全球数值天气预报谱模式的高效可扩展并行计算技术研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41875121
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    62.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0511.大气数值模式发展
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2022-12-31

项目摘要

With the improvement of the resolution, the computation complexity of the global spectral numerical weather prediction model increases rapidly. At the same time, the communication overhead increases rapidly too. Especially, with more and more processors used, the influence of the communication overhead is more and more serious, which prohibits the highly efficient execution on large-scale parallel computers and becomes a serious challenge to real-time requirement. Thus, it has become one of the hot researches in the world.. In this project, we will investigate from three levels, including memory access, communication hiding, and algorithm improvement, based on the available global spectral model and the known advanced high-performance computational techniques in this area over the world. Four topics will be focused on, that is, the highly scalable one-sided communication for spectral transforms, the highly efficient overlapping of computation and communication and its optimization, the self-adaptive communication in the parallel computation of semi-Lagrange scheme, and the migration of horizontal derivatives from spectral space to grid point space. The objective is to reduce the influence of the communication overhead as largely as possible and improve the computation efficiency and the scalability of the global spectral model, which is the basis to run spectral numerical weather prediction with very high resolution on future exascale computer systems, and to improve the accuracy of the global numerical weather prediction.
全球数值天气预报谱模式随分辨率的提高,计算复杂性大幅增长,同时通信开销也大幅增长,特别是随处理器的不断增加,通信开销的影响越来越大,导致无法在大规模并行计算机上进行高效执行,对数值天气预报的实时性要求形成严峻挑战,从而成为当前国际上的研究热点之一。本项目从存储访问、通信隐藏、算法改进等三个层面,以现有全球数值天气预报谱模式为依托,在国际上全球谱模式已有高性能并行计算技术的基础上,重点研究谱变换的高效可扩展单边通信、计算与通信的高效重叠优化、半Lagrange方案并行计算的自适应通信、水平导数从谱空间到格点空间的迁移等技术,以最大程度减少通信开销的影响,提高全球谱模式的计算效率与可扩展性,为我国未来在E级计算机系统上采用超高分辨率谱模式进行数值天气预报,从而进一步提高预报准确性奠定并行计算技术基础。

结项摘要

在超大规模高性能并行计算系统上进行数值天气预报时,影响数值预报计算效率与可扩展性的因素主要是通信开销的大幅增长。本项目针对全球谱模式,主要从高效可扩展单边通信、计算与通信的高效重叠优化、半Lagrange方案并行计算的自适应通信、水平导数从谱空间到格点空间的迁移等方面进行了研究。1)在高效可扩展单边通信方面,将单边通信技术引入到半拉格朗日插值阶段中并进行了高效实现。实验结果表明,该技术不仅有效减少了通信次数和通信量,也有效减少了全球谱模式的并行执行时间。2)在计算与通信的高效重叠优化技术方面,进行了多项研究。其一是对采用三维数据重分布的全球谱模式,从整体框架上进行了计算通信重叠优化方案的设计,在此基础上,针对结构网格下Fourier变换前后的计算通信重叠进行了具体设计实现,并通过数值实验进行了有效性验证。其二是针对半拉格朗日插值,进行了基于物理量分组的计算通信重叠方案设计与实现,实验结果表明,该技术有效隐藏了通信开销,进而提高了并行计算可扩展性。其三是针对按物理量分组时存在分组数受限的问题,设计实现了基于垂直层分组的计算通信重叠方案,通过寻求最优组数与计算通信重叠相结合的方式最大程度缩减并行执行时间,并通过数值实验进行了测试验证。3)在半Lagrange方案并行计算的自适应通信方面,利用再分析数据对逐月最大风进行了统计分析,之后以逐月最大风代替原全局最大风,设计实现了基于逐月自适应最大风的半拉格朗日并行计算方案。实验结果表明,其能在几乎不改动程序代码的情况下,有效减少YHGSM的并行执行时间。4)在水平导数从谱空间到格点空间的迁移方面,对全球静力谱模式进行了水平导数计算从谱空间转换到格点空间时的推导与重整,并基于有限体积法进行了高效实现,通过数值实验验证了该方法能显著减少执行时间。之后,将该方法推广应用到全球非静力谱模式,实验结果表明,其对执行时间的减少更为显著。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(1)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(4)
专利数量(1)
One-sided on-demand communication technology for the semi-Lagrange scheme in the YHGSM
YHGSM中半拉格朗日方案的单边按需通信技术
  • DOI:
    10.1002/cpe.5586
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    Concurrency and Computation: Practice and Experience (CCPE)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Jiang Tao;Guo Peiming;Wu Jianping
  • 通讯作者:
    Wu Jianping
基于局部通信的有限元分析并行算法优化研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    计算力学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴建平;蒋涛;彭军;银福康;杨锦辉
  • 通讯作者:
    杨锦辉
PAGCM: A scalable parallel spectral‐based atmospheric general circulation model
PAGCM:基于可扩展的并行光谱的大气环流模型
  • DOI:
    10.1002/cpe.5290
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Concurrency and Computation: Practice and Experience
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Ren Xiaoli;Juan Zhao;Xiaoyong Li;Kaijun Ren;Junqiang Song;Difu Sun
  • 通讯作者:
    Difu Sun
Optimization of the parallel semi-Lagrangian scheme based on overlapping communication with computation in the YHGSM
YHGSM中基于通信与计算重叠的并行半拉格朗日方案的优化
  • DOI:
    10.1002/qj.4023
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    Quarterly Journal of the Royal Meteorological Society
  • 影响因子:
    8.9
  • 作者:
    Jiang Tao;Wu Jianping;Liu Zhaoyang;Zhao Wenpeng;Zhang Yongshun
  • 通讯作者:
    Zhang Yongshun
全球数值天气预报谱模式的实时性挑战与应对
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    气象水文装备
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴建平;银福康;杨锦辉;郭沛明;蒋涛
  • 通讯作者:
    蒋涛

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其他文献

南北构造带岩石圈结构和地震的研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    地球物理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王椿镛;杨文采;吴建平;丁志峰
  • 通讯作者:
    丁志峰
半干旱灌区黑麦新品系的草产量和营养价值研究
  • DOI:
    10.13432/j.cnki.jgsau.2018.04.017
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    甘肃农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    代寒凌;田新会;杜文华;吴建平
  • 通讯作者:
    吴建平
天地一体化信息网络域间路由协议NTD-BGP
  • DOI:
    10.16511/j.cnki.qhdxxb.2019.21.012
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    清华大学学报(自然科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨增印;吴茜;李贺武;吴建平
  • 通讯作者:
    吴建平
中国氮沉降研究概况综述(英文)
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    南昌工程学院学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    吴建平;黄国敏;刘文飞;袁颖红;樊后保;WU Jianping1,2,HUANG Guomin3,LIU Wenfei1,2,YUAN Yi;2.Key Laboratory of Soil;Plant Ecology,Jiangxi;3.Hawkesbury Institute for the Environment,Univers
  • 通讯作者:
    3.Hawkesbury Institute for the Environment,Univers
杉木人工林凋落物生态化学计量与土壤有效养分对长期模拟氮沉降的响应
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生态学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    沈芳芳;吴建平;樊后保;郭晓敏;雷学明;沃奇东
  • 通讯作者:
    沃奇东

其他文献

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吴建平的其他基金

全球数值天气预报谱模式中地形效应描述优化技术研究
  • 批准号:
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混凝土细观力学模拟的代数多重网格预条件及其并行算法研究
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  • 批准年份:
    2013
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    面上项目
混凝土细观数值模拟中的高效并行预条件技术研究
  • 批准号:
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  • 批准年份:
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  • 资助金额:
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  • 项目类别:
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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