基于深度突变扫描的醛酮还原酶催化与手性识别机制解析及催化性能强化

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21878274
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0812.生物化工与合成生物工程
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

(R)-Chiral alcohols are important building blocks for chiral pharmaceuticals, agrochemicals and materials, and their efficient synthesis has been the focus of academia and industry. Biocatalytic anti-Prelog stereoselective reduction of prochiral ketones by stereospecific alde-keto reductases (AKRs) is a promising method for optical pure (R)-alcohol synthesis. Previously, our group has constructed a number of robust, R-stereospecific AKR mutants via directed evolution. Further, we will develop the deep mutational scanning of ‘sequence-structure-function’ maps for AKRs, which is based on the high-throughput DNA sequencing and functional selection. Rationally combination of beneficial substitutions will be guided by the static and dynamic information extracted from the deep mutational scanning, yielding AKRs with excellent catalytic performance for the target (R)-alcohols. This project lays the foundation for the de novo design of industrial AKRs through catalytic mechanism elucidation employing deep mutational scanning methodology.
(R)-手性醇是手性医药、农用化学品和材料的重要合成砌块,其手性生物催化合成技术是产学界关注的焦点。利用反-Prelog规则醛酮还原酶不对称还原前手性酮合成(R)-手性醇具有重要的学术意义和工业应用价值。项目组前期已挖掘到多种微生物来源的醛酮还原酶基因,利用定向进化技术构建了醛酮还原酶突变体。在此工作基础上,项目将建立基于先进的二代测序技术和自行构建的高通量筛选方法组合的醛酮还原酶深度突变扫描技术,通过构建醛酮还原酶的全局饱和突变库,系统研究突变体功能,绘制醛酮还原酶的动态“序列-结构-功能”全局构效图谱;进一步依据全局图谱的静态和动态数据信息,提取醛酮还原酶对各种酮化合物不对称还原的有义突变位点、实施理性重组,高效创制催化性能优越的醛酮还原酶“超级”突变体。本项目的实施将有助于明晰醛酮还原酶的催化和手性识别机制,为醛酮还原酶理性设计提供新技术。

结项摘要

项目组运用深度突变扫描技术,获得醛酮还原酶KmAKR、KlAKR“序列-结构-功能”动态全局谱图;利用构效关系指导醛酮还原酶KmAKR、KlAKR理性设计。项目的主要研究计划包括:醛酮还原酶KmAKR、KlAKR全局饱和突变库的构建与高通量筛选,醛酮还原酶KmAKR、KlAKR催化和手性识别的分子机制解析,醛酮还原酶KmAKR、KlAKR有义突变位点筛选,醛酮还原酶KmAKR、KlAKR全局构效关系分析。.围绕项目既定的研究目标和研究内容,项目组在国内外生物工程领域学术期刊上共发表SCI论文12篇,授权发明专利5 项;获中国石油和化学工业科技进步一等奖1项(项目负责人排名第1),中国专利优秀奖1项(项目负责人排名第2);项目主要完成人邱帅博士生获浙江省优秀学位论文提名奖(2022年)。项目执行期间已培养邱帅博士,喻寒、程英男、陈祎、王丹娜、班善赟、翟秋瑶、谢剑勇、胡心怡、金灵俊、高小凡、孟康明、周盛怡、刘倩等研究生。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(4)
会议论文数量(0)
专利数量(5)
t-Butyl 6-cyano-(3R,5R)-dihydroxyhexanoate synthesis via asymmetric reduction by immobilized cells of carbonyl reductase and glucose dehydrogenase co-expression E. coli
羰基还原酶和葡萄糖脱氢酶共表达大肠杆菌固定化细胞不对称还原合成6-氰基-(3R,5R)-二羟基己酸叔丁酯
  • DOI:
    10.1016/j.procbio.2019.02.019
  • 发表时间:
    2019-05
  • 期刊:
    Process Biochemistry
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    邱帅;王亚军;喻寒;程峰;郑裕国
  • 通讯作者:
    郑裕国
One-step eantioselective bioresolution for (S)-2-chlorophenylglycine methyl ester catalyzed by the immobilized Protease 6SD on multi-walled carbon nanotubes in a triphasic system
三相系统中多壁碳纳米管上固定化蛋白酶 6SD 催化 (S)-2-氯苯基甘氨酸甲酯的一步对映选择性生物拆分
  • DOI:
    10.1016/j.jbiotec.2020.10.007
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Journal of Biotechnology
  • 影响因子:
    4.1
  • 作者:
    翁春跃;王丹娜;班善赟;翟秋瑶;胡心怡;程峰;王亚军;郑裕国
  • 通讯作者:
    郑裕国
Tailoring an aldo-keto reductase KmAKR for robust thermostability and catalytic efficiency by stepwise evolution and structure-guided consensus engineering
通过逐步进化和结构引导的共识工程定制醛酮还原酶 KmAKR,以实现强大的热稳定性和催化效率
  • DOI:
    10.1016/j.bioorg.2021.10471
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Bioorganic Chemistry
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    李树芳;谢剑勇;邱帅;程峰;王亚军;郑裕国
  • 通讯作者:
    郑裕国
Improving the catalytic efficiency of aldo-keto reductase KmAKR towards t-butyl 6-cyano-(3R,5R)-dihydroxyhexanoate via semi-rational design
通过半理性设计提高醛酮还原酶KmAKR对6-氰基-(3R,5R)-二羟基己酸叔丁酯的催化效率
  • DOI:
    10.1016/j.bioorg.2019.103018
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Bioorganic Chemistry
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    喻寒;邱帅;程峰;程英男;王亚军;郑裕国
  • 通讯作者:
    郑裕国
Semirational engineering of an aldo-keto reductase KmAKR for overcoming trade-offs between catalytic activity and thermostability
醛酮还原酶 KmAKR 的半理性工程克服催化活性和热稳定性之间的权衡
  • DOI:
    10.1002/bit.27913
  • 发表时间:
    2021-08-16
  • 期刊:
    BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Li, Shu-Fang;Xie, Jian-Yong;Zheng, Yu-Guo
  • 通讯作者:
    Zheng, Yu-Guo

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张琪

其他文献

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王亚军的其他基金

“拓展型家族”羰基还原酶立体选择性分子机制解析及其功能强化
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糖化合物调控游动放线菌合成阿卡波糖及其结构类似物的机制解析
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相似国自然基金

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相似海外基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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