药物诱导靶器官毒性预测模型的构建及毒性分子结构特征的分析研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81903543
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3407.药物设计与药物信息
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

The chemical-induced target organ toxicities, including cardiotoxicity, hepatotoxicity, pulmonary toxicity and nephrotoxicity, are most common causes of drug R&D failure and market withdrawal. In order to reduce the risk of late drug development, early evaluation of target organ toxicities at the stages of drug design and discovery is very important. At present, the commercial toxicity prediction softwares mainly focus on these toxicities that are easy to be found in preclinical studies, but seldom predict and evaluate the target organ toxicities. Thus, in this study, the SVM and Bayesian and recursive partitioning classifier methods will be used to develop the target organ toxicities prediction models, including cardiotoxicity, hepatotoxicity, pulmonary toxicity and nephrotoxicity. The classical toxicity test data based on mouse will be used to measure the reliability of these established models. The developed prediction models for target organ toxicities will be shared on internet platform. The molecular descriptors related to these target organ toxicities and some toxic fragments will be carefully analyzed, which could provide some theoretical guidance for medicinal chemists in the design of new candidate drugs and lead optimization. In summary, the implementation of this project will make certain contributions to the early rapid screening and prediction of these target organ toxicities and optimization and modification of target organ toxic molecules.
心脏毒性、肝毒性、肺毒性及肾脏毒性等靶器官毒性是导致药物开发失败和从市场上撤回最为常见的原因。为降低药物后期研发的风险,将靶器官毒性评价提前到药物设计和发现阶段非常重要。目前商业化的毒性预测软件着重于预测临床前研究比较容易发现的毒性,而很少对药物分子的靶器官毒性进行预测评价。基于此,本课题针对心脏毒性、肝脏毒性、肺毒性和肾脏毒性等靶器官毒性将开展以下研究:采用SVM、贝叶斯及递归分类决策树方法构建靶器官毒性计算机辅助预测模型;利用经典的老鼠毒性试验数据检验模型的可靠性;将所构建的靶器官毒性计算机预测模型共享互联网平台;深入分析与心脏毒性、肝毒性、肺毒性及肾脏毒性相关的分子描述符、毒性分子片段及毒性分子结构特征,可为候选化合物分子优化提供一定的指导性意见。总之,本课题的研究将能够为心脏毒性、肝毒性、肺毒性及肾脏毒性等靶器官毒性的早期快速筛选评价及毒性分子优化修饰做出一定的贡献。

结项摘要

心脏毒性、肝毒性、肺毒性及肾脏毒性等靶器官毒性是导致药物开发失败和从市场上撤回 最为常见的原因。为降低药物后期研发的风险,将靶器官毒性评价提前到药物设计和发现阶段非常重要。本项目采用SVM、贝叶斯及递归分类决策树方法对心脏毒性、肝脏毒性、肺毒性和肾 脏毒性等靶器官毒性展开预测模型及毒性分子特征的研究:(1)采用SVM、贝叶斯及递归分类决策树方法成功构建心脏毒性计算机预测模型,同时分析发现与心脏毒性相关的13个分子描述符及心脏毒性分子片段。(2)成功构建了肝毒性的贝叶斯和递归决策树的计算机预测模型。发现18个分子描述符及肝毒性分子片段与肝毒性密切相关。(3)成功构建肺毒性的SVM、贝叶斯和递归决策树的计算机预测模型。分析得到了与肺毒性相关的6个分子描述符及肺毒性分子片段。(4)成功构建了药物诱导肾脏毒性的SVM、贝叶斯和递归决策树的计算机预测模型。分析发现了7个描述符及肾脏毒性分子片段对识别肾脏毒性化合物非常重要。(5)将所构建的靶器官毒性计算机预测模型已共享互联网平台(https://sky.nwnu.edu.cn/2020/0314/c1243a138692/page.htm)。总之,本项目的研究成果能够为心脏毒性、肝毒性、肺毒性及肾脏毒性等靶器官毒性的早期快速筛选评价及毒性分子优化修饰做出一定的贡献。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Discovery of microtubule stabilizers with novel scaffold structures based on virtual screening, biological evaluation, and molecular dynamics simulation
基于虚拟筛选、生物学评价和分子动力学模拟发现具有新型支架结构的微管稳定剂
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Chemico-Biological Interactions
  • 影响因子:
    5.1
  • 作者:
    毛俊;骆情情;张洪瑞;郑秀荷;申宸;祁花朝;胡美玲;张会
  • 通讯作者:
    张会
Discovery of novel tubulin inhibitors targeting taxanes site by virtual screening, molecular dynamic simulation, and biological evaluation
通过虚拟筛选、分子动力学模拟和生物学评价发现针对紫杉烷位点的新型微管蛋白抑制剂
  • DOI:
    10.1002/jcb.30077
  • 发表时间:
    2021-07
  • 期刊:
    J Cell Biochem
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张会;毛俊;杨彦丽;刘春桃;申宸;张洪瑞;丁兰
  • 通讯作者:
    丁兰

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其他文献

东莞市内涝预报模型研究
  • DOI:
    10.14188/j.1671-8844.2015-05-003
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    陈俊合
城市内涝预警综合评价方法
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国防汛抗旱
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈洋波;张会;杜国明
  • 通讯作者:
    杜国明
联合作战想定中基于描述任务逻辑的任务规划
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    张巍
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
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  • 作者:
    张会;王珩
  • 通讯作者:
    王珩
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    10.18306/dlkxjz.2019.02.003
  • 发表时间:
    2019-02
  • 期刊:
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  • 作者:
    张会;李铖;程炯;吴志峰;吴艳艳
  • 通讯作者:
    吴艳艳

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张会的其他基金

靶向紫杉醇位点微管抗肿瘤新型稳定剂的发现及其生物活性的评价
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
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    地区科学基金项目
有机化合物诱导“三致”毒性预测模型的构建、验证及毒性分子结构特征的分析研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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