线虫全基因组RNA干扰筛选氧化还原调控相关的新基因

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31500693
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2104.共性生物技术
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Redox balance is closely related to the processes of cell growth, development, differentiation and aging. Therefore, the mechanism of redox regulation is an important problem in the biological and medical research. Although there are some genes reported to function in redox regulation, it is still not clear how cells maintain and regulate the redox balance in vivo and which genes are involved in the redox network, especially lacking of systematic research. The main content of this project is to accomplish a whole genome RNAi screening using the COPAS biosort flow cytometer with redox-sensitive fluorescent protein probe mt-Grx1-roGFP2, based on a classic model organism – Caenorhabditis elegans. This study will be a high-throughput systematic research for the redox regulation related genes. The aim is to identify and verify new candidate genes related to glutathione regulation. On the basis, further study will focus on the function and molecular mechanism investigation of the new candidates in regulating mitochondrial redox. This study will not only implement the combination of the redox-sensitive probes and high-throughput whole genome screening technique, but also provide the basis to reveal the mechanism of cellular redox regulation. There is very important significance in the redox research field.
细胞氧化还原平衡调控与细胞生长、发育、分化以及衰老等过程密切相关。因此氧化还原调控是生物学和医学领域研究的重要问题,虽然已有一些氧化还原调控基因被发现,但细胞内源氧化还原平衡如何维持与调控,哪些基因参与调控还远不清楚,尤其缺乏系统性研究。本项目的主要内容是以秀丽隐杆线虫这一经典模式生物为模型,结合特异感知线粒体氧化还原变化的荧光探针mt-Grx1-roGFP2,利用流式线虫仪为主要检测手段进行全基因组RNAi筛选,对氧化还原调控相关基因进行高通量系统性的研究。目的是发现参与谷胱甘肽氧化还原调控的新基因并进行验证,然后进一步确定新基因在线粒体氧化还原调控中的功能及分子机制。本研究不仅实现了氧化还原敏感探针与全基因组高通量筛选的有机结合,同时氧化还原调控新基因的发现将为揭示细胞氧化还原调控网络奠定基础,在氧化还原研究领域具有非常重要的意义。

结项摘要

细胞氧化还原平衡调控与细胞生长、发育、分化以及衰老等过程密切相关。因此氧化还原调控是生物学和医学领域研究的重要问题。虽然已有一些氧化还原调控基因被发现,但是细胞内源氧化还原平衡如何维持与调控,都有哪些基因影响氧化还原平衡还远不清楚,尤其缺乏系统性研究。本项目的主要内容是以秀丽隐杆线虫这一经典模式生物为模型,结合特异感知线粒体氧化还原变化的荧光探针mt-Grx1-roGFP2,利用流式线虫仪为主要检测手段进行全基因组RNAi筛选,对氧化还原调控相关基因进行高通量系统性的研究。本项目已完成对线虫体内线粒体氧化还原相关基因的全基因组筛选,获得了118个候选基因,其中包括调控氧化还原状态的功能未知基因和新基因。然后进一步深入研究了筛选得到的新的氧化还原相关基因atad-3的功能和机制,揭示了atad-3调控线粒体中氧化还原及线粒体稳态的新功能。另外还开展了氧化还原调控与衰老的相关研究,提出氧化还原应激反应能力(Redox-stress Response Capacity, RRC)的新概念,发现它的下降是衰老的动态特征。本研究不仅实现了氧化还原敏感探针与全基因组高通量筛选的有机结合,同时氧化还原调控新基因的发现以及功能研究将为揭示细胞氧化还原调控网络奠定基础,氧化还原调控与衰老的研究也将为促进健康衰老提供新策略。因此,本项目的研究成果在氧化还原研究领域具有非常重要的意义。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The decay of Redox-stress Response Capacity is a substantive characteristic of aging: Revising the redox theory of aging.
氧化还原应激反应能力的衰减是衰老的本质特征:对衰老氧化还原理论的修正
  • DOI:
    10.1016/j.redox.2016.12.026
  • 发表时间:
    2017-04
  • 期刊:
    REDOX BIOLOGY
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Meng, Jiao;Lv, Zhenyu;Qiao, Xinhua;Li, Xiaopeng;Li, Yazi;Zhang, Yuying;Chen, Chang
  • 通讯作者:
    Chen, Chang
ATG4B S-nitrosation-mediated autophagy impairment leads to neurotoxicity in response to hyperglycemia.
ATG4B S-亚硝化介导的自噬损伤会导致高血糖反应的神经毒性。
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Autophagy
  • 影响因子:
    13.3
  • 作者:
    Li Yazi;Zhang Yuying;Wang Lei;Wang Ping;Xue Yanhong;Li Xiaopeng;Qiao Xinhua;Zhang Xu;Xu Tao;Liu Guanghui;Li Peng;Chen Chang
  • 通讯作者:
    Chen Chang

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其他文献

神经毒素基因RjAa17f在Sf9细胞中的表达及活性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    西北农林科技大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孟姣;于欢;周斌;王敦
  • 通讯作者:
    王敦
PAX5 haploinsufficiency induced CD8+ T cells dysfunction or exhaustion by high expression of immune inhibitory-related molecules
PAX5单倍体不足通过免疫抑制相关分子的高表达诱导CD8 T细胞功能障碍或耗竭
  • DOI:
    10.1016/j.ctarc.2021.100437
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Cancer Treatment and Research Communications
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    梁密;龚端豪;王磊;梁雪;孟姣;黄伟;周建峰
  • 通讯作者:
    周建峰

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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