细菌DNA复制前体复合物的结构与功能研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    U1432102
  • 项目类别:
    联合基金项目
  • 资助金额:
    66.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    A3201.北京正负电子对撞机
  • 结题年份:
    2017
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2017-12-31

项目摘要

The elaborate process of genomic replication requires a large collection of proteins properly assembled at a DNA replication fork. The helicase and primase form the primosome which plays important role in DNA replication. Therefore, these two enzymes are attractive target for antibacterial drug development. However, it is still unclear how these two enzyme coordinate with each other at replication fork. Here the structure of the primosome will be investigated by crystallography and Small-Angel X-Ray Scattering (SAXS), structure-based function will be studied by biochemical assay, the results will reveal how the primosome complex performs dsDNA unwinding activity and priming activity in the initiation of DNA replication.
DNA复制是细胞最基本的生命活动之一,涉及多种蛋白质相互作用。在细菌中,解旋酶和引物酶形成DNA复制前体,在DNA复制中发挥重要作用,目前,对细菌解旋酶和引物酶单个蛋白的研究取得了不少成果,然而DNA复制前体复合物在DNA复制过程中的作用机制仍然不清楚。在本研究项目中,将研究嗜热脂肪芽胞杆菌DNA复制前体的晶体结构和小角散射溶液结构,在结构研究的基础上,设计解旋酶和引物酶突变体,通过生物化学实验进一步验证DNA复制前体与DNA相互作用的机制,进而综合结构与功能研究结果,揭示DNA复制前体的功能和作用机理。

结项摘要

在细菌中,解旋酶和引物酶形成了DNA复制前体(Primosome)。虽然对解旋酶和引物酶单个蛋白的研究分析已经很多, 但对DNA复制前体复合物作用机制还了解甚少。我们制备了嗜热脂肪芽孢杆菌复制前体复合物,测定了DNA复制前体的ATPase活性,DNA复制前体的ATP水解活性是DnaB解旋酶的2倍。成功获得了DNA复制前体复合物晶体,晶体衍射分辨率在7-10Å之间。利用小角散射技术获得了枯草芽胞杆菌引物酶(BsuDnaG)的溶液结构,BsuDnaG在溶液中显示为单体,呈长条状,其全长结构较为伸展,ZBD倾向于伸展排列,HBD并非完全紧靠于RPD背后,而是较为松散的排列在RPD上端。引物酶容易降解,虽然引物酶三个结构域的晶体结构已知,但其全长结构一直未知,本项目利用小角散射技术解析了枯草芽胞杆菌引物酶的溶液结构,对于进一步认识解旋酶和引物酶相互作用具有重要意义。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(1)
Structural analysis of Pseudomonas aeruginosa H3-T6SS immunity proteins
铜绿假单胞菌H3-T6SS免疫蛋白的结构分析
  • DOI:
    10.1002/1873-3468.12291
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    FEBS LETTERS
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Yang Xiao-Yun;Li Zong-Qiang;She Zhun;Geng Zhi;Xu Jian-Hua;Gao Zeng-Qiang;Dong Yu-Hui
  • 通讯作者:
    Dong Yu-Hui

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其他文献

R&D补贴激励机制的重新审视——基于外部融资激励机制的考察
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王刚刚;谢富纪;贾友
  • 通讯作者:
    贾友
强迫对流影响枝晶生长的三维相场法模拟
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    兰州理工大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    胡海皇
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  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王刚刚;沈晓伟;张鑫;贺华;陆林其;王晓亮
  • 通讯作者:
    王晓亮
二元合金定向凝固的三维相场模拟
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
    兰州理工大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    冯力;胡海皇;朱昶胜;王刚刚;路 阳;肖荣振
  • 通讯作者:
    肖荣振
结核分枝杆菌DNA复制解旋酶与引物酶的相互作用
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    10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.03043
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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    --
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    刘文林;罗昊;罗爽;王刚刚
  • 通讯作者:
    王刚刚

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王刚刚的其他基金

细菌DNA复制叉解链和引物合成的偶联机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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