黑曲霉整合型细胞网络的构建和在柠檬酸代谢工程方面的应用

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30870574
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    孙际宾
  • 依托单位：
    中国科学院天津工业生物技术研究所
  • 学科分类：
    C0509.生物学过程与代谢
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

黑曲霉是一种重要工业微生物，在酶制剂、异源蛋白、柠檬酸等领域有重要的应用。近期黑曲霉基因组序列的公布拉开了通过系统生物学理解和改造黑曲霉的序幕。在前期工作的基础上，本研究致力于建立分区的、包含代谢网络和调控网络的高分辨率整合型黑曲霉通用细胞网络模型，发展整合型细胞网络的研究和应用方法，推动围绕黑曲霉的理论和应用研究。具体到柠檬酸生产上，通过应用细胞网络模型进行模拟分析，研究柠檬酸的高产机理，进行代谢工程改造并最终获得高性能的柠檬酸工业生产菌株。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（3）
专利数量（0）
黑曲霉作为细胞工厂:知识准备与技术基础
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    生物工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    郭艳梅;郑平;孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾
The 2008 update of the Aspergillus nidulans genome annotation: A community effort
构巢曲霉基因组注释的 2008 年更新：社区的努力
  • DOI：
    10.1016/j.fgb.2008.12.003
  • 发表时间：
    2009-03-01
  • 期刊：
    FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    Wortman, Jennifer Russo;Gilsenan, Jane Mabey;Turner, Geoffrey
  • 通讯作者：
    Turner, Geoffrey
Multi-objectiveMINLP Optimization Used to Identify Theoretical Gene Knockout Strategies for E. coli Cell
多目标 MINLP 优化用于确定大肠杆菌细胞的理论基因敲除策略
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Chem. Biochem. Eng
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾
黑曲霉产柠檬酸的发酵过程表征及乙醛酸的形成
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    现代食品科技
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    曾祥峰;郑平;郭艳梅;王昌禄;孙际宾;杨晓涛;满云
  • 通讯作者：
    满云
An extended bioreaction database that significantly improves reconstruction and analysis of genome-scale metabolic networks
扩展的生物反应数据库，可显着改善基因组规模代谢网络的重建和分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Integrative Biology
  • 影响因子：
    2.5
  • 作者：
    Zeng, An-Ping;Fekete, S;or P.;Sun, Jibin;Stelzer, Michael;Kamphans, Tom
  • 通讯作者：
    Kamphans, Tom

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其他文献

谷氨酸棒杆菌人工合成启动子文库的构建及应用
  • DOI：
    10.13345/j.cjb.210202
  • 发表时间：
    2021
  • 期刊：
    生物工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    刘莫识;刘娇;孙冠男;路福平;王钰;郑平;孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾
黑曲霉柠檬酸工业菌株原生质体制备与转化
  • DOI：
    10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.04.025
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    生物技术通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张晓立;郑小梅;满云;罗虎;于建东;郑平;刘浩;孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾
谷氨酸棒杆菌的代谢工程使能技术研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2020
  • 期刊：
    生物工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    王钰;郑平;孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾
琥珀酸脱氢酶或琥珀酰辅酶A合成酶缺失促进大肠杆菌积累5-氨基乙酰丙酸
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2013
  • 期刊：
    生物工程学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    蒲伟;陈久洲;孙村民;陈宁;孙际宾;郑平;马延和
  • 通讯作者：
    马延和
CRISPR-Cas9介导的基因组编辑技术的研究进展
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2015
  • 期刊：
    生物技术进展
  • 影响因子：
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  • 作者：
    郑小梅;张晓立;于建东;郑平;孙际宾
  • 通讯作者：
    孙际宾

其他文献

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孙际宾的其他基金

系统生物学方法解析黑曲霉生长与产物合成相关联的形态遗传网络
  • 批准号：
    31961133021
  • 批准年份：
    2019
  • 资助金额：
    200 万元
  • 项目类别：
    国际(地区)合作与交流项目
黑曲霉糖代谢途径中关键酶与小分子相互作用的系统研究
  • 批准号：
    31370113
  • 批准年份：
    2013
  • 资助金额：
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  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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