真菌纤维素酶与木质素非产出性吸附的分子机理研究及纤维素酶的改造

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31870785
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0505.蛋白质、多肽与酶生物化学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The development of lignocellulosic ethanol industry in China has a strategic importance for better energy security, lower air pollution, and a sustainable model for economic development. During the saccharification process of lignocelluloses, lignin present in the biomass results in a hampered enzymatic hydrolysis owe to the cellulase-lignin non-productive binding. The engineering of cellulases by reducing the non-productive binding to lignin is a potential method for increasing the conversion efficiency of cellulose in the biomass. In this project, the fusion protein of CBM (carbohydrate-binding module) and GFP will be constructed, the system for measuring the change of cellulase/lignin adsorption will be established and correlations between properties of amino acid residue at different sites in enzyme and lignin will be investigated. Furthermore, a new hypothesis will be studied that surface charges on CBM of cellulase have a significant effect on the cellulase-lignin non-productive binding. Based on the mechanisms of adsorption/desorption of cellulolytic enzyme onto/from lignin, technology of cellulase engineering will be developed and a new generation cellulase that increases the activity and reduces the cellulase-lignin non-productive binding will be prepared for improving the hydrolysis efficiency of lignocellulosic biomass.
在木质纤维素生物降解过程中,当木质素存在的情况下,木质素与纤维素酶会发生非产出性吸附,从而显著降低纤维素酶的水解效率。通过蛋白质工程等技术改造纤维素酶蛋白质结构,以减少木质素的抑制作用提高纤维素转化率,是当今国际上研究的热点。研究证明,纤维素酶结合结构域(CBM)和木质素发生吸附是造成纤维素酶失活的主要原因。本项目拟构建“荧光蛋白-纤维素酶CBM”融合蛋白突变体库,同时建立吸附度变化快速测量体系,从而筛选出和木质素吸附的纤维素酶关键氨基酸残基,从蛋白结构基础在分子水平揭示纤维素酶与木质素吸附-解吸附动态过程中的科学规律,并验证我们的新假说“纤维素酶CBM表面电荷与木质素非产出性吸附直接相关”,为理性设计纤维素酶提供坚实的基础理论平台。基于该理论,蛋白质工程精细改造纤维素酶CBM,研制木质素低吸附且高效降解秸秆的新型纤维素酶,并在预处理后的秸秆原料中验证,推动木质纤维素生物炼制产业的发展。

结项摘要

木质纤维素在酶解的过程中,木质素和纤维素酶之间会发生非产出性吸附,导致部分纤维素酶的失活,严重降低了木质纤维素的水解效率。纤维素酶的碳水化合物结合结构域(Carbohydrate binding module,CBM)被证明在纤维素酶与木质素之间非产出性吸附中起了重要的作用。.本研究构建了快速荧光检测(RFD)系统,利用该系统,与吐温或PEG相比,阳离子添加剂DTAB或polyDADMAC的添加大大提高了纤维素/木质素的分配系数,减少了木质素和纤维素酶之间的非产出性吸附,提高了木质纤维素的水解效率。polyDADMAC和DTAB的加入提高了Avicel和木质素混合物释放的葡萄糖产量,降低了木质素的抑制率。我们证实,木质素疏水性的降低和zeta电位的增加共同有助于抑制木质素的非产出性吸附,特别是,结果证明添加添加剂后木质素的zeta电位值与Avicel/木质素的分配系数具有良好的相关性,表明静电作用在纤维素酶对木质素的吸附中起着至关重要的作用。此外,我们对里氏木霉Cel7A进行了蛋白质工程改造。通过增加CBM表面的负电荷密度,促使Cel7A和木质素之间发生排斥,提高了CBM在纤维素吸附速率/木质素吸附速率的分配系数,降低了CBM与木质素之间的非产出性吸附。结果表明,当底物中存在木质素时,S14D/S21D/T24D变体的糖化效率提高。.本项目中,我们用坚实的数据证明我们提出新的假说,即纤维素酶CBM上的表面电荷对纤维素酶-木质素非产出性吸附有显着影响。并且基于这个纤维素酶对木质素的吸附/解吸机理,开发了新型纤维素酶。这个机理和技术,为制备新一代纤维素酶,提高纤维素酶-木质素非生产性结合的活性,减少纤维素酶-木质素非生产性结合,提高木质纤维素生物质的转化,提供了坚实的理论基础。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Driving an in vitro multienzymatic cascade of laminaribiose biosynthesis from non-food cellulose with balancing the precursor supply
通过平衡前体供应,驱动非食品纤维素生物合成海带二糖的体外多酶级联
  • DOI:
    10.1016/j.indcrop.2022.114878
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Industrial Crops & Products
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Zhiqiang Du;Yinshuang Tan;Kangle Niu;Xu Fang
  • 通讯作者:
    Xu Fang
Effect of Fe2+ addition on anammox consortia, nitrogen removal performance and functional genes analysis during start-up of anammox process
Fe2+添加对厌氧氨氧化菌群的影响、厌氧氨氧化工艺启动过程中脱氮性能及功能基因分析
  • DOI:
    10.1016/j.jwpe.2021.102251
  • 发表时间:
    2021-10-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF WATER PROCESS ENGINEERING
  • 影响因子:
    7
  • 作者:
    Sindhu, Lara;Niu, Kangle;Fang, Xu
  • 通讯作者:
    Fang, Xu
Precision Engineering of the Transcription Factor Cre1 in Hypocrea jecorina (Trichoderma reesei) for Efficient Cellulase Production in the Presence of Glucose
红褐肉座菌(里氏木霉)转录因子 Cre1 的精密工程,可在葡萄糖存在下高效生产纤维素酶
  • DOI:
    10.1101/2020.03.08.982249
  • 发表时间:
    2020-03
  • 期刊:
    Frontiers in Bioengineering and Biotechnology
  • 影响因子:
    5.7
  • 作者:
    Lijuan Han;Yinshuang Tan;Wei Ma;Kangle Niu;Shaoli Hou;Wei Guo;Yucui Liu;Xu Fang
  • 通讯作者:
    Xu Fang
Identification of a thermostable fungal lytic polysaccharide monooxygenase and evaluation of its effect on lignocellulosic degradation
热稳定性真菌多糖单加氧酶的鉴定及其对木质纤维素降解的影响评价
  • DOI:
    10.1007/s00253-019-09928-3
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Applied Microbiology and Biotechnology
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Ruiqin Zhang;Yucui Liu;Yi Zhang;Dan Feng;Shaoli Hou;Wei Guo;Kangle Niu;Yi Jiang;Lijuan Han;Lara Sindhu;Xu Fang
  • 通讯作者:
    Xu Fang
Exploring the Relationship Between Clostridium thermocellum JN4 and Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum GD17
探讨热纤梭菌 JN4 与热解糖热厌氧杆菌 GD17 之间的关系
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2019.02035
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Frontiers in Microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Wang Fangzhong;Wang Mingyu;Zhao Qi;Niu Kangle;Liu Shasha;He Didi;Liu Yan;Xu Shiping;Fang Xu
  • 通讯作者:
    Fang Xu

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生物质降解酶生产菌株的育种和应用
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  • 通讯作者:
    方诩
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    2017
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    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    方诩

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AA9家族裂解多糖单加氧酶(LPMOs)协同降解纤维素的分子机制及其蛋白质工程
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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