IPT5b启动子INDEL插入对苹果砧木致矮分子遗传的影响机制研究

结题报告

项目介绍

AI项目解读

基本信息

批准号：
31772262
项目类别：
面上项目
资助金额：
60.0万
负责人：
韩振海
依托单位：
中国农业大学
学科分类：
C1502.果树种质资源与遗传育种学
结题年份：
2021
批准年份：
2017
项目状态：
已结题
起止时间：
2018-01-01 至2021-12-31

项目参与者：
许雪峰；冯轶；徐晓召；刘静；胡亚楠；
关键词：
苹果砧木分子标记辅助选择

项目摘要

Grafting is widely used in cultivated horticultural plants, not only for improving their adaptability and tolerance of salinity, cold and drought, but also for controlling adequate growth and development of the scion.Dwarfing apple rootstocks are widely used in the world. Our reseached showed dwarfing effect is caused by inherently poor root cytokinin biosynthesis in dwarfing rootstock. Specifically, an IPT5b mutant allele with INDEL insertion in the promoter exhibited dwarfing effect. There’re three major parts in our project. 1) Association between the IPT5b allele and dwarfing effect by analyzing segregating progeny. 2 ) An INDEL insertion in the Promoter of IPT5b alters its expression. 3) The upstream regulation of IPT5b.

砧木对果树树体的生长发育、果实产量和品质有着重要的影响，目前矮化砧木在世界主要苹果生产国中得到了广泛的应用。本课题组研究表明，玉米素对苹果自根砧致矮有重要调控作用，同时在矮化砧木玉米素合成基因IPT5b启动子上存在着INDEL突变，且这个突变与砧木致矮性紧密相关。为此，本研究拟以IPT5b多态位点作为突破口，以八棱海棠×M9杂交后代为材料，通过遗传连锁分析该INDEL插入对砧木矮化性状的影响，进一步利用启动子活性检测、稳定转化等证明该INDEL插入是否通过在转录水平调控IPT5b表达来决定砧木致矮性，并对IPT5b上游转录调控进行分析。最终明晰IPT5b启动子上INDEL插入的生物学意义及其上游调控路径，从而为从分子辅助育种手段加速苹果砧木改良、培育具有自主知识产权的优良矮化砧木品种提供基因储备和理论指导。

结项摘要

砧木对果树树体的生长发育、果实产量和品质有着重要的影响，目前矮化砧木在世界主要苹果生产国中得到了广泛的应用。本课题组研究表明，玉米素对苹果自根砧致矮有重要调控作用，同时在矮化砧木玉米素合成基因IPT5b启动子上存在着INDEL突变，且这个突变与砧木致矮性紧密相关。通过分别构建两种材料的启动子序列的分段删除载体和定点突变载体,利用拟南芥原生质体转化体系,最终确定了 IPT5b基因启动子区上游距离ATG起始密码1172bp处的Deletion变异是导致基因表达差异的主要原因。基于Deletion变异在苹果砧木中检测方法的开发,这一变异与致矮性的关系在苹果砧木种质资源和八棱海棠×M9杂交群体中得到了验证。IPT5b基因异源转化试验证明了 Deletion变异影响根系玉米素合成,这说明Deletion变异可能通过调控根系玉米素含量,影响砧木矮化特性。bZIP家族的成员能够识别IPT5b启动子上的ProRE元件上的-ACTCAT-序列，根据前期乔化矮化砧木转录组测序结果，筛选了11个在根系中表达差异的bZIP家族成员,并初步探讨了IPT5b基因的上游调控机理。.最终明晰IPT5b启动子上INDEL插入的生物学意义及其上游调控路径，并开发了KASP标记建立基因组辅助预测（GAP）模型从而为从分子辅助育种手段加速苹果砧木改良、培育具有自主知识产权的优良矮化砧木品种提供基因储备和理论指导。