LpPLT1在华北落叶松体细胞胚胎发生中的功能及表达调控机制

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901289
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1605.树木生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Somatic embryogensis (SE) is a crucial tool for large-scale propagation , and also a model system for studying cell reprogramming and embryo development in conifers. In our previous study, PLT1 was identified to play an important role in the embryogenic capacity determination in early somatic embryogenesis in conifers. For further study, we will investgate the function of LpPLT1 in SE in Larix principis-rupprechtii Mayr and identify genes that respond to the overexpression of LpPLT1. Then, we will determine the temporal-spatial expression pattern of LpPLT1. Finally, we will explore whether DNA methylation and histone modification including H3K27me3 and H3K9ac are involve in the expression regulation of LpPLT1. In the course of the investigation, some important methods including gene overexpression, RNA interference, RNA in-situ hybridization, bisulfite sequencing PCR and CHIP-qPCR will be used with the aim to uncover the function and the gene expression regulation mechanism of LpPLT1 in SE in L.principis-rupprechtii Mayr.This study will provide new evidence for SE molecular study and lay the foundation for innovation and development of SE technology in conifers.
体细胞胚胎发生是针叶树规模化繁殖的重要途径,也是针叶树体细胞重编程及胚胎发育研究的模式系统。我们前期研究发现,PLT1很可能是针叶树体胚发生早期细胞胚性能力决定的重要调控因子。为了进一步探究PLT1在针叶树体胚发生中的作用机制,本项目拟以华北落叶松为研究对象,着重开展以下研究:(1)鉴定LpPLT1在华北落叶松体胚发生过程中的功能,挖掘PLT1的协同作用因子;(2)解析LpPLT1的在体胚发生不同组织中的时空表达特征;(3)明确DNA甲基化、H3K27me3与H3K9ac组蛋白修饰对LpPLT1的表达调控作用。本项目旨在通过超量表达、RNA干涉、RNA原位杂交、BSP克隆测序、CHIP-qPCR等技术方法的综合联用,阐明PLT1在针叶树体胚发生中的功能及表达调控机制。从而为以华北落叶松为代表的针叶树体胚发生的分子机理研究提供新的证据,也为针叶树体胚发生技术的创新发展奠定理论基础。

结项摘要

体细胞胚胎发生是针叶树规模化繁殖的重要途径,也是针叶树体细胞重编程及胚胎发育研究的模式系统。我们前期研究发现,PLT1很可能是针叶树体胚发生早期细胞胚性能力决定的重要调控因子。为了进一步探究PLT1在针叶树体胚发生中的作用机制,本项目在建立优化华北落叶松体胚发生技术体系的基础上,克隆LpPLT1基因的CDS全长及启动子序列,预测发现其启动子含有脱落酸、茉莉酸、赤霉素的植物激素顺式作用元件,表明该基因可能受到多种激素信号的协同调控。利用qRT-PCR检测发现LpPLT1在不同发育阶段体胚中特异性表达,并且子叶胚中高于胚性愈伤,表明LpPLT1可能在体胚发生后期发挥调控作用。基于农杆菌介导的遗传转化,筛选获得LpPLT1过表达细胞系15个,其中最高表达提高20倍;组织学观察发现,相比于同发育时期的野生型及空载株系,过表达细胞系组织胚头及胚柄细胞核大且致密,具有胚性能力提高的表型特征。对野生型与过表达细胞系开展RNA-seq分析,发现响应基因主要富集到植物激素信号转导、胁迫响应等通路,同时其高表达引起WOX、MYB、AGL等体胚发生发育相关转录因子的强烈表达响应,表明LpPLT1可能与其它转录因子协同作用响应或靶向调控植物激素信号。本项目研究结果为以华北落叶松为代表的针叶树体胚发生的分子机制研究提供了新的证据。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Cryo-Treatment Enhances the Embryogenicity of Mature Somatic Embryos via the lncRNA-miRNA-mRNA Network in White Spruce.
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  • DOI:
    10.3390/ijms23031111
  • 发表时间:
    2022-01-20
  • 期刊:
    International journal of molecular sciences
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Gao Y;Cui Y;Zhao R;Chen X;Zhang J;Zhao J;Kong L
  • 通讯作者:
    Kong L
Efficient Multi-Sites Genome Editing and Plant Regeneration via Somatic Embryogenesis in Picea glauca.
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  • DOI:
    10.3389/fpls.2021.751891
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Frontiers in plant science
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Cui Y;Zhao J;Gao Y;Zhao R;Zhang J;Kong L
  • 通讯作者:
    Kong L
Plant Regeneration via Somatic Embryogenesis in Larix principis-rupprechtii Mayr
华北落叶松体细胞胚胎发生的植物再生
  • DOI:
    10.3390/f12101335
  • 发表时间:
    2021-10-01
  • 期刊:
    FORESTS
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Jiang, Shuaifei;Chen, Xiaoyi;Zhang, Jinfeng
  • 通讯作者:
    Zhang, Jinfeng

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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