烟粉虱全基因组性别决定相关基因的精准注释及功能验证

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31871970
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    60.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1402.农业昆虫学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Whitefly is an important worldwide agricultural pest employing haploid-diploid life cycle. Elucidating sex determination genes’ (SDGs) molecular cascade interactions, lay a foundation for understanding the sex determination/differentiation mechanisms and further sex genetic manipulation in this robust pest. Previously we have found that dsx is associated with sex determination in B. tabaci. Dsx and tra2 affect each other and both genes play a key role in forming the male genitalia, but regulating dsx’s major gene is unknown. This foundation aim to identify all SDGs in B.tabaci based on our previous published whitefly genome- and transcriptome-wide database, find all alternative splicing forms in female and male and sex biased expression for each SDG by our RNAseq pipeline combined with qPCR method, clarify the influence of silencing dsx and other SDGs to adult body and female reproductive capacity, and elucidate SDGs-dsx molecular cascade interaction in whitefly. This project from two aspects of biology influence after dsx or SDGs' silencing and SDGs-dsx molecular cascade interactions, elaborate the relationship between SDGs-dsx molecular cascade interaction and whitefly sex determination mechanism, ultimately provide new ideas for controlling this pest.
烟粉虱是世界性的重要农业害虫。研究烟粉虱性别决定基因的分子级联互作可为明确其性别决定机制,性别分化机制以及遗传操作奠定基础。前期我们在烟粉虱中鉴定到dsx,tra2和psi三个性别决定基因,发现干扰tra2对dsx丰度变化及成虫性征有影响,但却没有找到上游调控性征开关基因dsx的主效基因。本项目,拟利用烟粉虱基因组和转录组注释信息,完成烟粉虱性别决定通路基因的精准注释及克隆验证;利用RNAseq测序和定量PCR技术,明确烟粉虱所有性别决定通路基因(SDGs)的性特异可变剪切以及定量表达;观察干扰沉默重要SDGs后烟粉虱形体形态变化和雌虫繁殖能力变化;阐明重要SDGs与dsx的分子级联互作。从全基因组水平的SDGs注释和重要SDGs和dsx的分子互作关系两个方面,阐明烟粉虱性别决定机制中重要功能基因之间的级联互作与烟粉虱性别决定机制之间的关系,最终为有效控制烟粉虱提供新思路。

结项摘要

烟粉虱是世界性的重要农业害虫。研究烟粉虱性别决定基因的分子级联互作可为明确其性别决定机制,性别分化机制以及遗传操作奠定基础。前期我们在烟粉虱中鉴定到dsx,tra2和psi三个性别决定基因,发现干扰tra2对dsx丰度变化及成虫性征有影响,但却没有找到上游调控性征开关基因dsx的主效基因。本项目首先完成了26个烟粉虱性别决定基因的基因组注释,接着阐明了部分重要烟粉虱性别决定基因的结构及剪接模式;揭示了重要性别决定基因在烟粉虱不同龄期不同性别间的表达量差异;通过RNAi干扰技术,揭示了重要烟粉虱性别决定基因的性别功能,并提出了关于烟粉虱性别决定级联调控通路初级模型的猜想。研究结果对于揭示烟粉虱性别决定级联调控的分子机理及控制烟粉虱的持续扩散危害具有重大理论及实际意义。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Genome‐wide dissection of sex determination genes in the highly invasive whitefly species Bemisia tabaci Q/ MED
高入侵性粉虱物种烟粉虱 Q/ MED 中性别决定基因的基因组广泛剖析
  • DOI:
    10.1111/imb.12568
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Insect Molecular Biology
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Yating Liu;Wen Xie;Litao Guo;Xin Yang;Jinjian Yang;Shaoli Wang;Qingjun Wu;Xuguo Zhou;Youjun Zhang
  • 通讯作者:
    Youjun Zhang
A Chemosensory Protein BtabCSP11 Mediates Reproduction in Bemisia tabaci
化学感应蛋白 BtabCSP11 介导烟粉虱的繁殖
  • DOI:
    10.3389/fphys.2020.00709
  • 发表时间:
    2020-06-30
  • 期刊:
    FRONTIERS IN PHYSIOLOGY
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Zeng,Yang;Merchant,Austin;Zhang,Youjun
  • 通讯作者:
    Zhang,Youjun
Chromosome-level genome assembly of the greenhouse whitefly (Trialeurodes vaporariorum Westwood)
温室粉虱(TrialeurodevaporariorumWestwood)的染色体水平基因组组装
  • DOI:
    10.1111/1755-0998.13159
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES
  • 影响因子:
    7.7
  • 作者:
    Xie Wen;He Chao;Fei Zhangjun;Zhang Youjun
  • 通讯作者:
    Zhang Youjun
昆虫性别决定级联的研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    昆虫学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘雅婷等
  • 通讯作者:
    刘雅婷等
Characteristic and Functional Study of Intersex, a Gene Related to Female Fertility in Bemisia tabaci
烟粉虱雌性生育力相关基因Intersex的特性及功能研究
  • DOI:
    10.3389/fphys.2020.00055
  • 发表时间:
    2020-02-25
  • 期刊:
    FRONTIERS IN PHYSIOLOGY
  • 影响因子:
    4
  • 作者:
    Liu, Yating;Yang, Jinjian;Zhang, Youjun
  • 通讯作者:
    Zhang, Youjun

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  • 通讯作者:
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月桂烯驱动Q烟粉虱趋向选择带毒番茄的分子机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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