长期增温对淡水浮游细菌功能基因多样性和代谢潜力的影响

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500376
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0306.生态系统生态学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Climate warming is a serious threat in the maintaining of freshwater ecosystems biodiversity. Bacterioplankton as the primary decomposers of freshwater ecosystems drive most of the geochemical cycle in the water bodies. However, due to the long-term lack of research tools and methods, the researches of freshwater bacterioplankton diversity in particular functional gene diversity is quite few compared to larger organisms, such as fish and aquatic plants. This project plans to operate an aquatic mesocosm ecosystems and simulate the climate warming tendency in situ. Environmental metagenomics, transcriptomics technologies and high-throughput functional GeoChip will be applied to analyze the influences of warming on freshwater bacterioplankton alpha and beta diversity, community metabolic potential, and their relationship with eutrophication of freshwater ecosystems. This project aims (1) to uncover the processes and the underlying mechanisms of bacterioplankton functional gene diversity in response to climate warming; (2) to illuminate the mechanisms by which climate warming influence the bacterioplankton community metabolic activity of carbon, nitrogen, phosphorus, sulfur and other elements in water bodies; (3) to reveal whether the responses of bacterioplankton community functional structure to long-term climate warming are dependent on the nutritional status of freshwater ecosystems. The results of this project will not only help understand how the whole freshwater ecosystems respond to climate warming, but will also provide important basic data and theoretical support for enriching the theoretical systems of freshwater ecology.
气候变暖正严重威胁着淡水生态系统中生物多样性的保持。浮游细菌作为淡水生态系统的主要分解者,驱动着水体大部分的地球化学循环过程。但由于研究手段和方法的长期匮乏,相比于大型生物,例如鱼类和水生植物,对淡水浮游细菌多样性特别是功能基因多样性的研究十分匮乏。本项目拟采用中宇宙试验系统和原位模拟气候变暖趋势结合的方法,应用环境宏基因组学、转录组学和功能基因芯片技术,通过比较长期增温影响下淡水浮游细菌功能基因alpha和beta多样性、代谢潜力及其与水体富营养化之间的关系,探讨淡水浮游细菌群落功能基因多样性对气候变暖的响应过程和机理;阐明气候变暖对浮游细菌碳、氮、磷、硫代谢潜力差异的影响机制;并揭示长期增温对浮游细菌群落功能基因结构的影响是否与水体的营养状况存在关系。本研究的结果将有助于深入了解淡水生态系统对全球变暖的响应机制,且为丰富淡水生态学的理论体系提供一定的基础数据和理论依据。

结项摘要

气候变暖正严重威胁着水生生态系统中生物多样性的保持。浮游细菌作为水生生态系统的主要分解者,驱动着水体大部分的生物地球化学循环过程。但到目前为止对水体浮游细菌多样性特别是功能基因多样性的研究十分匮乏。本项目采用中宇宙试验系统和原位模拟气候变暖趋势结合的方法,应用高通量测序、环境宏基因组学和功能基因芯片技术,研究全球变化(水体增温)和人类活动(如:大量营养盐的输入)引起的环境问题-微生物结构与功能响应-水体地球化学循环之间的互作关系,探讨水域微生物群落结构和功能对全球变化和水体富营养化的响应过程和机理。我们研究发现无论是长期增温还是水体营养负荷的增加均没有显著改变水体浮游细菌群落分类组成的alpha多样性,然而长期增温和营养盐添加的联合作用却显著增加了中宇宙系统中浮游细菌群落分类组成的beta多样性;尽管相对于随机聚集过程,环境过程在决定浮游细菌群落聚集过程中更为重要,但是长期增温和水体营养盐浓度的升高却显著增加了随机聚集过程的相对重要性。对水体浮游细菌群落功能基因组成的研究发现,增温和营养负荷增加的联合作用下,浮游细菌群落中C、N、P和S循环有关的所有基因的alpha多样性降低,浮游细菌群落中对易降解碳(例如淀粉和半纤维素)具有降解作用的基因的相对丰度明显增加,而对难降解碳(纤维素、几丁质、芳香族化合物和木质素)具有降解作用的基因的相对丰度却保持不变。综上所述,本研究发现在气候变暖和富营养化的联合作用下,水体浮游细菌群落会变得更加不稳定且其会丧失某些生态功能,这势可能会威胁到整个水域生态系统的长期稳定。本研究的结果将有助于深入了解水生生态系统对全球变暖的响应机制,且为丰富水域生态学的理论体系提供一定的基础数据和理论依据。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
温度和营养盐水平对淡水浮游细菌群落结构的潜在影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    南京大学学报(自然科学)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈 祯;何 聃;任丽娟
  • 通讯作者:
    任丽娟
Warming and nutrient enrichment in combination increase stochasticity and beta diversity of bacterioplankton assemblages across freshwater mesocosms
变暖和营养富集相结合增加了淡水中生态系统浮游细菌组合的随机性和β多样性
  • DOI:
    10.1038/ismej.2016.159
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    The ISME Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    lijuan Ren;Dan He;Zhen Chen;Erik Jeppesen;Torben L Lauridsen;Martin Søndergaard;Zhengwen Liu;Qinglong L Wu
  • 通讯作者:
    Qinglong L Wu
Bacterioplankton Metacommunity Processes across Thermal Gradients: Weaker Species Sorting but Stronger Niche Segregation in Summer than in Winter in a Subtropical Bay
跨温度梯度的浮游细菌群落过程:亚热带海湾夏季的物种分类较弱,但生态位隔离比冬季更强
  • DOI:
    10.1128/aem.02088-18
  • 发表时间:
    2018-10
  • 期刊:
    Applied and Environmental Microbiology
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Ren Lijuan;Song Xingyu;He Dan;Wang Jianjun;Tan Melting;Xia Xiaomin;Li Gang;Tan Yehui;Wu Qinglong
  • 通讯作者:
    Wu Qinglong

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其他文献

新疆某地土壤中有效态钴提取法研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    安全与环境学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘丽娟;段晴枫;任丽娟;贾孟军;李玲
  • 通讯作者:
    李玲
螯合剂对镉在土壤和紫花苜蓿中积累的影响研究
  • DOI:
    10.13568/j.cnki.651094.2015.03.015
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    新疆大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    任丽娟;柴琳琳;郭昱;李玲
  • 通讯作者:
    李玲
液力对深孔加工刀具及工具的稳定作用
  • DOI:
    10.16567/j.cnki.1000-7008.2018.11.030
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    工具技术
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    于大国;王志伟;李瑞宣;任丽娟
  • 通讯作者:
    任丽娟
江苏潮滩湿地不同生境互花米草形态与生物量分配特征
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Journal of Ecology and Rural Environment
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    任丽娟;王国祥;仇乐;毛志刚;刘金娥;REN Li-juan1,2,WANG Guo-xiang1,2,QIU Le3,MAO Zhi-g;2.Jiangsu Key Laboratory of Environmental Change a;3.College of Life Science,Nanjing Normal Universit
  • 通讯作者:
    3.College of Life Science,Nanjing Normal Universit
盐胁迫对淡水浇灌互花米草种子的萌发及胚生长的效应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    植物研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    任丽娟;仇乐;王国祥;毛志刚;刘金娥;REN Li-Juan1,2 QIU Le3 WANG Guo-Xiang1,2 MAO Zhi-G;2.Jiangsu Key Laboratory of Environmental Change a;3.College of Life Science,Nanjing Normal Universit
  • 通讯作者:
    3.College of Life Science,Nanjing Normal Universit

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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