基于叶围孢子数量变化规律的橡胶树炭疽病预测预报模型构建

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31860183
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    40.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1608.森林信息学与森林经理学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The anthracnose of rubber tree is very difficult to predict due to the fact that anthrax has invaded the leaf tissue for a very short period of time. On the basis of research on anthrax epidemiology, we found rubber tree anthrax effect protein, and screening dilute mutant in pathogenicity. We purposed basing on the change of the number of spores on leaf peripheral is an effective way to forecast rubber anthrax occurrence regularity. In this projects, plant pathology, molecular biology and prediction model were used to construct the technology, and the quantitative detection technology of anthrax bacteria in the surrounding tissues of rubber trees was proposed.According to the specific primer design of anthrax, the detection and monitoring kit of rubber tree anthrax was developed.Collect anthracnose disease stress data and record the time, the environmental data collection, using the regression method to establish rubber anthrax prediction mathematical model, and using the model of telemetry validation and modification to the model.This study lays a good foundation for the establishment of the prediction and forecasting technique for the important diseases of trees.
橡胶树炭疽病因炭疽菌早已侵入到叶片组织中,不易发现,在气候条件适宜的情况下,极短的时间内即可爆发成灾,预测难度大。我们在研究炭疽病流行病学的基础上,发现橡胶树炭疽病存在效应蛋白,并筛选鉴定致病力减弱突变体,认为基于橡胶树叶围孢子数量变化规律进行模型构建是预测橡胶树炭疽病发生规律的有效途径。项目拟采用植物病理学,分子生物学和预测模型构建技术研究橡胶树叶片周边组织炭疽菌体的定量检测技术;根据炭疽菌特异性引物设计,研发橡胶树炭疽病检测监测试剂盒;收集炭疽病发病程度数据和记录时间、收集环境数据,采用回归方法建立橡胶树炭疽病预测预报数学模型,并利用模型进行测报验证和对模型进行修正。本研究为建立林木重要病害预测预报技术打下良好基础。

结项摘要

橡胶树炭疽菌侵入到叶片组织中不易发现,且在气候条件适宜的情况下极短时间内爆发,导致炭疽病预测预报和防控难度大。我们在前期研究炭疽病流行病学的基础上,提出基于橡胶树叶围孢子数量变化规律进行模型构建是预测橡胶树炭疽病发生规律的有效途径。联合采用植物病理学,分子生物学和预测模型构建技术等多种方法共同建立精确、微量的炭疽菌孢子分析检测技术,并建立预测模型。首先,分别建立以1%刚果红为染色剂的橡胶树叶片中胶孢炭疽菌的染色方法,可清晰观察到胶孢炭疽菌在橡胶树叶片上的发育进程和侵染结构。其次,基于暹罗炭疽菌ITS序列,设计特异性强的荧光定量PCR引物ITSF3/ITSR3。构建了荧光定量PCR体系,灵敏度高、稳定性强,可检测到100 fg基因组DNA、100个拷贝的目标质粒DNA和20个分生孢子,可以监测不同物候期的橡胶树叶片中暹罗炭疽菌从潜伏侵染到致死侵染的生长全过程。进一步结合室内模拟实验和田间试验建立了logistic回归分析模型和多元线性回归病情指数预测模型,采用了有监督的机器学习现有模型,分析物候、温度、湿度、观测时间、孢子密度、附着孢密度等对橡胶树炭疽病病情指数的影响。基于环境因子、物候期、发病进程及炭疽菌荧光定量数据,建立了基于荧光定量PCR检测技术的橡胶树炭疽病动态预测模型,经海南多地多年田间数据验证动态预测模型准确率为83%。本研究建立的荧光定量PCR方法具有更强的特异性和敏感性,能够对叶片中的暹罗炭疽菌进行实时定量。本研究结果不仅可用于橡胶树炭疽病的动态预测,也为建立林木重要病害预测预报技术打下良好基础。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
橡胶树枯萎病病原菌室内毒力测定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    热带生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    彭昀;肖宇明;刘衍超;李增平;王萌;梁晓宇;张宇
  • 通讯作者:
    张宇
SGT1基因研究进展及其在橡胶树白粉病抗性中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    分子植物育种
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘明洋;张宇;梁晓宇;王萌
  • 通讯作者:
    王萌
橡胶树胶孢炭疽菌复合群LAMP检测方法的建立及应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    植物病理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    连文旭;王萌;张宇;梁晓宇
  • 通讯作者:
    梁晓宇
胶孢炭疽菌侵染橡胶树叶片染色方法的建立及显微观察
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    热带作物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    龙明滕;梁晓宇;杜艳楠;邹丽君;张宇;王萌
  • 通讯作者:
    王萌
Comparative Transcriptome Analyses Reveal Conserved and Distinct Mechanisms of the SDHI Fungicide Benzovindiflupyr Inhibiting Colletotrichum
比较转录组分析揭示了 SDHI 杀菌剂 Benzovindiflupyr 抑制炭疽病的保守且独特的机制
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Phytopathology
  • 影响因子:
    3.2
  • 作者:
    Xiaoyu Liang;Lijun Zou;Wenxu Lian;Meng Wang;Ye Yang;Yu Zhang
  • 通讯作者:
    Yu Zhang

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其他文献

深海氨氧化古菌的环境适应基础及生态功能(英文)
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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    --
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  • 通讯作者:
    朱婷婷

其他文献

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张宇的其他基金

橡胶树草甘膦抗性关键基因HbEPSPS的结构与功能解析
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    50.0 万元
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    地区科学基金项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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