井冈霉烯胺生物合成途径的重构

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31200061
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2012
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2013-01-01 至2015-12-31

项目摘要

Valienamine is pseudoamino-sugar analogs of D-glucose, which has a-glucosidase inhibitory activity. and its derivatives have been found to be key components for biological activities in pseudo-aminosugars and pseudo- oligosaccharides. Therefore, valienamine is one of the most important chemical intermediates for the production of glucosidase inhibitors, which are potential to be medicines.Voglibose,for example, has been used in Diabetic Patents since 1994..Microbial degradation of validamycin to produce valienamine refers to at least 13 genes,which occur complicated pathway and byproducts.The gene cluster for validamycin biosynthesis in Streptomyces hygroscopicus 5008 has been cloned and a number of the proteins involved have been characterized,resulting in biosynthetic pathway to Valienone(ValA,ValD,ValK),which is poroposed to be transformed to valienamine through an aminotransferase in vitro synthetic biology design.Through screening and rational design evolution for the heterogeny aminotransferase,we plan to built an efficient biosynthetic pathway of valienamine and banlance the modular control over metabolic fulux in vitro.
井冈霉烯胺是假氨基糖类水解酶抑制剂的核心结构,在糖尿病及相关疾病治疗中具有重要作用。目前应用两步微生物发酵法(涉及13个基因)的复杂途径来制备井冈霉烯胺,生产效率低,亟待应用生物学新技术建立新的高效合成途径。本项目依据合成生物学设计理念,在Streptomyces hygroscopicus 5008中井冈霉素合成途径中ValA、ValD、ValK三个催化元件合成井冈霉烯酮的基础上,引入异源(如Bacillus circulans等)氨基转移酶,建立井冈霉烯胺合成的多酶耦合体系;通过酶分子改造,提高井冈霉烯胺的合成效率;并探讨各催化元件的体外协同作用。本研究的开展,不仅将构建新的井冈霉烯胺生物合成途径,还将丰富合成生物学在天然化合物合成领域应用的理论和实践。

结项摘要

C7N 氨基环醇类化合物三羟基环己烷或环己烯骨架上有一个羟甲基,结构与天然吡啶糖结构相似,可以被糖代谢过程中能量储备、信号传导、物质转运等代谢途径中的酶识别,因而具有重要的生物学特性。.β-valienamine 不饱和环己烯骨架上有R-氨基,是井冈霉素结构中 α-糖苷酶抑制剂前体 valienamine 的1-差向异构体。与 β-葡萄糖 C1 到 C4 拥有相同的立体构型,可作为 β-糖苷酶抑制剂开发的先导化合物,应用于由β-糖苷酶功能相关代谢疾病的药物开发。其衍生物 N-辛烷基-β-valienamine(NOV)和 N-辛烷基-4-epi-β-valienamine(NOEV)可以作为药物分子伴侣治疗由β-糖苷酶功能异常导致的 GM1-神经节苷脂贮积症、Morquio B 症以及 Gaucher 症等溶酶体贮积症(lysosomal storage disease, LSD)。由于其分子结构中具有多个手性中心,化学全合成较为困难,获得的一般为 β-valienamine 和 valienamine 的消旋产物。.本研究应用合成生物学理念,系统地分析了目标产物与微生物次级代谢产物结构的相似性、异源微生物酶催化反应的立体选择性及催化效率、微生物天然产物合成途径的模块性,以及合成代谢多途径的竞争性等特点。以吸水链霉菌井冈霉素生物合成途径中间产物井冈霉烯酮为起始化合物,引入高度立体选择性的芽孢杆菌氨基转移酶(产物光学纯度 > 99.9 %)基因,并通过代谢工程手段敲除相关酶基因以阻断竞争途径,将异源氨基转移酶与井冈霉素生物合成途径进行了耦合,获得了发酵培养96小时可产生20 mg/L β-井冈霉烯胺的突变菌株。所构建的新的生物合成途径不仅解决了原有化学合成方法步骤多、安全性低等问题,更重要的是对“非天然产物”药物在微生物中生物合成进行了有益尝试。本研究还助于阐明生物体中复杂酶及代谢途径等模块组装合理性、有效性等合成生物学基础理论问题。.研究成果 De Novo Biosynthesis of β-Valienamine in Engineered Streptomyces hygroscopicus 5008 发表在国际合成生物学领域知名期刊-美国化学联合会合成生物学(ACS synthetic biology)上。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
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专利数量(0)

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  • 通讯作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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