菌膜粘附分子聚N-乙酰葡萄糖胺合成与转运机理研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31470743
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    95.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0501.结构生物学
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Bacterial biofilms are complex surface attached microbial communities that are a significant medical problem because once established they are difficult to eradicate. A key feature of bacterial biofilms is that cellular aggregates grow within a self-produced extracellular matrix that are full of secreted proteins and exopolysaccharides. The extracellular matrix facilitates the adherence between bacteria and the surfaces they colonize while also providing protection against environmental stresses, a diffusion barrier against antibiotics, and isolation from the innate immune system. A wide variety of medically important biofilm-forming bacteria produce N-acetylated poly-β-1,6-N-acetyl-D-glucosamine (PNAG) exopolysaccharides, also referred to as biofilm intercellular adhesin. In E. coli, PNAG production is dependent on the four-gene operon, pgaABCD,and its products PgaC-PgaD complex and PgaA form PNAG-secretion channels across bacterial inner and outer membranes, respectively. To elucidate the molecular mechansism of PNAG biogenesis, we propose structural and functional studies of Pga proteins that are involved in PNAG synthesis and translocation,primarily using X-ray crystallography. These studies will not only improve our undstanding of the secretion mechanisms of exopolysaccharides in general, but also provide important information for developing novel drugs against biofilm formation.
环境中细菌不是游离存在的,而是藏身于自身分泌的蛋白质和多糖等所组成的被称为菌膜(biofilm)的胶状基质中。菌膜为细菌的寄生生活提供了强大的保护屏障,使其对宿主体内的各种免疫环境具有极大的抵抗力,同时赋予了细菌极强的致病性。细菌分泌的胞外多糖聚N-乙酰葡萄糖胺(PNAG),又称菌膜粘附分子,是介导细菌之间发生初步接触和粘附的关键分子,直接影响菌膜的形成。大肠杆菌膜蛋白PgaC-PgaD和PgaA分别负责PNAG特异性地跨内外膜分泌。我们将以X-射线衍射晶体学为主要手段,开展对参与PNAG 合成和转运的一系列膜蛋白进行结构测定,并结合其他生物物理,生物化学以及细菌遗传学手段,研究PNAG合成与分泌的机理。通过这些研究,可以加深对胞外多糖分泌机制以及菌膜形成的了解,也将为研发抗菌膜生成药物提供重要信息。

结项摘要

环境中细菌不是游离存在的,而是藏身于自身分泌的蛋白质和多糖等所组成的被称为菌膜的胶状基质中,菌膜为细菌的寄生生活提供了强大的保护屏障,使其对宿主体内的各种免疫环境具有极大的抵抗力,同时赋予了细菌极强的致病性。细菌分泌的胞外多糖聚N-乙酰葡萄糖胺(PNAG),又称菌膜黏附分子,是介导细菌之间发生初步接触和粘附的关键分子,直接影响菌膜的形成。大肠杆菌膜蛋白PgaC-PgaD和PgaA,PgaB分别负责PNAG特异性地跨内外膜分泌。我们用X-射线晶体衍射技术解析了关键外膜蛋白PgaA-PgaB复合物3.2 Å的晶体结构,在革兰氏阴性细菌胞外多糖分泌这一研究领域中率先得到了完整的外膜分泌复合体的空间结构;并通过定点突变和体内功能实验确定了该复合物上若干关键的氨基酸位点。并且成功地在体外表达了重组的PgaC-PgaD复合物,获得较为稳定的PgaC-PgaD复合物用于结构学和功能学研究。在上述的基础上,我们提出一种猜想,认为内膜的合酶/转运复合体PgaC-PgaD应该与外膜的分泌复合体PgaA-PgaB存在相互作用,才能够完成将在内膜上新合成的多糖链转移到外膜的分泌复合体中进而分泌到细胞外这一生物学功能。对PgaA-PgaB复合体以及PgaC-PgaD复合体进行的体外生化实验的研究最终为我们提供了这一相互作用的证据。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Structural Basis for Translocation of a Biofilm-supporting Exopolysaccharide across the Bacterial Outer Membrane
支持生物膜的胞外多糖跨细菌外膜易位的结构基础
  • DOI:
    10.1074/jbc.m115.711762
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    Journal of Biological Chemistry
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Wang Yan;Pannuri Archana Andole;Ni Dongchun;Zhou Haizhen;Cao Xiou;Lu Xiaomei;Romeo Tony;Huang Yihua
  • 通讯作者:
    Huang Yihua

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其他文献

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黄亿华的其他基金

细菌usher家族外膜蛋白结构与功能研究
  • 批准号:
    31170698
  • 批准年份:
    2011
  • 资助金额:
    70.0 万元
  • 项目类别:
    面上项目

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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