中国典型海洋环境中病毒对细菌多样性和种群结构的影响

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    40906059
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0605.海洋生态学与环境科学
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

数量巨大的海洋病毒作为细菌的主要致死因素之一,在海洋生态系统的物质和能量循环中起到重要作用。本研究拟采用DNA指纹图谱(T-RFLP和DGGE)和构建克隆文库的方法,结合细菌类群的特异性引物,研究中国近海典型海洋环境中病毒对海洋总细菌、主要细菌发育类群和主要细菌功能类群多样性和种群结构的影响,同时测定细菌丰度、生产力等生态指标,验证海洋病毒在不同层面(系统发育类群和功能类群)对细菌种群的影响;结合环境特征和"微生物环"、"病毒环"等理论,为进一步揭示病毒在海洋生态系统中的地位和作用奠定基础。

结项摘要

根据项目任务书,项目组从现场调查、现场实验及室内实验三个方面开展了海洋病毒对细菌多样性和种群结构影响的研究。项目组首先充分利用基金委开放航次及其他航次机会,对我国典型海区的海洋病毒及其宿主的生态特性进行了系统调查,形成了目前我国信息量最大的海洋病毒丰度、生产力、降解率等生态特性的数据集,为全面了解我国海区生态系统中海洋病毒的生态作用奠定了坚实的基础;病毒生产力与细菌生产力及叶绿素等环境参数的相关性体现了生态系统中病毒与宿主紧密的联系。同时,项目组采集了大量我国及全球大洋海区海洋病毒浓缩液样品,这些珍贵样品的采集和保藏,是进行全球范围内海洋病毒的分离和多样性研究的重要资源;我们相继分离到了典型的好氧不产氧光合细菌(AAPB)及非AAPB菌株的病毒并进行了基因组分析,评估了病毒对宿主侵染的选择性,并通过基因组分析揭示了宿主及其病毒之间的水平基因转移(HGT)。由病毒介导的HGT对细菌的种群结构(基因型和生态型)有重要的贡献。项目组在我国东海、吕宋海峡及西太平洋海区进行了海洋病毒对细菌多样性及种群结构的现场培养实验,发现在寡营养/富营养海区、表层/深海环境中,海洋病毒都对细菌类群有明显的作用:病毒会降低海洋细菌类群的丰度、刺激细菌生产力并维持较高的细菌类群多样性,细菌的群落结构也发生了相应的改变。海洋细菌群落结构的变化将导致其生态功能的差异,深刻影响海洋物质和能量循环。这些影响在深海环境中尤为明显,这对我们认识占海洋主体的深海环境中海洋病毒的生态作用具有重要意义。项目组对我国近海及其邻近大洋海洋病毒的系统研究为今后评估病毒对海洋碳循环和储碳的影响奠定了基础并提出了新的科学问题(如深海病毒多样性的宏基因组研究等)。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Niche Partitioning of Marine Group I Crenarchaeota in the Euphotic and Upper Mesopelagic Zones of the East China Sea
东海浅层和中深层海洋第一类天沟菌的生态位划分
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2011-11-01
  • 期刊:
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Hu, Anyi;Jiao, Nianzhi;Yang, Zao
  • 通讯作者:
    Yang, Zao
Gain and loss of phototrophic genes revealed by comparison of two Citromicrobium bacterial genomes.
通过比较两种柠檬微菌属细菌基因组揭示光养基因的获得和损失
  • DOI:
    10.1371/journal.pone.0035790
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    PloS one
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zheng Q;Zhang R;Fogg PC;Beatty JT;Wang Y;Jiao N
  • 通讯作者:
    Jiao N
Pelagibacterium nitratireducens sp.nov., A Marine Alphaproteobacterium Isolated from the East China Sea
Pelagibacter nistireducens sp.nov.,从东海分离的海洋α变形菌
  • DOI:
    10.1007/s00284-012-0299-9
  • 发表时间:
    2013-01
  • 期刊:
    Current Microbiology
  • 影响因子:
    2.6
  • 作者:
    Qipei Li;Yongle Xu;Keshao Liu;Lanlan Cai;Yingnan Fu;Jia Sun;Rui Zhang
  • 通讯作者:
    Rui Zhang

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  • 作者:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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