细胞质HSP70和HSP90基因结构及拷贝数与甲藻温度耐受性的相关性研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41906140
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    26.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0605.海洋生态学与环境科学
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

In the last three decades, the frequency of dinoflagellate blooms increased in global ocean, and it could be worse in the future. These phenomena are likely close related to the increasing ocean temperaure under the background of climate change. The harmful algal bloom (HAB) causative species that with proper thermal niche could be adaped to the increasing ocean temperature and cause the HABs. The thermal niche of these HAB causative species should be determined by the genes involved in the temperature adaption process. The cytosolic heat shock protein 70 (HSP70) and heat shock protein 90 (HSP90) are genes that are widely involved in the temperature stress resistance in various organisms. Some of evidences have implied that the cytosolic HSP70 and HSP90 responded to temperature stress in dinoflagellates, and the gene structure and copy numbers of them might quite differ among species. However, the correlation of the gene structure and copy numbers of cytosolic HSP70 and HSP90 and thermal niche of dinoflagellates are still unknown. On the basis of our previous works, the gene structure, copy numbers and the expression patterns of cytosolic HSP70 and HSP90, and thermal niche of various causative dinoflagellates of HAB will be determined in this project. Furthermore, the correlation of gene structure, copy numbers of cytosolic HSP70/HSP90 and thermal niche of dinoflagellates will be analyzed. The results will provide the scientific evidence for in-depth revealing the HAB expanding mechanism in the context of climate change, and might also provide the scientific data for developing the new methods of forecasting and monitoring of HAB in the future.
近30年来全球有害甲藻藻华呈现扩张趋势,并预测在未来可能会更加严重。这种现象的发生与气候变化背景下的海洋温度升高可能密切相关,具有相应温度耐受性的有害藻华原因种,更能适应海洋温度的升高而引发藻华,这必然与一些调控温度耐受性的基因相关。热激蛋白70(HSP70)和热激蛋白90(HSP90)是与生物体适应温度变化密切相关的基因,研究数据表明细胞质HSP70和HSP90在一些甲藻中能被温度所调控,而它们在不同甲藻间的基因结构以及拷贝数可能差异较大,但这种差异性是否与甲藻温度耐受性相关,尚不明晰。本项目拟通过研究多种甲藻藻华原因种细胞质HSP70和HSP90基因的结构、拷贝数和不同温度下的表达模式,以及目标甲藻的温度耐受性,解析细胞质HSP70和HSP90基因结构及拷贝数与甲藻温度耐受性的关系,为深度揭示气候变化背景下甲藻藻华扩张机制,及为未来开发有害藻华预测和预警的新方法提供科学依据。

结项摘要

近30年来全球有害甲藻藻华呈现扩张趋势,并预测在未来可能会更加严重。这种现象的发生与气候变化背景下的海洋温度升高可能密切相关,具有相应温度耐受性的有害藻华原因种,更能适应海洋温度的升高而引发藻华。热激蛋白70(HSP70)和热激蛋白90(HSP90)是与生物体适应温度变化密切相关的基因,它们在不同有害甲藻原因种之间的差异性以及在温度适应性中的作用尚不明晰。本项目测定了多种有害藻华原因种在不同温度下的生长速率以及温度耐受范围,揭示了他们的最适生长温度以及温度耐受范围;测定了多种甲藻的HSP70和HSP90基因的拷贝数,并研究了拷贝数和温度耐受性之间的关系,以及它们在甲藻经过长期温度适应后的转录表达差异。研究结果显示HSP70和HSP90的拷贝数在甲藻中普遍较高,拷贝数可从几百到数百万拷贝,相关性分析显示基因拷贝数与温度耐受性之间的关系相关性较弱,HSP70和HSP90的拷贝数与基因组大小关系更为密切;转录组分析显示HSP70和HSP90多种转录本可应答于长期温度变化,但不同拷贝间的表达差异显著。研究结果表明,甲藻具有较高的HSP70和HSP90基因拷贝数,且它们在温度适应过程中发挥着重要的调控作用。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Toxic effect of nickel on microalgae Phaeodactylum tricornutum (Bacillariophyceae)
镍对微藻三角褐指藻(硅藻纲)的毒性作用
  • DOI:
    10.1007/s10646-022-02532-8
  • 发表时间:
    2022-04-01
  • 期刊:
    ECOTOXICOLOGY
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Guo, Ruoyu;Lu, Douding;Dai, Xinfeng
  • 通讯作者:
    Dai, Xinfeng
Microbial community structures and important taxa across oxygen gradients in the Andaman Sea and eastern Bay of Bengal epipelagic waters.
安达曼海和东孟加拉湾表层水域氧梯度上的微生物群落结构和重要类群
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2022.1041521
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Guo, Ruoyu;Ma, Xiao;Zhang, Jingjing;Liu, Chenggang;Thu, Chit Aung;Win, Tun Naing;Aung, Nyan Lin;Win, Hlaing Swe;Naing, Sanda;Li, Hongliang;Zhou, Feng;Wang, Pengbin
  • 通讯作者:
    Wang, Pengbin

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其他文献

东海原甲藻藻华与台湾暖流关系的进一步研究.
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    海洋学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾宇兰;陆斗定;王鹏斌;郭若玉;管卫兵;戴鑫烽
  • 通讯作者:
    戴鑫烽
东海原甲藻藻华和台湾暖流种源关系的进一步研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    海洋学研究
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾宇兰;陆斗定;王鹏斌;郭若玉;管卫兵;戴鑫烽
  • 通讯作者:
    戴鑫烽
长江口甲藻孢囊与水体富营养化和厄尔尼诺指数关系研究
  • DOI:
    10.12284/hyxb2021004
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    海洋学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    戴鑫烽;冷天泽;李东融;王鹏斌;郭若玉;王瑞芳;陆斗定
  • 通讯作者:
    陆斗定
2018年春季福建近海浮游植物群落结构变化
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
    广东海洋大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曾宇兰;陆斗定;王鹏斌;郭若玉;管卫兵;戴鑫烽
  • 通讯作者:
    戴鑫烽

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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