生物系统中细菌鞭毛细丝马氏体力学相变的理论研究

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基本信息

  • 批准号:
    10902013
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    28.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A1003.天然生物材料、仿生与运动生物力学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

生物系统中的力学相变现象虽然可以追朔到35亿年前,但是对它们的研究工作近些年才刚刚开始。本课题探讨生物系统中细菌鞭毛细丝的马氏体力学相变现象;主要内容是对发生在细菌运动过程中细菌鞭毛细丝多相力学相变的理论研究。根据螺旋半径和周期长度不同,细菌鞭毛细丝呈现出12种不同的螺旋相,它们之间可以通过化学和力学的方法相互转变,不同的螺旋相对应着不同的微观分子结构。现有的研究并不能完全解释其力学相变实验现象。课题拟通过两种途径建立细菌鞭毛细丝多相力学相变理论模型:第一种方法通过对已有的细菌鞭毛细丝在流体力作用下的相变实验进行力学分析,得到其力学相变准则,运用Ginzburg-Landau唯像相变理论模型来描述细菌鞭毛细丝的宏观力学相变现象,第二种方法从细菌鞭毛细丝的微观分子结构入手,建立从微观到宏观过渡的细菌鞭毛细丝相变模型,来揭示细菌鞭毛细丝的微观力学相变发生机理。

结项摘要

近年来的实验研究发现生物系统中存在着与金属类似的相变现象,而这方面的研究工作才刚刚开始。本课题就是来探讨生物系统中的相变力学这一新的领域。实验发现螺旋状的细菌鞭毛细丝在体内和体外环境下均能发生多相相变,每一根细菌鞭毛细丝会有12种不同的螺旋结构,宏观上体现为不同的螺旋半径和螺旋周期长度。该课题的研究对象是细菌鞭毛细丝,研究的方向主要就是其力学相变。课题主要研究包括以下内容以及相应的关键结果和结论:.1).首先对已有的关于粘性力诱发的单根细菌鞭毛细丝周期性相变实验进行受力分析和数值计算;通过理论计算,我们得到细丝的相变准则,得出以下结论:1. 细菌的运动是由鞭毛细丝在粘性液体中的旋转产生的推动力来推进的,鞭毛细丝的几何参数比如周期长度,半径以及旋转频率都会影响细菌的运动速度。2. 在单根细丝相变过程中,扭矩和弯矩都在固定端部达到最大值对应着新相的形核,扭矩和弯矩同时对细丝的相变有贡献;其他的应力分量只引起细丝的弹性变形。3. 在新相传播的过程中,传播界面的扭矩和弯矩均为零,即相界面的 Maxwell应力为零,意味着共存的两相具有相同的自由能。这些分析结果为下一步相变理论模型的建立提供了依据。.2).在实验分析的基础上:1. 我们构造细菌鞭毛细丝力学相变的理论模型,建立二维朗道相变理论来描述鞭毛细丝从左螺旋状态到右螺旋状态的相变过程,这里我们基于Kirchhoff 细杆理论把细丝看作细长杆,我们选择鞭毛细丝的扭转率和曲率为序参量来建立自由能函数。2. 该模型可以对细丝进行相变稳定性分析,从而得到载荷和位移加载情况下的相变条件。3. 考虑扭转率和曲率的梯度能函数能够描述相界面的特性,即两相之间的过渡区域。.3).在非凸非局部朗道相变理论的基础上,我们来对位移加载的鞭毛细丝的相变过程进行有限元模拟,有限元程序的实现是以Ginzburg-Landau 为理论基础采用一维非凸非局部连续介质力学模型:1. 模拟结果可以描述相变的典型特征 – 新相的形核和长大;2. 非局部有限元模拟结果能够描述两相共存状态下两相之间的相界面厚度和结构特点,通过相界面传播的新相长大过程。3. 与时间相关的Ginzburg-Landau 相变理论用来描述在瞬态载荷加载下,细丝相变过程随时间的演化。非局部非凸有限元模拟的实现为研究相界面的能量、厚度和结构特点,以及相变的加载条件提供了一个工具。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(2)
专利数量(0)
生物系统中的相变现象及其力学研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    力学进展
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王晓玲;孙庆平
  • 通讯作者:
    孙庆平
Mechanical analysis of phase transition experiments of the bacterial flagellar filament
细菌鞭毛丝相变实验的力学分析
  • DOI:
    10.1007/s10409-010-0364-1
  • 发表时间:
    2010-07
  • 期刊:
    Acta Mechanica Sinica
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Wang, Xiao-Ling;Sun, Qing-Ping
  • 通讯作者:
    Sun, Qing-Ping
MECHANICALMODELING OF THE BISTABLE BACTERIAL FLAGELLAR FILAMENT
双稳态细菌鞭毛丝的机械建模
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Acta Mechanica Solida Sinica
  • 影响因子:
    2.2
  • 作者:
    王晓玲;孙庆平
  • 通讯作者:
    孙庆平
Simulation of bacterial flagellar phase transition by non-convex and non-local continuum modeling
通过非凸非局部连续介质模型模拟细菌鞭毛相变
  • DOI:
    10.1063/2.1104401
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    Theoretical and Applied Mechanics Letters
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    王晓玲;孙庆平
  • 通讯作者:
    孙庆平

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  • 通讯作者:
    水恒福

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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