云南HCV感染人群STAT3信号通路遗传易感分析及功能验证

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31460289
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
  • 资助金额:
    55.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0604.表型、行为与疾病的遗传学基础
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2014
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2015-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Hepatitis C virus (HCV) is the cause of Hepatitis C, which is danger to peoples' health. Only half of HCV patients could be cured. The infection and pathopoiesis of HCV were influenced by the genetic factors of host, but the mechanism was unclear. The genes, which belong to signal transducer and activator of transcription 3 (STAT3) signal pathway, participanted in the pathogenicity of HCV. The Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of these genes affected clearence rate and treatment effectiveness of HCV patients, but the effective is different in variant population. We will collected 1500 HCV patients and 1500 normal controls with different nationalities in Yunnan Province. SNPs of 11 genes in STAT3 signal pathway will be genotyped. The functional assay will be performed to validate the role of discrepant SNPs. The results will explain the genetic difference of HCV patients between various nationilities, and reveal the correlation between genetic susceptibility of the 11 genes in STAT3 signal pathway and HCV infection, pathogenesis, and treatment effection. Our study will provide essential information for clinical prevention, treatment, and drug development for HCV patients.
丙型肝炎是由丙型肝炎病毒(HCV)感染引起的严重危害人类健康的疾病,临床药物有效治愈率仅约50%,研究表明其感染和治疗效果受到宿主遗传因素的影响,但具体致病机理不明。信号转导和转录激活因子3(STAT3)信号通路基因参与HCV的感染、致病和病程进展,其遗传变异位点影响HCV感染宿主后的自身清除反应、病程进展和药物治疗效果,但是不同HCV人群遗传易感性差异较大。本项目拟采集云南省不同民族HCV患者1500例,同时收集对照样本,对其开展STAT3信号通路11个关键基因的遗传易感性分析,对有差异的单核苷酸多态位点(SNP)进行细胞水平功能验证,进而阐述云南省不同民族HCV患者遗传易感性差异,揭示STAT3通路基因遗传变异与HCV感染、致病、病程进展及治疗效果之间的相关性,为云南省多民族HCV的防治和新药研发提供理论基础。

结项摘要

丙型肝炎病毒(HCV)是引起丙型肝炎的病原体,而慢性丙型肝炎是诱发肝硬化和肝癌的主要病因。虽然对HCV感染的研究很多,但HCV感染和致病的宿主遗传易感机制尚需深入探讨。我们对云南省HCV感染者和正常对照进行STAT3信号通路遗传易感的分析。首先收集394名HCV感染患者和395对照个体的基本信息,生化指标和全血样本。提取DNA后,对STAT3信号通路6个基因(IL6、IL6R、HNF1α、HNF4α、STAT3和MRP2)的25个SNP位点进行分型。结果显示在云南人群中,HCV感染与STAT3信号通路的遗传变异具有相关性。SNP位点rs4075015的基因型AA在HCV感染人群中的频率(82/394=20.8%)高于对照人群(58/395=14.7%,P=0.024)。SNP位点rs7553796的基因型AA和CC在HCV感染人群中分别显示出较低(P=0.0008)和较高(P<0.0001)的频率。同时在HCV感染者中,该位点的A和C等位基因频率分别比正常对照低(P <0.0001)和高(P<0.0001)。而HNF4α基因rs3212172的GG基因型在HCV感染者中发生频率(29/394=7.4%)较正常对照组(15/395=3.8%)明显升高(P =0.029)。分析HCV感染者的生化指标和遗传变异之间的关系后,证实HDL-C水平在携带rs4845617基因型AG的HCV患者高于携带GG基因型的患者(P=0.012)。GGT水平在携带STAT3基因rs1053023位点基因型AA的患者中明显低于携带基因型AG的患者(P=0.011)。细胞实验表明在Huh7.5.1细胞HCV感染后,HNF1α和STAT3的mRNA表达量随着时间的增加明显增高,而其他基因的mRNA表达变化不大。但是该通路基因的蛋白表达量均明显高于对照组。我们的研究首次证实STAT3信号通路的遗传变异与云南人群HCV感染及HCV感染者的生化指标具有相关性,细胞实验结果提示HCV感染后该通路基因的mRNA和蛋白表达量发生变化,且IL6转染可以降低HCV的病毒增殖。基于本项目研究,提示STAT3信号通路无论从遗传还是功能方面在HCV感染和HCV病程进展中扮演了重要的角色。项目执行期间,共发表论文6篇(5篇为SCI论文),获授权国家发明专利2项,培养硕士研究生4名。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(2)
Analysis of Biochemical Features of Hepatitis B Virus Infected Patients in Southwest China
  • DOI:
    10.7754/clin.lab.2016.160140
  • 发表时间:
    2016-01-01
  • 期刊:
    CLINICAL LABORATORY
  • 影响因子:
    0.7
  • 作者:
    Song, Yuzhu;Shen, Yunsong;Zhang, A-Mei
  • 通讯作者:
    Zhang, A-Mei
Screening mutations in drug-resistant Mycobacterium tuberculosis strains in Yunnan, China
中国云南省结核分枝杆菌耐药菌株突变筛选
  • DOI:
    10.1016/j.jiph.2017.04.008
  • 发表时间:
    2017-09-01
  • 期刊:
    JOURNAL OF INFECTION AND PUBLIC HEALTH
  • 影响因子:
    6.7
  • 作者:
    Li, Daoqun;Song, Yuzhu;Zhang, A-Mei
  • 通讯作者:
    Zhang, A-Mei
Association between genetic polymorphisms of the IL28B gene and leukomonocyte in Chinese hepatitis B virus-infected individuals.
中国乙型肝炎病毒感染者IL28B基因遗传多态性与白单细胞的相关性。
  • DOI:
    10.7717/peerj.4149
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    PeerJ
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Song Y;Shen Y;Xia X;Zhang AM
  • 通讯作者:
    Zhang AM
基因在乙型肝炎病毒感染中的作用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张成林;宋玉竹;马玉梅;张阿梅
  • 通讯作者:
    张阿梅
Mitochondrial DNAs decreased and correlated with clinical features in HCV patients from Yunnan, China
中国云南 HCV 患者线粒体 DNA 减少并与临床特征相关
  • DOI:
    10.3109/19401736.2015.1036255
  • 发表时间:
    2016-07
  • 期刊:
    Mitochondrial DNA A DNA Mapp Seq Anal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Zhang A-Mei;Ma Ke;Song Yuzhu;Feng Yue;Duan Haiping;Zhao Ping;Wang Binghui;Xu Gang;Li Zheng;Xia Xueshan
  • 通讯作者:
    Xia Xueshan

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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    刘丽
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    生命科学
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  • 作者:
    冯悦;张阿梅;岳蕾;夏雪山
  • 通讯作者:
    夏雪山
IL28B基因在HCV感染中的作用和应用前景
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    遗传
  • 影响因子:
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  • 作者:
    马柯;张阿梅;夏雪山
  • 通讯作者:
    夏雪山
蓝藻毒素的类型及其产毒基因
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    生态学杂志
  • 影响因子:
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  • 作者:
    汪洋;李樾;冯悦;张阿梅;夏雪山;刘丽
  • 通讯作者:
    刘丽

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云南省HCV感染人群C19orf66基因遗传易感性分析及其机制研究
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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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