化学表观遗传学修饰法激活植物内生真菌沉默基因挖掘抗MRSA感染新天然产物探究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:81860624
- 项目类别:地区科学基金项目
- 资助金额:35.0万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:H3403.微生物药物
- 结题年份:2022
- 批准年份:2018
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2019-01-01 至2022-12-31
- 项目参与者:杨海英; 孙静贤; 周玲; 刘赟; 胡秋月; 詹梦涛;
- 关键词:
项目摘要
Searching brand new active small molecule from microbial secondary metabolites for anti-MRSA is one of the effective way for research and exploitation of antibiotic drugs. However, the traditional high throughput screening for new anti-infective agents occupies a great deal of resource and economic costs, and the genome oriented mining emerging in recent years is inefficiency and heavy investment. In our pilot experiment, several strains from Paris polyphylla var. yunnanensis had been induced with chemical epigenetic modification. The anti-MRSA activity of 12 samples were significantly enhanced and the HPLC analysis of the secondary metabolites showed significant different compared to normal fermentation. So we put forward the hypothesis that the microbial secondary metabolites for anti-MRSA could be found quickly and efficiently by activating their silent genes/ gene cluster with chemical epigenetic modification. To test this hypothesis, kinds of DNA methyltransferase inhibitors and DNA deacetylase inhibitors were used to active the silent genes/ gene cluster of the strains from Paris polyphylla var. yunnanensis. The brand new active small molecules for anti-MRSA could be obtained by screening and bioassay-guided investigation with the method of filter paper diffusion. The research provides a new perspective view for mining brand new active small molecule from microbial secondary metabolites for anti-MRSA by activating their silent genes/ gene cluster with chemical epigenetic modification and a new train of thought for resolving the increasingly serious dilemma of anti-MRSA.
从微生物次级代谢产物出发寻找全新抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)感染活性小分子化合物,是研究和开发抗细菌感染药物的有效途径。然而,传统的高通量筛选需要耗费大量的资源成本和经济成本。我们的预实验针对多株滇重楼内生真菌以化学表观遗传修饰法进行诱导,其中12个样品抗MRSA活性显著增强,HPLC分析次生代谢产物与常规发酵相比有显著差异。为此我们提出假说,化学表观遗传修饰法激活植物内生真菌沉默基因/基因簇,或可快速高效地发现抗MRSA感染活性新天然产物。为验证这一假说,我们将采用多种DNA甲基化酶抑制剂和DNA去乙酰化酶抑制剂诱导处理多株滇重楼内生真菌,激活其沉默基因和基因簇,采用滤纸片法进行导向分离,快速发现具有抗MRSA感染的新颖化合物。本研究将利用化学表观遗传修饰法激活植物内生真菌沉默基因/基因簇,挖掘抗MRSA感染全新天然产物这个新视点,为解决日渐严峻的MRSA感染困境提供新的思路。
结项摘要
项目组在前期抗MRSA活性筛选的基础上,对10株植物内生真菌进行化学表观遗传学修饰后的次生代谢产物研究,其中的链格孢属菌株YNCA0322、拟茎点霉属菌株YNCA1227、高卢蜜环菌YNCA2012进行了放大发酵。同时对6株未经化学表观遗传学修饰的菌株进行了次生代谢产物研究。16株植物内生真菌发酵产物中共分离到169个单体化合物,其中新化合物21个,抗MRSA活性化合物52个,活性较强的11个,同时对部分化合物进行了抗肿瘤和抗病毒活性筛选。研究表明化学表观遗传修饰法可有效激活部分植物内生真菌沉默基因/基因簇,提高化合物的多样性,快速高效地发现抗MRSA活性天然产物。.项目执行期内发表研究论文9篇,其中7篇为SCI收录期刊,申请发明专利4件,完成了计划任务书规定的任务。
项目成果
期刊论文数量(9)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
茯茶中冠突曲霉的分离及比较 基因组研究
- DOI:10.13684/j.cnki.spkj.2022.05.002
- 发表时间:2022
- 期刊:食 品 科 技
- 影响因子:--
- 作者:吉巧琳;陈鑫;莫海英;蔡国磊;杨海英;杜刚
- 通讯作者:杜刚
Histone Deacetylase Inhibitor Induced Lipase Inhibitors from Endophytic Phomopsis sp. 0391
组蛋白脱乙酰酶抑制剂诱导内生拟茎点霉的脂肪酶抑制剂。
- DOI:10.25135/rnp.134.19.01.1243
- 发表时间:2020
- 期刊:Records of Natural Products
- 影响因子:1.9
- 作者:Sheng Shan-Ling;Li Yan-Ping;Xiang Hai-Ying;Liu Yun;Wang Yu-Dan;Kong Ling-Peng;Du Gang;Hu Qiu-Fen;Chen Yi-Jian;Wang Wei-Guang
- 通讯作者:Wang Wei-Guang
Comparative transcriptome analysis of Armillaria gallica 012m in response to ethephon treatment.
高卢蜜环菌 012m 对乙烯利处理反应的比较转录组分析
- DOI:10.7717/peerj.14714
- 发表时间:2023
- 期刊:PeerJ
- 影响因子:2.7
- 作者:Yang H;He K;Cao Y;Li Z;Ji Q;Sun J;Li G;Chen X;Mo H;Du G;Li Q
- 通讯作者:Li Q
Draft genomic sequence of Armillaria gallica 012m: insights into its symbiotic relationship with Gastrodia elata
Gallica 012m 基因组序列草案:深入了解其与天麻的共生关系
- DOI:10.1007/s42770-020-00317-x
- 发表时间:2020-06
- 期刊:Brazilian Journal of Microbiology
- 影响因子:2.2
- 作者:Mengtao Zhan;Menghua Tian;Weiguang Wang;Ganpeng Li;Xiaokai Lu;Guolei Cai;Haiying Yang;Gang Du;Lishuxin Huang
- 通讯作者:Lishuxin Huang
芽孢杆菌LM基于全基因组的分类鉴定及抑菌原理的研究
- DOI:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2020-1303
- 发表时间:2021
- 期刊:生物技术通报
- 影响因子:--
- 作者:蔡国磊;陆小凯;娄水珠;杨海英;杜刚
- 通讯作者:杜刚
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其他文献
模糊因果聚类模型在高炉焦比预测
- DOI:--
- 发表时间:--
- 期刊:东北大学学报(自然科学版),2005,Vol.26(4):363-366
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- 作者:郝晓静;杜刚;谢植;沈峰满
- 通讯作者:沈峰满
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- 发表时间:2019
- 期刊:中草药
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- 通讯作者:董淼
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- 期刊:上海交通大学学报
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- 作者:刁晓娣;江志斌;杜刚;姚阳
- 通讯作者:姚阳
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- 作者:邢菲菲;孙立瑛;李一博;靳世久;杜刚
- 通讯作者:杜刚
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- 发表时间:2019
- 期刊:北京交通大学学报
- 影响因子:--
- 作者:蒋翔;韦世奎;赵瑞珍;赵耀;杜雪涛;杜刚
- 通讯作者:杜刚
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