仅由蛋白质组成的RNase P(PRORP)的结构及催化机制研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    U1932114
  • 项目类别:
    联合基金项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A3202.上海光源
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

tRNA was transcribed as precursor molecules with immature 5' and 3’ end, which need to undergo necessary processing steps to be functional in translation. The removal of 5' leader sequence of pre-tRNA was carried out by an essential endonuclease RNase P. As an essential biological molecule that involved in so important a biological process, structural and catalytic mechanism studies of RNase P will definitely broad our understanding of the basic and essential process in living organism. RNase P can be categorize into two, one is RNA-based catalyst containing ribonucleoprotein complex, the other is protein-only enzymes (PRORP). In the past two years, our group made great progresses and gained a deep understanding of the structure and catalytic mechanism of the RNA-based eukaryotic RNase P. In this project , we will focus on the other RNase P category—PRORP. We will employ a combination of structural biology, molecular biology, biochemistry, and cell biology to study the.structural basis of the catalytic mechanism of PRORP, to investigate the substrate recognition and processing mechanism, and to clarify how each subunit in the complex coordinates together to achieve a full activity.
tRNA是以前体的形式被转录出来,具有未成熟的5'和3’末端,必须经过必要的加工才能成为有功能的分子。其中tRNA 5' 末端的加工由核酸内切酶RNase P来完成。作为体内保守的为生命活动所必需的一类生物大分子,有关RNase P的结构与催化机制的研究势必将加深拓展我们对体内基础的必需的生物学过程的理解。RNase P一共有两大类,一类是RNA-蛋白复合物由RNA介导催化反应,一类是仅由蛋白质组成的由蛋白质介导催化反应。过去的两年我们研究组在RNA介导的RNase P的结构与催化机理上取得了长足的进步和深刻的认识。在本项目中,我们将聚焦另一类仅由蛋白质组成的RNase P(PRORP)及其相关复合物,综合运用多种技术手段,在分子水平上探索PRORP发挥酶学活性的结构基础,探索PRORP的底物识别和催化机理,理清整个复合物亚基间的协同调控关系。

结项摘要

RNase P一共有两大类,一类是RNA-蛋白复合物由RNA介导催化反应,一类是仅由蛋白质组成的由蛋白质介导催化反应。过去的两年我们研究组在RNA介导的RNase P的结构与催化机理上取得了长足的进步和深刻的认识。在本项目中,我们纯化了仅由蛋白质组成的RNase P(PRORP)及其相关复合物。并综合运用多种技术手段,我们完成了酵母RNase MRP全酶及其与底物复合物的冷冻电镜结构解析,阐释了酵母RNase MRP的底物识别和催化机制。此外,我们解析了人源RNA聚合酶III的高分辨率冷冻电镜结构,阐述了RNA聚合酶III催化转录调控的分子机制;阐述了乙酰辅酶A激活丙酮酸羧化酶催化过程的分子机理研究。我们的研究结果势必将加深拓展我们对体内基础的必需的生物学过程的理解。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural insight into precursor ribosomal RNA processing by ribonuclease MRP
核糖核酸酶 MRP 对前体核糖体 RNA 加工的结构洞察
  • DOI:
    10.1126/science.abc0149
  • 发表时间:
    2020-08-07
  • 期刊:
    SCIENCE
  • 影响因子:
    56.9
  • 作者:
    Lan, Pengfei;Zhou, Bin;Lei, Ming
  • 通讯作者:
    Lei, Ming
Structural insights into transcriptional regulation of human RNA polymerase III
人类 RNA 聚合酶 III 转录调控的结构见解
  • DOI:
    10.1038/s41594-021-00557-x
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Nature Structural & Molecular Biology
  • 影响因子:
    16.8
  • 作者:
    Qianmin Wang;Shaobai Li;Futang Wan;Youwei Xu;Zhenfang Wu;Mi Cao;Pengfei Lan;Ming Lei;Jian Wu
  • 通讯作者:
    Jian Wu

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其他文献

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兰鹏飞的其他基金

酵母RNase MRP的结构及催化机制研究
  • 批准号:
    31900929
  • 批准年份:
    2019
  • 资助金额:
    24.0 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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