基于非血红素型双铁离子氨基氧化酶定向进化构建合成广谱亚硝基中间体的合成生物学元件

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901014
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    24.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2102.合成生物学与生物改造技术
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Nonheme diiron N-oxygenases catalyze various amine oxidization, and are key metalloenzymes in both primary and secondary metabolism. Up to now, there is only few nonheme diiron N-oxygenases reported, most of which oxidize amine substrates to nitro products. Amine oxidization produces nitroso group and hydroxylamine as well, both of which are powerful synthons in the synthesis of various nitrogen containing bonds and heterocycles. However, there is no broad-substrates-range nitroso producing enzyme reported yet. In previous study, we have discovered a new nonheme diiron N-oxygenase AzoC, which can oxidize amine to nitroso products. Unfortunately, AzoC has a sharp substrates specificity, and it is unsuitable for the direct use in synthetic biology as biological part. Meanwhile, the canonical nonheme diiron N-oxygenase AurF can catalyze the oxidization of amine to nitro with a broad substrates range. Hence, AurF and AzoC are complimentary in catalytic activity and substrates specificity. Therefore, this project is designed for the directed evolution of AzoC and AurF with DNA-Shuffling method, and aims at constructing a new biological part for the oxidization of broad range amine substrates to nitroso intermediates. This study will provide a model for the directed evolution of nonheme diiron N-oxygenase, and will expand their use in synthetic biology.
非血红素型双铁离子氨基氧化酶催化与氨基相关的一系列氧化反应,是初级代谢以及次级代谢中重要的金属酶。目前已报道的该类酶大多氧化氨基为硝基。除了硝基之外,氨基氧化还可以产生亚硝基、羟胺等中间体。这些中间体是合成多种含氮基团和含氮杂环的重要合成子。迄今为止,尚无氧化广谱氨基底物为亚硝基的氨基氧化酶报道。前期研究中,我们发现了一个新的非血红素型双铁离子氨基氧化酶AzoC,其可氧化原生底物为亚硝基。但是,AzoC的底物谱窄,不适合直接开发为合成生物学元件。此类酶中的经典酶AurF虽然氧化氨基为硝基,但底物谱宽,与AzoC具有功能和底物谱上的互补性。因此,本项目拟以AzoC及AurF为亲本,利用DNA-Shuffling定向进化技术对二者底物谱和活性进行扩展,构建可氧化广谱氨基底物为亚硝基的新功能合成生物学元件,为非血红素型双铁离子氨基氧化酶的定向进化提供方法基础,并扩展此类酶的合成生物学应用空间。

结项摘要

本项目利用定点突变技术结合酶的理性设计理念,构建了两代可氧化广谱苯胺类底物为亚硝基中间体的生物合成元件(AzoC-II及AzoC-III),证明了理性设计策略可用于非血红素型双铁离子氨基氧化酶的底物谱改造,为此类酶的定向进化提供了科学基础。.此外,本项目还利用构建的合成生物学元件,结合组合生物合成理念,设计了两条新的生物合成通路。构建的新生物合成通路1,利用AzoC-II为生物催化剂,以对位及间位取代的苯胺类化合物为底物合成亚硝基中间体,以不同骨架的酚类为亚硝基受体,构建了酚类化合物的芳环C-H键活化新方法,并生物合成了一系列具有抗HIV及抗阿兹海默症活性的联二芳胺类活性分子。构建的新生物合成通路2,利用AzoC-III为催化剂,以邻位、间位及对位取代的苯胺类化合物为底物合成亚硝基中间体,以间苯三酚为亚硝基受体,利用底物设计、反应条件优化等方式构建了生物催化的苯环缩环反应新方法,生物合成了一系列具有抗癌活性的二氨基取代环戊二酮烯活性分子。.项目执行期间,发表论文5篇,含2篇Nature Communications(Nature子刊,中科院一区TOP,IF:17.694),1篇ACS Catalysis(中科院一区TOP,IF:13.7)2篇Chemical Communications(中科院二区TOP,IF:6.065);,受理发明专利1项。此外,还有2篇文章正在投寄以及准备投寄。.综上所述,本项目圆满完成了计划规定的任务,达到了预期目标。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Chemoenzymatic Synthesis of Phenol Diarylamine Using Non-Heme Diiron N-Oxygenase
使用非血红素二铁 N-加氧酶化学酶法合成苯酚二芳胺
  • DOI:
    10.1021/acscatal.2c05190
  • 发表时间:
    2023-01-09
  • 期刊:
    ACS CATALYSIS
  • 影响因子:
    12.9
  • 作者:
    Guo, Yuan-Yang;Tian, Ze-Hua;Li, Yong-Quan
  • 通讯作者:
    Li, Yong-Quan
Molecular mechanism of azoxy bond formation for azoxymycins biosynthesis
阿佐霉素生物合成中偶氮键形成的分子机制
  • DOI:
    10.1038/s41467-019-12250-1
  • 发表时间:
    2019-10-08
  • 期刊:
    NATURE COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Guo, Yuan-Yang;Li, Zhen-Hua;Li, Yong-Quan
  • 通讯作者:
    Li, Yong-Quan
Site-specific unnatural base excision via visible light
通过可见光进行位点特异性非自然碱基切除
  • DOI:
    10.1039/d2cc03664a
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Yuan-Yang Guo;Rujie Zhang;Bianbian Huo;Luying Wang;Donghe Yuan;Jingsi Bai;Honglei Wang;Gongming Zhu;Xiguang Zhang;Anlian Zhu;Tingjian Chen;Lingjun Li
  • 通讯作者:
    Lingjun Li
An efficient and easy-accessible ligand for bioconjugation Cu(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition bioconjugation
一种高效且易于获得的生物共轭配体 Cu(I) 催化的叠氮化物-炔环加成生物共轭
  • DOI:
    10.1039/d0cc06348g
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Chemical Communications
  • 影响因子:
    4.9
  • 作者:
    Yuan-yang Guo;Bo Zhang;Luying Wang;Shenlong Huang;Shilei Wang;Yanbo You;Gongming Zhu;Anlian Zhu;Mingwei Geng;Lingjun Li
  • 通讯作者:
    Lingjun Li
Nitric oxide as a source for bacterial triazole biosynthesis
一氧化氮作为细菌三唑生物合成的来源
  • DOI:
    10.1038/s41467-020-15420-8
  • 发表时间:
    2020-03-31
  • 期刊:
    NATURE COMMUNICATIONS
  • 影响因子:
    16.6
  • 作者:
    Zhao, Guiyun;Guo, Yuan-Yang;Du, Yi-Ling
  • 通讯作者:
    Du, Yi-Ling

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

其他文献

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊:
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子:
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败,请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题,我已根据课题信息分析并撰写以下内容,帮您拓宽课题思路:

AI项目思路

AI技术路线图

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号:
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份:
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额:
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别:
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
关闭
close
客服二维码