争议,主要原因是基因型和表型的对应关系尚未完全阐明。本项目拟通过分析大量Hb H病病例的发病原因,弄清致病主基因α珠蛋白基因型以及一些修饰基因对该疾病表型强弱的影响程度,从而为该病的临床诊断和遗传咨询提供新的信息。本课题取得了如下研究成果:①发现一个世界首报的α珠蛋白基因簇上的新突变。此突变复合东南亚缺失突变(- - SEA/)导致一例罕见的呈现中度贫血的Hb H病患儿。这一发现丰富了地贫的致病突变数据库,加深了对中国人群地贫突变谱的认识。同时我们还分析了这一融合基因的发生机制,为研究地贫基因的分子进化机制的研究提供了参考。②系统分析了红系特异转录因子KLF1对α-地中海贫血个体表型的影响作用,并进而确定了与Hb H病严重程度具有显著相关性的遗传修饰因素。我们对1468例无血缘关系的α-地中海贫血个体(742例α-地中海贫血携带者和726个HbH病患者)的珠蛋白基因型和KLF1基因型进行测定,再结合表型数据进行分析。在α-地中海贫血携带者群体,发现合并KLF1突变将导致α-地中海贫血携带者个体MCV和MCH下降伴随Hb A2和Hb F升高。而在HbH病群体,采用二元逻辑回归分析四种潜在修饰因素(HBA基因型,HBB基因型,KLF1基因型和性别)对疾病表型严重的影响程度。结果提示除KLF1基因型外,其他3种因素均与Hb H病严重程度有显著性关联。这一结果是首次针对Hb H病的严重程度进行多因素分析,大约有73.6%的Hb H病患者的表型严重程度可以据此解释。③设计了一种新的准确分析基因组大缺失突变的分子结构的研究策略,并应用此策略成功确定了一个235kb的缺失突变的断裂点,从而对一例疑难Hb H病的病例的发病原因进行了确诊。综上所述,本项目的研究结果为HbH 病的产前诊断和开展针对性遗传咨询提供了新的理论依据。本课题按照申请书的研究计划稳步进行,研究计划无重大调整和变动,部分内容在后续总结完善中。与本项目研究直接相关的研究结果已发表SCI期刊文章两篇(Blood Cells, Molecules and Diseases,2013和Clinical Genetics,

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(4)
专利数量(0)
Changes in hematological parameters in α-thalassemia individuals co-inherited with erythroid Krüppel-like factor mutations
与红系 Krüppel 样因子突变共同遗传的 α 地中海贫血个体血液学参数的变化
  • DOI:
    10.1080/2201473x.2022.2032545
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Clin Genet
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    商璇
  • 通讯作者:
    商璇
Changes in hematological parameters in alpha-thalassemia individuals co-inherited with erythroid Kruppel-like factor mutations.
与红系 Kruppel 样因子突变共同遗传的 α 地中海贫血个体血液学参数的变化。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Clinical Genetics
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Wei; X-F;Liu; Y-H;Zhou; T-B;Xu; X-M
  • 通讯作者:
    X-M
A novel fusion gene and a common alpha(0)-thalassemia deletion cause hemoglobin H disease in a Chinese family.
一个新的融合基因和一个常见的α(0)-地中海贫血缺失导致了一个中国家庭的血红蛋白H病。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Blood Cells Mol Dis
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang; Xin-Hua;Wei; Xiao-Feng;Xiong; Fu;Xu; Xiang-Min
  • 通讯作者:
    Xiang-Min

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  • 通讯作者:
    夏来
广西地区79例复合型α-和β-地中海贫血携带者血液学特征分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
    熊符;娄季武;魏小凤;孙曼娜;黄际卫;商璇;张新华;徐湘民
  • 通讯作者:
    徐湘民

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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