蹄盖蕨科双盖蕨亚科的分子系统学和生物地理学研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31170199
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0202.植物系统发生与进化
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

主产亚洲和美洲热带地区的蹄盖蕨科双盖蕨亚科植物是少数缺乏研究的世界性类群之一,其系统学的研究将对理解薄囊蕨类完整的系统发育关系至关重要。该亚科约有300多种,形态变异复杂,亚科内属的划分和属下分类长期存在争议。本立项拟采用5个叶绿体片段(rbcL、trnL-F、rps4、rps4-trnS和psbA-trnH)及2个核基因(LEAFY和PgiC)重建双盖蕨亚科的系统发育关系,基于系统发育框架进行祖先分布区重建,以及分子钟推算,揭示洲际间断分布格局形成的原因;基于对重要形态学性状的分析,建立世界双盖蕨亚科植物的分类系统。其结果将不仅完善我们对整个蹄盖蕨科植物系统发育关系的理解,而且为薄囊蕨类的起源与演化提供新的研究实例,促进和丰富蕨类植物洲际间断分布等生物地理学热点问题的研究。

结项摘要

蹄盖蕨科双盖蕨属Diplazium是少数缺乏研究的世界性类群之一,其系统学的研究将对理解薄囊蕨类完整的系统发育关系至关重要。该属约有350-400种,呈典型的泛热带间断分布格局。由于其种类繁多,形态变异较大,地理分布范围广泛,该属的界定和属下划分一直存在较大争议;其起源时间和地点以及间断分布格局的成因并不清楚。本立项利用分子系统学和生物地理学的方法,基于世界范围取样,并利用7个叶绿体DNA分子标记(atpA、atpB、matK、rbcL、rps4、rps4-trnS以及trnL-F)对双盖蕨属及其近缘类群进行了联合数据的系统发育重建、分子钟估算和祖先分布地重建,深入探讨了双盖蕨属的系统发育和生物地理历史。所有系统发育的分析方法(最大简约法、最大似然法和贝叶斯分析法)表明,双盖蕨属不是单系类群,传统定义的短肠蕨属Allantodia、菜蕨属Callipteris和毛子蕨属Monomelangium均嵌套在双盖蕨属内,共同构成一个单系类群。系统发育分析进一步将这一单系类群划分出4个强烈支持的主分支。结合重要的形态特证,本立项对双盖蕨属的属级范围进行重新界定,并将短肠蕨属、菜蕨属以及毛子蕨属作为新定义的双盖蕨属的异名,并将新定义的双盖蕨属依据系统发育框架划分为4个亚属(拟短肠蕨属亚属、双盖蕨亚属、黑鳞亚属和菜蕨亚属)。生物地理的分析结果表明,双盖蕨属起源于始新世时期的欧亚大陆。其中双盖蕨亚属的新旧热带间断分布格局是由北热带植物带在始新世时的中高纬度发生灭绝并向南迁移所形成;而对于菜蕨亚属中的新旧热带间断则可能为中新世跨洋长距离扩散的结果。此外,由于中新世时期岛屿链的形成,旧热带分布的双盖蕨属在不同地区之间则进行了反复的扩散,进而形成了现在的泛热带间断格局。本项目的研究成果将不仅完善我们对整个蹄盖蕨科植物系统发育关系的理解,而且为薄囊蕨类的起源与演化提供新的研究实例,促进和丰富蕨类植物洲际间断分布等生物地理学热点问题的研究。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
Molecular Phylogeny of the Cliff Ferns (Woodsiaceae: Polypodiales) with a Proposed Infrageneric Classification.
悬崖蕨类植物(Woodsiaceae:Polypodiales)的分子系统发育与拟议的下属分类
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0136318
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Shao Y;Wei R;Zhang X;Xiang Q
  • 通讯作者:
    Xiang Q
Eurasian origin, boreotropical migration and transoceanic dispersal in the pantropical fern genus Diplazium (Athyriaceae)
泛热带蕨类植物 Diplazium(Athyriaceae)的欧亚起源、向北迁移和跨洋扩散
  • DOI:
    10.1111/jbi.12551
  • 发表时间:
    2015-10
  • 期刊:
    Journal of Biogeography
  • 影响因子:
    3.9
  • 作者:
    Michael, Kessler;Peris, W. Kamau;Arief, Hidayat;Xian-Chun, Zhang
  • 通讯作者:
    Xian-Chun, Zhang
Recircumscription of Huperzia serrata complex in China using morphological and climatic data
利用形态和气候数据重新划分中国锯齿石杉复合体
  • DOI:
    10.1111/jse.12120
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Shrestha, Nawal;Zhang, Xian-Chun
  • 通讯作者:
    Zhang, Xian-Chun
Toward a new circumscription of the twinsorus-fern genus Diplazium (Athyriaceae): A molecular phylogeny with morphological implications and infrageneric taxonomy
双叶蕨属 Diplazium(Athyriaceae)的新界限:具有形态学含义和属下分类学的分子系统发育
  • DOI:
    10.12705/623.8
  • 发表时间:
    2013-06-01
  • 期刊:
    TAXON
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Wei, Ran;Schneider, Harald;Zhang, Xian-Chun
  • 通讯作者:
    Zhang, Xian-Chun
中国现代石松类和蕨类的系统发育与分类系统
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘红梅;何丽娟;王丽;张钢民
  • 通讯作者:
    张钢民

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    张钢民;董仕勇;张宪春
  • 通讯作者:
    张宪春

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

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前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
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技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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