植物极定位转录因子Vrtn在斑马鱼和小鼠早期胚胎发育中功能的比较研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871451
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1203.早期胚胎发育及细胞谱系建立
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Localized maternal factors in fish play crucial roles in early embryogenesis, while in mammals cell-cell interaction seems to overwhelm egg polarity to control their development. In the background of this significant evolutionary transformation, whether and how the ancient localized factors change their function remains an interesting but largely illusive question. In zebrafish, Vrtn is a transcription factor with its mRNA vegetally localized, but the transcripts of its mouse ortholog loses this polarized distribution. Mutation of both materal and zygotic vrtn products in zebrafish leads to mild but viable axis defect. In sharp contrast, vrtn mutation in mouse is deleterious and causes embryonic death before E10.5 due to developmental failure of the umbilical cord and the placenta, characteristic extra-embryonic tissues in Eutheria mammals. These huge differences make vrtn an excellent subject for the comparative study in order to probe into the scientific question raised above. In this study, we will further investigate the molecular mechanisms underlying the vegetal localization of vrtn mRNA in zebrafish oocytes, as well as the mechanisms to drive the transcriptional repressive activity of Vrtn protein. More importantly, the functions and downstream regulative networks of zebrafish and mouse Vrtn will be comparatively studied in the evolutionary prospective. This study thus has the potential to reveal the functions and mechanisms of vrtn in the regulation of early embryonic development in both zebrafish and mouse animal models, and to find the evolutionary changes of the downstream regulative networks responsible for the interspecies functional differences.
由鱼类到哺乳类早期胚胎发育的调控策略从依赖定位的母源因子转变为主要依靠细胞或组织间的相互作用。古老的定位因子的功能和分子机制在这个重大变化的背景下发生了怎样的改变,这个有趣的科学问题仍然没有答案。Vrtn在斑马鱼中是一个植物极定位的转录因子,但这种特异的定位却在小鼠中丢失;与斑马鱼MZ-vrtn突变体的轻微且可恢复正常的胚轴缺陷不同,小鼠vrtn突变体缺少哺乳类特有的脐带和胎盘,导致胚胎在E10.5天前死亡。这些显著差别使得vrtn成为一个极好的切入点去开展比较研究,为上述科学问题提供重要信息。本研究将进一步深入揭示vrtn在斑马鱼卵母细胞中定位的分子机制和Vrtn抑制转录的作用原理,并将站在进化的角度从基因功能和下游调控网络两个方面对斑马鱼vrtn和小鼠同源基因进行比较研究,以期揭示vrtn调节这两种模式生物早期胚胎发育的功能和分子机制,并探索该基因的下游调控网络在进化中的改变。

结项摘要

由鱼类到哺乳类早期发育的调控策略发生了重大改变,从依赖定位的母源因子转变为主要依靠组织或细胞之间的相互作用。因此,古老定位因子的功能和分子机制在这个重大变化的背景下是否发生改变,发生了怎样的改变,这个有趣的科学问题仍然没有任何答案。vrtn的转录物在斑马鱼受精卵和早期胚胎中有特异的植物极定位,其小鼠同源基因的产物却丢失了这种定位;与斑马鱼MZ-vrtn突变体的轻度胚轴发育缺陷不同,小鼠vrtn突变体缺少哺乳类特有的关键胚外组织脐带和胎盘,导致胚胎在E10.5天前死亡。这些显著差别使得vrtn成为一个极好的切入点去开展比较研究,为上述科学问题提供重要信息。我们发现小鼠合子表达的vrtn通过控制身体后部特异表达的转录因子如Cdx4和Cdx2来控制身体后部的组织分化,其突变影响到尿囊芽的生成并抑制中胚层细胞的迁移过程。小鼠母源的vrtn缺失会导致不能排卵,提示母源的vrtn对小鼠卵子发育过程也是必需的。在斑马鱼体系中,我们发现了vrtn mRNA的定位基序,并且发现MZ-vrtn的轻度发育缺陷表型随着传代会被矫正回来,说明斑马鱼中vrtn的表型很有可能是遗传补偿后的结果。进一步研究表明,补偿后vrtn突变体虽然没有表现出任何发育缺陷,其转录组发生了大规模重塑,有1/3左右的基因表达发生了明显的上下调。我们用条件性敲除的方法在卵母细胞双线期敲除vrtn,结果发现母源突变胚胎不能产出,类似于小鼠vrtn的母源突变体。这些结果提示斑马鱼的vrtn功能很可能是保守的,但是其突变后会引发强烈的遗传补偿效应,掩盖其本身的功能。而由于vrtn没有旁系同源基因,这种转录补偿效应明显区别于依赖于同源基因上调的“转录适应“。因此本研究引出了一系列重要的科学问题,一是在斑马鱼体系中,vrtn的突变为什么会引发遗传补偿,其背后的机制是什么?二是斑马鱼vrtn的功能是否实际上与小鼠的同源基因功能是保守的?这些重要科学问题值得进一步研究。在支持这些研究工作外,本课题还支持了RNA结合蛋白Rbm24功能的研究和建立快速获取母源突变体的方法学研究,相关研究结果发表在PNAS和Science Advances等知名期刊上。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Rapid generation of maternal mutants via oocyte transgenic expression of CRISPR-Cas9 and sgRNAs in zebrafish.
通过斑马鱼卵母细胞转基因表达 CRISPR-Cas9 和 sgRNA 快速产生母体突变体
  • DOI:
    10.1126/sciadv.abg4243
  • 发表时间:
    2021-08
  • 期刊:
    Science advances
  • 影响因子:
    13.6
  • 作者:
    Zhang C;Lu T;Zhang Y;Li J;Tarique I;Wen F;Chen A;Wang J;Zhang Z;Zhang Y;Shi DL;Shao M
  • 通讯作者:
    Shao M
Rbm24 controls poly(A) tail length and translation efficiency of crystallin mRNAs in the lens via cytoplasmic polyadenylation
Rbm24 通过细胞质聚腺苷酸化控制晶状体中晶状体蛋白 mRNA 的 Poly(A) 尾长和翻译效率
  • DOI:
    10.1073/pnas.1917922117
  • 发表时间:
    2020-03-31
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Shao, Ming;Lu, Tong;Shi, De-Li
  • 通讯作者:
    Shi, De-Li
The Adaptor Protein Lurap1 Is Required for Cell Cohesion during Epiboly Movement in Zebrafish.
斑马鱼外延运动过程中细胞凝聚需要接头蛋白 Lurap1
  • DOI:
    10.3390/biology10121337
  • 发表时间:
    2021-12-16
  • 期刊:
    Biology
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Li JT;Cheng XN;Zhang C;Shi DL;Shao M
  • 通讯作者:
    Shao M
Syne2b/Nesprin-2 Is Required for Actin Organization and Epithelial Integrity During Epiboly Movement in Zebrafish.
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  • DOI:
    10.3389/fcell.2021.671887
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in cell and developmental biology
  • 影响因子:
    5.5
  • 作者:
    Li YL;Cheng XN;Lu T;Shao M;Shi DL
  • 通讯作者:
    Shi DL

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邵明的其他基金

双链RNA在早期胚胎中诱发新型应激状态的机理研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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