环磷酸腺苷钠结晶水的形成机制与调控

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21908100
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0812.生物化工与合成生物工程
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Crystal products of nucleotides can exist in the form of various hydrates. Crystal water has an effect on the crystal form and habit of product, and then it affects the physical and chemical properties of products, which is the main factor restricting the development of such products to high-end.To date, the formation mechanism of crystal water is still not clear, which results in the difficulty to rationally control the content of crystal water for given nucleotide compound. In this paper, taking adenosine 3′,5′- cyclic mono-phosphate sodium (cAMPNa) for example, on the basis of experiment, introducing the concept of "residual space", we investigate the crystallization process of cAMPNa solution from in various aspects by means of molecular simulation, to explore auto-assembly mechanism of water molecules participating in cAMP- and Na+ at micro level, and attempting to elucidate the formation mechanism of crystal water. Furthermore, we try to search a key factor that depending on crystal water, and establish the relationship between the environment conditions and the content of crystal water of final product, to control the crystal water of cAMPNa during its crystallization. The research achievements would be expected to provide a reference for other nucleotides.
核苷酸类物质的晶体产品可以以多种结晶水合物的形式存在,结晶水会影响产品的晶型和晶习,进而影响到产品的物化性质,是制约此类产品质量向高端化发展的重要因素。目前,其结晶过程中结晶水的形成机制尚不清晰,导致结晶水的个数难以科学调控。本项目拟以3′,5′-环磷酸腺苷钠(cAMPNa)为研究对象,以实验为基础,引入“剩余空间”的概念,借助分子模拟的手段从不同层面、不同角度研究cAMPNa溶液结晶过程,试图剖析水分子在微观层面参与cAMP-和Na+的自组装机制,探索cAMPNa在结晶过程中结晶水的形成机制,确立微观层面影响其结晶水个数的关键因素,借此建立起结晶表观因素和最终所形成的产品结晶水个数之间的相关性,以实现cAMPNa在结晶过程中结晶水的调控,为此类物质的结晶水问题的认识和解决提供参考。

结项摘要

针对核苷酸类物质结晶水的存在性和多样性问题,本项目以3′-5′-环磷酸腺苷钠盐(cAMPNa,化学计量型水合物)和 5′-尿苷酸(UMP,非化学计量型水合物)为例,提出了“剩余空间效应”,阐明了结晶水的形成机制,回答了为什么核苷酸类物质在结晶过程中容易形成结晶水合物,以及为什么可以形成含有不同个数结晶水的晶体。在此基础上,开发了晶型与粒度调控的共性技术与绿色转晶技术,在核苷酸、尼龙盐、虫草素等多种有机小分子上实现推广应用。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
The effect of polymorphism on polymer properties: crystal structure, stability and polymerization of the short-chain bio-based nylon 52 monomer 1,5-pentanediamine oxalate.
多晶型对聚合物性能的影响:短链生物基尼龙52单体1,5-戊二胺草酸盐的晶体结构、稳定性和聚合
  • DOI:
    10.1107/s2052252522010442
  • 发表时间:
    2023-01-01
  • 期刊:
    IUCrJ
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
  • 通讯作者:
Discovering Crystal Forms of the Bio-based Nylon 5O Monomer 1,5-pentanediamine-O-phthalate: Insight into the Crystal Structures, Transformations and Stability
发现生物基尼龙 5O 单体 1,5-戊二胺-邻苯二甲酸酯的晶型:深入了解晶体结构、转变和稳定性
  • DOI:
    10.1039/d2ce00628f
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    CrystEngComm
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Li Zihan;Fang Xincao;Yang Pengpeng;Li Shushu;Wen Qingshi;Zhuang Wei;Wu Jinglan;Zhu Chenjie;Ying Hanjie
  • 通讯作者:
    Ying Hanjie
Green Mechanochemical Strategy for the Construction of a New Bio-based Nylon 524T Ternary Salt
构建新型生物基尼龙524T三元盐的绿色机械化学策略
  • DOI:
    10.1021/acssuschemeng.1c07869
  • 发表时间:
    2022-03
  • 期刊:
    ACS Sustainable Chem. Eng.
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Yang Pengpeng;Li xiaojie;Li zihan;Fang Xincao;Zhang Keke;Zhuang Wei;Wu Jinglan;Zhu Chenjie;Ying Hanjie
  • 通讯作者:
    Ying Hanjie
Hydrates of adenosine 3 ',5 '-cyclic monophosphate sodium and their transformation
腺苷3',5'-环单磷酸钠水合物及其转化
  • DOI:
    10.1039/d0ce01180k
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    CrystEngComm
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Yang Pengpeng;Jin Junyang;Wen Qingshi;Lin Chenguang;Fu JinQiu;Zhuang Wei;Wu Jinglan;Liu Dong;Zhu Chenjie;Ying Hanjie
  • 通讯作者:
    Ying Hanjie
Crystal structure, thermodynamics, and crystallization of bio-based polyamide 56 salt
生物基聚酰胺 56 盐的晶体结构、热力学和结晶
  • DOI:
    10.1039/d0ce00198h
  • 发表时间:
    2020-05-14
  • 期刊:
    CRYSTENGCOMM
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Yang, Pengpeng;Peng, Xiaoqiang;Ying, Hanjie
  • 通讯作者:
    Ying, Hanjie

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  • 通讯作者:
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  • 作者:
    杨朋朋;韩学山
  • 通讯作者:
    韩学山

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杨朋朋的其他基金

基于共结晶三元盐的生物基耐高温共聚酰胺链段结构调控新策略
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
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  • 批准号:
    22278217
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  • 资助金额:
    54.00 万元
  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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