金属离子依赖性蛋白磷酸酶PPM1K的催化机制、底物特异性和功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470789
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    80.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

The metal dependent protein phosphatase PPM1K is an important regulator of cell metabolism. The mutations of PPM1K were associated with maple syrup urine disease (MSUD) and type 2 diabetes. In vivo, PPM1K not only promotes the degradation of the branched-chain amino acids (BCAA) through the dephosphorylation of the branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complexes, but also regulates multiple metabolism processes, such as insulin secretion. Therefore, elucidation of the catalytic mechanism and function of PPM1K has great scientific value. Recently, we have accumulated preliminary data for the catalytic property of the PPM1K、the activation of the PPM1K by BCKD-E2α and the potentail role of the PPM1K in the regulation of KATP channel. We proposed investigate the detailed molecular mechanism underlying the catalysis and activation of the PPM1K、 the substrate specificity of the PPM1K and the role of PPM1K in regulation of the insulin secretion, by combined biochemical、enzymologic and structural methods. Moreover, we are going to identify the unknown substrate of PPM1K in physiological or pathological contexts.
金属离子依赖性蛋白磷酸酶PPM1K是体内代谢活动的重要调控因子,其突变与枫糖尿病和2型糖尿病密切相关。PPM1K不仅通过去磷酸化侧链酮酸脱氢酶复合物(BCKD)来促进侧链酮酸在体内的降解;还调控高糖介导的胰岛素分泌等多种代谢过程。理解PPM1K的催化机制、激活原理、底物特异性以及其调控代谢活动的机制,既是目前的研究热点也有重要科学意义。我们最近初步分析了金属离子介导的PPM1K对底物的催化机制,探索了BCKD-E2α对PPM1K的激活原理,明确了PPM1K对胰岛素分泌的关键节点KATP通道失活的作用。基于这些研究基础,本课题将联合分子与细胞生物学方法,应用多种酶学和结构生物学手段,阐明PPM1K的催化和激活原理、底物选择性和对胰岛素分泌的调控机制。进一步,基于PPM1K的底物选择性,我们还将联合生物信息学和新发展的PPM1K底物陷阱技术,发现PPM1K在代谢活动中的未知底物。

结项摘要

金属离子依赖性蛋白磷酸酶PPM1K是体内代谢活动的重要调控因子,其突变与枫糖尿病和2型糖尿病密切相关。理解PPM1K的催化机制、激活原理、底物特异性以及其调控代谢活动的机制,既是目前的研究热点也有重要科学意义。本课题将联合分子与细胞生物学方法,应用多种酶学和结构生物学手段,阐明PPM1K的催化和激活原理、底物选择性和对胰岛素分泌的调控机制。本课题依据项目申请书,1)对磷酸酶PPM1K野生型和不同突变体进行了酶学研究,应用多种酶学方法阐明PPM1K不同突变对催化的影响机制和激活原理。2)研究PPM1K的底物特异性,发展了PPM1K分子陷阱探针,为探索和发现PPM1K的未知底物奠定了基础;3)研究了磷酸酶PPM1K N94K突变的对磷酸小分子底物和磷酸多肽底物的催化性质,确定了N94K对催化和底物选择的影响。4)利用晶体学方法发现PPM1K N94K催化活性中心催化存在三个金属离子结合位点,阐明了N94K影响催化和底物选择的结构基础。在四年的研究周期中,我们依据项目申请书的研究内容,基本完成了研究目标,研究工作取得很好的进展,在《Nature Chemical Biology》,《Nature Communications》,《J Clin Invest》,《Biol Psychiatry》,《Cell Reports》,《J Biol Chem》和《Mol Pharmacol》等有影响的SCI收录刊物发表了与本课题相关的12篇文章(已标注基金号),课题负责人作为全部这些文章的通讯作者。申请人参加了2017年8月在英国举行的嗜铬细胞国际研讨大会和2016年11月在澳大利亚墨尔本召开的分子药理学大会,对取得的科研成果进行了墙报展示。申请人还获得生化与分子药理学专委会,中美药理学会,受体专委会,北京大学和河北医科大学的邀请,进行了学术研究报告。

项目成果

期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Arrestin-biased AT1R agonism induces acute catecholamine secretion through TRPC3 coupling.
抑制蛋白偏向的 AT1R 激动作用通过 TRPC3 偶联诱导急性儿茶酚胺分泌
  • DOI:
    10.1038/ncomms14335
  • 发表时间:
    2017-02-09
  • 期刊:
    Nature communications
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Liu CH;Gong Z;Liang ZL;Liu ZX;Yang F;Sun YJ;Ma ML;Wang YJ;Ji CR;Wang YH;Wang MJ;Cui FA;Lin A;Zheng WS;He DF;Qu CX;Xiao P;Liu CY;Thomsen AR;Joseph Cahill T 3rd;Kahsai AW;Yi F;Xiao KH;Xue T;Zhou Z;Yu X;Sun JP
  • 通讯作者:
    Sun JP
Allosteric modulation of the catalytic VYD loop in Slingshot by its N-terminal domain underlies both Slingshot auto-inhibition and activation
Slingshot 中催化 VYD 环通过其 N 端结构域的变构调节是 Slingshot 自动抑制和激活的基础
  • DOI:
    10.1074/jbc.ra118.004175
  • 发表时间:
    2018-08
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Yang Duxiao;Xiao Peng;Li Qing;Fu Xiaolei;Pan Chang;Lu Di;Wen Shishuai;Xia Wanying;He Dongfang;Li Hui;Fang Hao;Shen Yuemao;Xu Zhigang;Lin Amy;Wang Chuan;Yu Xiao;Wu Jiawei;Sun Jinpeng
  • 通讯作者:
    Sun Jinpeng
Adaptive Activation of a Stress Response Pathway Improves Learning and Memory Through Gs and beta-Arrestin-1-Regulated Lactate Metabolism.
应激反应途径的适应性激活通过 Gs 和 beta-Arrestin-1 调节的乳酸代谢改善学习和记忆。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Biol Psychiatry
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Cahill, Thomas Joseph 3rd;Chen, Zhe-Yu;Yu, Xiao;Sun, Jin-Peng
  • 通讯作者:
    Sun, Jin-Peng
The catalytic role of the M2 metal ion in PP2Cα.
M2金属离子在PP2C α中的催化作用
  • DOI:
    10.1038/srep08560
  • 发表时间:
    2015-02-24
  • 期刊:
    Scientific reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Pan C;Tang JY;Xu YF;Xiao P;Liu HD;Wang HA;Wang WB;Meng FG;Yu X;Sun JP
  • 通讯作者:
    Sun JP
The catalytic role of the M2 metal ion in PP2C alpha
M2金属离子在PP2C α中的催化作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    Scientific Reports
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Wang, Wen-Bo;Meng, Fan-Guo;Yu, Xiao;Sun, Jin-Peng
  • 通讯作者:
    Sun, Jin-Peng

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    张靠民;孙金鹏;赵焱;董祥;李如燕
  • 通讯作者:
    李如燕

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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