中国特有两栖动物灭绝债务的预测建模

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31901221
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    25.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0312.保护生物学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

Even though habitat destruction can lead to imminent loss of species (e.g., endemic plants), in many cases, species extinction does not take place immediately. Many species (especially for animals) require time to go to ultimate extinction, and the length of extinction time is related to population size, trophic position and other factors. The time-lagged extinction phenomenon is termed as extinction debt in ecology. Based on this definition, extinction debt contains two components: the number of extinct species (i.e., extinction magnitude) and the required time for fulfilling the extinction (i.e., relaxation time). The present project utilizes the highly diverse endemic amphibians of China as a test model for studying crossing-scale extinction debt patterns. To be specific, by applying and comparing different statistical models (including but not limited to ecological niche model, dynamic island biogeography model, metapopulation model and neutral theory-based model), and combining distributional information of species and broad-spatial environmental data, the project will predict the magnitude and relaxation time of extinction debts of endemic taxa under environmental change. Moreover, the project will integrate landscape-level field study closely by conducting biodiversity survey and functional-trait measure of endemic amphibians across different habitat patches in biodiversity hotspots of southern China, for the purpose of supplementing, cross-validating and improving the broad-scale predictions derived from statistical models.
生境破坏虽然可能造成物种的瞬间灭绝(比如特有植物),但是在很多时候,物种灭绝不一定是瞬间发生并瞬间结束的事情。许多物种(特别是动物)从濒危走向彻底灭绝需要一定时间完成,时间长短跟物种的数量大小与食性层次等因素有关。一个生态群落中带有时间滞后效应的物种灭绝现象在生态学上被称为灭绝债务。根据此定义,其包含两方面的含义:物种灭绝的数量(也称为灭绝债务量)与完成灭绝所需的时间(也称为弛豫时间)。本研究以丰富的中国特有两栖动物来研究多尺度的灭绝债务式样。具体来说,利用并比较多种生态统计模型(包括且不局限于生态位模型、动态岛屿生物地理学模型、集合种群模型与中性生物多样性模型),结合物种大尺度分布与气候环境数据,评估特有两栖动物在未来环境变化下的潜在灭绝债务量与弛豫时间。并在我国南方代表性两栖动物多样性热点地区开展野外生境斑块示范调查,补充功能性状数据,交叉对比、验证与改进大尺度的模型预测结果。

结项摘要

生境破坏虽然可能造成物种的瞬间灭绝,但是在很多时候,物种灭绝不一定是瞬间发生并瞬间结束的事情。每个物种从濒危走向彻底灭绝需要一定时间完成,时间长短跟物种本身的个体数量、所处食物网的营养级别与群落中有竞争关系的其他物种种数等因素有关。一个生态群落中带有时间滞后效应的物种灭绝现象在生态学上被称之为物种灭绝债务。在国家自然科学基金直接支持下,研究团队通过提出新统计方法,同时结合已有统计模型,系统研究了中国两栖动物的分布格局和灭绝债务的时空分布格局。具体来说,1)提出全新的气候债务的数学计算公式,对公式进行加性拆分以便识别债务高的类群与区域。在全球尺度工作显示,在未来气候变化下,全球与中国两栖动物灭绝债务不断加强。特别地,某些类群的债务量持续累计,比如在科级水平上,Pelodridadidae、Mantellidae、Limnodynastidae、Dicroglosidae、Bufonidae和Ptychadidae等科是气候债务的主要贡献者。就世界自然保护联盟濒危物种红色名录类别而言,无危物种反而有更高的债务水平。在空间尺度上,温带阔叶林和混交林、北方森林/泰加、温带针叶林和苔原等区域的两栖动物群落的债务急剧增加。分析表明,景观异质性是两栖动物空间气候债务的主要贡献因子。2)在国家尺度上,我们发现,不同栖息地的两栖动物的灭绝债务可能在1980年至2000年间已经部分还清,但在接下来一段时间内里,林地、草地和水中的灭绝债务不断累积,水中的灭绝债务更为明显。而在区域尺度上,西南山地的两栖动物灭绝债务也呈现尺度依赖性和生境独特性,草地与水域的债务量是最高的,而在空间分布上,成都平原有最高的两栖动物灭绝债务量。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Extinction debt in local habitats: quantifying the roles of random drift, immigration and emigration
当地栖息地的灭绝债:量化随机漂移、迁入和迁出的作用
  • DOI:
    10.1098/rsos.191039
  • 发表时间:
    2020-01
  • 期刊:
    ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Yongbin Wu;Youhua Chen;Shui-Ching Chang;You-Fang Chen;Tsung-Jen Shen
  • 通讯作者:
    Tsung-Jen Shen
Detecting and comparing extinction debts of amphibians in different habitats of southwestern China
西南地区不同生境两栖动物灭绝债的检测与比较
  • DOI:
    10.1016/j.ecolind.2022.109007
  • 发表时间:
    2022-07
  • 期刊:
    Ecological Indicator
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Qingyue Guo;Xiaoke Liu;Yuxiao He;Youhua Chen
  • 通讯作者:
    Youhua Chen
Climatic debts for global amphibians: Who, where and why?
全球两栖动物的气候债务:谁、在哪里以及为什么?
  • DOI:
    10.1016/j.biocon.2023.109929
  • 发表时间:
    2023-03
  • 期刊:
    Biological Conservation
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Yuxiao He;Ziyan Liao;Xiaohong Chen;Youhua Chen
  • 通讯作者:
    Youhua Chen
Impact of Global Climate Change on the Distribution Range and Niche Dynamics of Eleutherodactylus planirostrish in China.
全球气候变化对中国刺五加分布范围及生态位动态的影响
  • DOI:
    10.3390/biology11040588
  • 发表时间:
    2022-04-13
  • 期刊:
    BIOLOGY-BASEL
  • 影响因子:
    4.2
  • 作者:
    Mu, Chaosheng;Guo, Xuecheng;Chen, Youhua
  • 通讯作者:
    Chen, Youhua

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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