模式生物秀丽线虫中NRDE通路介导的siRNA基因干扰的机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31171254
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    70.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

RNA干扰是真核生物中一个非常广泛而且保守的基因调节机制。早期的试验已经成功地表明小RNA 可以用来抑制癌基因和病毒基因的表达。然而,在小RNA被用于临床和制药之前,我们必须正确地了解小RNA的产生机理,作用机制和体内功能等。模式生物秀丽线虫中NRDE通路转运siRNA从细胞质到细胞核并抑制转录的延伸,从而缄默基因表达。然而,NRDE蛋白和siRNA如何抑制RNA聚合酶II以及如何造成组蛋白的甲基化尚不清楚。本项目将围绕以上问题,进一步研究模式生物秀丽线虫中siRNA 调控基因表达的作用方式,通过遗传筛选的办法来寻找调控核RNA干扰的关键因子以及研究它们作用的分子机理。这项研究有助于我们更深入地了解RNA干扰造成生长和生殖缺陷的原因和机理。从而不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。

结项摘要

项目背景:.RNA干扰是一个非常广泛而且保守的基因调节机制。小调节性RNA广泛存在于几乎所有的真核细胞中,参与和调节许多基本的生命过程。RNA干扰技术的发现是近十年来生命科学研究的重大突破之一,不仅在加深人类生命过程的认识有巨大的影响,而且使我们在干预生命过程方面有了一个非常方便的手段。然而,在小RNA被用于临床和制药之前,我们必须更深入地了解小 RNA 的产生机理,运输途径,作用专一性,和体内功能等。..主要研究内容:本课题重点研究了模式生物秀丽线虫中小干扰 RNA调控基因表达的作用机制,通过遗传、分子、细胞和生化等手段来寻找和研究调控细胞核RNA干扰的关键因子。分离了新的核RNA干扰的突变体;克隆了突变体基因;获得了突变体基因在亚细胞结构上的定位;分析了这些基因是否可以在非编码RNA的诱导下和前RNA以及染色质结合;研究了核RNA干扰在生长和生殖上的生理功能。..重要结果:..在本课题的支持下,我们得到了以下几项结果:..建立了秀丽线虫中研究非编码RNA干扰的错靶现象的模型,发现RNA干扰造成的错靶过程依赖于RdRP和核RNA干扰通路;发现小RNA可以诱导靶基因的组蛋白3赖氨酸27的3甲基化。..建立了秀丽线虫中使用CRISPR/Cas9技术进行大片段基因敲除的方法;建立了使用CRISPR/Cas9技术诱导染色体易位和构造平衡子的方法。..同时,我们还与合作实验室解析了非编码RNA介导基因干扰的遗传通路,发现了NRDE-1;发现秀丽线虫中非编码小干扰RNA诱导靶标位点及其附近区域的组蛋白3赖氨酸9的3甲基化。..在项目的支持下,以本实验室为独立单位发表SCI研究论文4篇(Current Biology, 2015; Genetics, 2014, 2015; Scientific Reports, 2014),应邀撰写综述3篇。与其它实验室合作发表研究论文2篇(PLoS Genetics, 2011; Nature Genetics, 2012)。毕业硕士1名。..科学意义:.RNA干扰是真核生物中一个非常广泛而且保守的基因调节机制。本项目进一步研究了模式生物秀丽线虫中siRNA 调控基因表达的作用方式,寻找调控核RNA干扰的关键因子以及研究它们作用的分子机理。这项研究不仅对理解RNA的基础生物学有重要意义,而且有助于更好地将小RNA干扰技术用于研究和临床治疗。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Nuclear RNAi contributes to the silencing of off-target genes and repetitive sequences in Caenorhabditis elegans.
核 RNAi 有助于沉默秀丽隐杆线虫中的脱靶基因和重复序列。
  • DOI:
    10.1534/genetics.113.159780
  • 发表时间:
    2014
  • 期刊:
    Genetics
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Zhou Xufei;Xu fei;Mao Hui;Ji Jiaojiao;Meng Ying;Feng Xuezhu;Guang Shouhong
  • 通讯作者:
    Guang Shouhong
Small RNAs, RNAi and the Inheritance of Gene Silencing in Caenorhabditis elegans
秀丽隐杆线虫中的小 RNA、RNAi 和基因沉默的遗传。
  • DOI:
    10.1016/j.jgg.2012.12.007
  • 发表时间:
    2013-04-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF GENETICS AND GENOMICS
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Feng, Xuezhu;Guang, Shouhong
  • 通讯作者:
    Guang, Shouhong
Targeted Chromosomal Translocations and Essential Gene Knockout Using CRISPR/Cas9 Technology in Caenorhabditis elegans
使用 CRISPR/Cas9 技术对秀丽隐杆线虫进行靶向染色体易位和必需基因敲除。
  • DOI:
    10.1534/genetics.115.181883
  • 发表时间:
    2015-12-01
  • 期刊:
    GENETICS
  • 影响因子:
    3.3
  • 作者:
    Chen, Xiangyang;Li, Mu;Guang, Shouhong
  • 通讯作者:
    Guang, Shouhong
chinese worm community made delightly wiggles in Hefei September 6 to September 8, 2013
2013年9月6日至8日,中国蠕虫社区在合肥欢腾起来
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Science China Life Sciences
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ge Shan;shouhong guang
  • 通讯作者:
    shouhong guang
Amplification of siRNA in Caenorhabditis elegans generates a transgenerational sequence-targeted histone H3 lysine 9 methylation footprint.
秀丽隐杆线虫中 siRNA 的扩增产生跨代序列靶向组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化足迹。
  • DOI:
    10.1038/ng.1039
  • 发表时间:
    2012-01-08
  • 期刊:
    NATURE GENETICS
  • 影响因子:
    30.8
  • 作者:
    Gu, Sam Guoping;Pak, Julia;Guang, Shouhong;Maniar, Jay M.;Kennedy, Scott;Fire, Andrew
  • 通讯作者:
    Fire, Andrew

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其他文献

RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi pathway
RdRP 合成的反义核糖体 siRNA 通过核 RNAi 途径沉默前 rRNA
  • DOI:
    10.1038/nsmb.3376
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Nature Structural & Molecular Biology
  • 影响因子:
    16.8
  • 作者:
    Xufei Zhou;Xuezhu Feng;Hui Mao;Mu Li;Fei Xu;Kai Hu;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红
靶向基因编辑技术在秀丽隐杆线虫中的应用
  • DOI:
    10.1360/n052017-00250
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    中国科学 : 生命科学 .
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈向阳;冯雪竹;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红
细胞核内小干扰RNA介导的表观遗传和基因表达调控
  • DOI:
    10.1360/n052016-00335
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国科学: 生命科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冯雪竹;光寿红
  • 通讯作者:
    光寿红

其他文献

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    2018
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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