LINC00958通过调控FSCN1基因启动子组蛋白乙酰化修饰促进非小细胞肺癌进程的机制研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81802269
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1805.肿瘤表观遗传
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Non-small-cell lung cancer (NSCLC) has high incidence and mortality rates, and the therapeutic effects are unsatisfactory. In previous study, a significantly increased expression of FSCN1 mRNA in NSCLC was found, which indicated abnormal regulation at the transcription level. The preliminary experiment showed increased levels of histone acetylation in the FSCN1 promoter region and upregulated expression of acetyltransferase HAT1 in the NSCLC cell line A549. Bioinformatics analysis revealed LINC00958, a lincRNA that correlates positively with FSCN1 expression and has high expression in NSCLC. Both LINC00958 and HAT1 mRNA had binding sites with miR-342, and miR-342 was negatively correlated with the expression of LINC00958 and HAT1. Therefore, it was deduced that LINC00958 in NSCLC cells enhances HAT1 expression through miR-342 adsorption and consequently increases histone acetylation in the FSCN1 promoter region, resulting in high FSCN1 expression. Using RIP-Seq, ChIP-PCR, tumor formation in nude mice, and other experiments, this project will examine the intricate regulation mechanisms involved in abnormal FSCN1 expression during NSCLC progression, and offer new avenues to pursue clinical NSCLC treatments.
非小细胞肺癌(NSCLC)发病率及死亡率高,患者预后差。申请者发现FSCN1mRNA在NSCLC中明显升高,这说明其在转录水平调控异常。预实验结果显示在NSCLC细胞A549中FSCN1基因启动子组蛋白乙酰化修饰水平升高,同时乙酰转移酶HAT1的表达也出现上调。利用生物信息学分析,申请者发现一个与FSCN1表达呈正相关且同样在NSCLC中高表达的lncRNA:LINC00958,其和HAT1mRNA均与miR-342存在结合位点,且miR-342与LINC00958、HAT1的表达呈负相关。因此,推测在NSCLC中,LINC00958通过吸附miR-342,促进HAT1表达,进而提高FSCN1启动子乙酰化水平,最终使FSCN1高表达。本项目拟通过RIP-Seq、ChIP-PCR及裸鼠成瘤等实验,探究FSCN1在NSCLC进程中异常表达的精细调控机制,并为临床治疗NSCLC提供新的思路。

结项摘要

肺腺癌(LUAD)是肺癌最常见的组织学亚型。调节多种肿瘤恶性行为的长链非编码 RNA LINC00958在LUAD中的作用尚未阐明。采用组织微阵列、FISH和qRT-PCR检测LINC00958的表达。质粒和病毒感染用于操纵基因表达。通过动物模型的细胞增殖分析、细胞凋亡分析、细胞迁移和侵袭分析、皮下接种等方法研究了LINC00958在LUAD中的作用。同时,进行了RNA-Seq、RNA pull-down、ChIRP、ChIP和荧光素酶报告基因检测以阐明机制。与邻近组织相比,LUAD组织中LINC00958的表达显著上调,可独立预测LUAD患者的不良生存。LINC00958敲低在体外和体内显著抑制LUAD细胞的生长和转移。LINC00958定位于细胞核,调节癌基因和代谢相关和免疫反应相关基因,并与组蛋白相互作用。LINC00958的靶标是TRPV3、STAP2和EDN2具有HOXA1、NANOG、FOSL2、JUN和ATF4基序的启动子。此外,HOXA1过表达减轻了LINC00958敲低诱导的致癌表型。在LINC00958的顺式元件处检测到的MYC/MAX基序反式激活了LINC00958启动子。MYC/MAX-反式激活的LINC00958通过募集HOXA1和诱导致癌重编程促进LUAD的恶性行为。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
MYC/MAX-Activated LINC00958 Promotes Lung Adenocarcinoma by Oncogenic Transcriptional Reprogramming Through HOXA1 Activation.
MYC/MAX 激活的 LINC00958 通过 HOXA1 激活致癌转录重编程促进肺腺癌
  • DOI:
    10.3389/fonc.2022.807507
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    Frontiers in oncology
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Zhang T;Su F;Lu YB;Ling XL;Dai HY;Yang TN;Zhang B;Zhao D;Hou XM
  • 通讯作者:
    Hou XM

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其他文献

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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
    IEEE TRANSACTIONS ON PLASMA SCIENCE
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    张涛;国伟;苏子舟
  • 通讯作者:
    苏子舟
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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TP53突变介导肿瘤免疫微环境改变促进肺腺癌细胞免疫逃逸的机制研究
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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