几个特异基因家族在不同倍性水稻中的表达差异研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30771157
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    28.0万
  • 负责人：
    吴先军
  • 依托单位：
    四川农业大学
  • 学科分类：
    C0602.基因表达及非编码序列调控
  • 结题年份：
    2010
  • 批准年份：
    2007
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2008-01-01 至2010-12-31

项目摘要

全基因组倍增或整体化过程被认为是植物尤其是禾本科作物物种形成和进化过程中非常普遍和重要的事件，基因组加倍后，再经历所谓的二倍化过程，进化成当代的二倍体物种。本项目利用多胚苗水稻品系9003中自然发生的单倍体、二倍体、同源三倍体和同源四倍体为材料，通过表型分析、DNA分析、MSAP、RNA分析、基因芯片分析并辅之以RT-PCR等实验手段，研究不同倍性水平下几个特异基因家族的表达差异规律和甲基化的倍性调控表达机理及遗传特点。与倍性调控变化相关的几个特异基因家族，包括控制甲基化合成和传递相关位点的基因、乙烯生物合成相关的基因、SNF2结构域位点基因、RAD54等。筛选与倍性水平相关的特异敏感表达基因并探索基因家族内部分基因的未知功能。利用生物信息学方法对上述差异表达的特异基因家族进行功能分类和代谢调控途径模拟，旨在阐明它们在不同倍性水稻中的遗传和进化的分子表达模式和特点。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（10）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
双胚苗水稻中单倍体与二倍体基因表达芯片分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国科学(C辑:生命科学)
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    彭海;李平川;邓其明;徐培洲;张红宇;吴先军;李云;汪旭东
  • 通讯作者：
    汪旭东
胁迫条件下植物DNA甲基化的稳定性
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    彭海;席婷;张静;吴先军
  • 通讯作者：
    吴先军
拟南芥的印记基因和印记表达调控
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张红宇;徐培洲;杨华;吴先军
  • 通讯作者：
    吴先军
水稻基因组DNA胞嘧啶甲基化在单倍体和对应二倍体间的差异
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    科学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    张红宇;吴先军;彭海;徐培洲;汪旭东;李云
  • 通讯作者：
    李云
双胚苗水稻中单倍体和二倍体不同器官的cDNA-AFLP分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    遗传
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    徐培洲;彭海;张红宇;汪旭东;吴先军;邓其明;李云
  • 通讯作者：
    李云

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其他文献

双胚苗水稻单倍体及其杂交后代基因组DNA甲基化特异位点的分析及功能探讨
  • DOI：
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  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国水稻科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴绍华;薛晶晶;张红宇;徐培洲;吴先军
  • 通讯作者：
    吴先军
调控水稻异倍性杂交种子败育的相关基因分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
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  • 期刊：
    科学通报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    徐培洲;陈晓琼;吴先军;张红宇
  • 通讯作者：
    张红宇
双胚苗水稻来源的单倍体、二倍体及其杂交F1的DNA甲基化位点分析
  • DOI：
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    --
  • 期刊：
    作物学报
  • 影响因子：
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  • 作者：
    吴绍华;张红宇;薛晶晶;徐培洲;吴先军
  • 通讯作者：
    吴先军

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吴先军的其他基金

HER1调控水稻柱头外露率的分子机制及育种利用
  • 批准号：
    32372081
  • 批准年份：
    2023
  • 资助金额：
    50 万元
  • 项目类别：
    面上项目
同源三倍体水稻基因组DNA甲基化研究
  • 批准号：
    30971618
  • 批准年份：
    2009
  • 资助金额：
    32.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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