金黄色葡萄球菌生物被膜相关蛋白的结构与功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31872712
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    59.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Staphylococcus aureus is an important opportunistic pathogen that usually cause chronic biofilm-associated infections leading to significant increases in morbidity and mortality. Recent evidence suggest that a group of surface proteins play a leading role in mediating the biofilm formation in diverse bacteria. The first member of this group of proteins was identified in a Staphylococcus aureus bovine mastitis isolate and was named Bap (biofilm associated protein). Bap is a large, multidomain protein containing a core domain of tandem repeats. Currently, little structural information is available for Bap. In this project, we aim to solve the high resolution structure of the B and C domains of Bap protein, and characterize the solution structure of full length Bap protein and it was regulated by environmental factors. We will further study the structure-and -function relationship of Bap protein by both in vitro and in vivo experiments, to reveal the molecular mechanism of Bap protein in mediating biofilm formation, to provide clues for drug and vaccine development targeted Bap protein.
金黄色葡萄球菌是一种重要的机会型病原菌,常引起与生物被膜有关的慢性感染,导致发病率和致死率的显著升高。新近的研究表明,一大类表面蛋白在许多细菌中的生物被膜形成过程中发挥主导作用,这类蛋白的第一个成员是从金黄色葡萄球菌奶牛乳腺炎菌株中发现的,即生物被膜相关蛋白。Bap蛋白是一个多结构域的大分子量蛋白,包含一个带有多个重复序列的核心区。目前,关于Bap蛋白的结构信息还很少。在本项目中,我们将整合运用X射线晶体学、核磁共振、小角X射线散射技术及其它生物物理方法,解析Bap蛋白B结构域、C结构域的高分辨率结构、研究其全长的溶液结构及不同溶液环境对其的影响。结合生化实验和体内实验,探讨其结构与功能的关系,揭示其介导生物被膜形成的分子机制,为开展针对Bap蛋白的药物和疫苗设计提供依据。

结项摘要

金黄色葡萄球菌Bap蛋白是一个多结构域蛋白,全长蛋白含有2276个氨基酸。最近的研究表明,Bap蛋白的N末端在低pH和低钙下易于聚集形成功能性淀粉样纤维,并且促进细菌聚集和生物被膜的形成。然而,Bap蛋白响应环境变化调控淀粉样纤维的形成以及介导生物被膜形成的机制并不清楚。Bap蛋白还包含一个具有多重重复序列的C结构域,其结构与生理功能仍不清楚。(1)我们解析了Bap蛋白N末端BSP结构域的高分辨率晶体结构,该结构呈现哑铃形折叠,连接BSP的N末端和C末端的中间模块(Middle module,MM)由两个串联的全新的钙离子结合基序组成。小角X射线散射(SAXS),核磁共振(NMR)和分子动力学模拟数据表明,中间模块响应钙离子浓度变化发生从有序到无序的构象转换。体外和体内的生化实验表明,BSP的N端在酸性(pH <= 4.5)条件下通过液相-液相和液相-固相相变形成淀粉样纤维并介导生物被膜形成。该过程受到低钙离子条件下处于无序构象的中间模块(MM)的促进,而钙离子结合可促进中间模块的紧凑折叠,并与周边模块形成相互作用网络,从而抑制相分离发生以及生物被膜的形成。由于许多细菌都通过Bap形成生物被膜,对Bap蛋白介导金黄色葡萄球菌生物被膜形成的调控机制的揭示,有助于开展相关的药物设计。(2)我们用NMR解析了Bap蛋白C结构域的一个重复序列C1的溶液结构,解析了Bap蛋白C结构域含二个重复序列C2的晶体结构。结合定点突变,ITC和NMR,我们研究了C2结合钙离子的关键残基。结合小角X射线散射数据和计算模拟,构建了C2-C5在有无钙离子存在下的溶液结构模型,以及全长Bap蛋白的溶液结构模型。这些成果将为深入研究C结构的生理功能提供启示。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural mechanism for modulation of functional amyloid and biofilm formation by Staphylococcal Bap protein switch
葡萄球菌 Bap 蛋白开关调节功能性淀粉样蛋白和生物膜形成的结构机制
  • DOI:
    10.15252/embj.2020107500
  • 发表时间:
    2021-05-28
  • 期刊:
    EMBO JOURNAL
  • 影响因子:
    11.4
  • 作者:
    Ma, Junfeng;Cheng, Xiang;Fang, Xianyang
  • 通讯作者:
    Fang, Xianyang

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其他文献

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方显杨的其他基金

基于整合方法的新冠病毒3’非翻译区的结构与构象动态特性研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2020
  • 资助金额:
    万元
  • 项目类别:
    国际(地区)合作与交流项目
基于小角X射线散射技术的黄病毒RNA的结构、动态特性及其与蛋白质相互作用的研究
  • 批准号:
    U1832215
  • 批准年份:
    2018
  • 资助金额:
    248.0 万元
  • 项目类别:
    联合基金项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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