分离与克隆仔猪抗ETEC F4ac腹泻位置候选基因－MUC4基因

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    30960248
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
  • 资助金额：
    24.0万
  • 负责人：
    晏学明
  • 依托单位：
    江西科技师范大学
  • 学科分类：
    C1702.家畜种质资源与遗传育种学
  • 结题年份：
    2012
  • 批准年份：
    2009
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2010-01-01 至2012-12-31
  • 项目参与者：
    刘三凤； 黄翔； 季华员； 张水印； 刘新平； 黄建华； 杨凤梅； 杨明； 韩鹏飞；
  • 关键词：
    MUC4基因ETEC猪F4ac

项目摘要

产肠毒素大肠杆菌F4ac（ETEC F4ac）是引发新生仔猪腹泻病的主要病原菌。本项目拟在课题组已将ETEC F4ac受体基因精细定位至约3.5cM染色体区域基础上，结合受体的理化特性选择该区域内的MUC4基因作为ETEC F4ac受体的重要位置候选基因开展研究。拟通过RT-PCR和5'、3'RACE技术，分离和克隆猪MUC4基因全长cDNA ，利用生物信息学和比较基因组法克隆并测定MUC4基因全长DNA序列。在此基础上采用直接测序法开展大规模SNP搜寻和鉴别，在已有经黏附表型测定的15个中、西方猪种远缘群体292个个体中使用SNaPSHOT技术、飞行时间质谱技术等对这些SNP进行多态性检测，与黏附表型进行关联性分析，经功能性验证分析，最终确定因果突变位点，为猪ETEC F4ac侵染腹泻的抗病育种提供准确而高效的选育手段。

结项摘要

产肠毒素大肠杆菌（ETEC）F4ac造成的断奶前仔猪腹泻病是养猪生产中的常见病，给世界养猪业造成了巨大经济损失。本研究面对这一现状，在课题组已将ETEC F4ac 受体基因精细定位至较小区域基础上，结合生理生化分析，选择该区域内的MUC4基因作为ETEC F4ac受体的重要位置候选基因开展研究，通过RT-PCR和5’, 3’RACE技术分离和克隆到了猪MUC4基因全长cDNA ，利用比较基因组和生物信息学方法克隆并测定了MUC4基因全长DNA序列。在此基础上采用比较测序法对MUC4基因及其侧翼序列130kb区域内开展大规模SNP搜寻和鉴别，共鉴别到104个SNP，选择其中70个SNP在292头远缘群体（包含12个中国地方猪种和3个国外猪种）中使用SNaPSHOT技术、飞行时间质谱技术等进行基因分型，并与黏附表型进行关联性分析，结合基因表达分析以及目的区域的重组断点事件分析等严谨的遗传学分析手段，最终确定了决定仔猪ETEC F4ac腹泻易感性的基因为MUC13基因，MUC4基因仅为与MUC13基因毗邻并处于高度连锁不平衡状态的一个重要的标记基因。鉴于MUC4基因重要的生理生化功能，本研究还开展MUC4基因的进化研究，结果显示中西方猪群在MUC4基因区域均存在丰富的多态性，但它们在该区域的进化存在一定的分歧。同时深入开展了MUC13基因的研究，分离克隆到了MUC13基因全长cDNA和DNA序列，并发现了能准确鉴别易感个体和抗性个体的分子标记（准确率>97%），由此首次在国际上创建了高精准度的断奶前仔猪腹泻抗病育种新技术，并利用所创建的分子育种新技术进行大面积推广应用，实现了我国种猪遗传改良研究的重要自主创新。

项目成果

期刊论文数量（3）
专著数量（0）
科研奖励数量（2）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Nucleotide variability and linkage disequilibrium patterns in the porcine MUC4 gene.
猪MUC4基因的核苷酸变异性和连锁不平衡模式
  • DOI：
    10.1186/1471-2156-13-57
  • 发表时间：
    2012-07-13
  • 期刊：
    BMC genetics
  • 影响因子：
    2.9
  • 作者：
    Yang M;Yang B;Yan X;Ouyang J;Zeng W;Ai H;Ren J;Huang L
  • 通讯作者：
    Huang L
Susceptibility towards enterotoxigenic Escherichia coli F4ac diarrhea is governed by the MUC13 gene in pigs.
猪对产肠毒素大肠杆菌 F4ac 腹泻的易感性由 MUC13 基因控制
  • DOI：
    10.1371/journal.pone.0044573
  • 发表时间：
    2012
  • 期刊：
    PloS one
  • 影响因子：
    3.7
  • 作者：
    Ren J;Yan X;Ai H;Zhang Z;Huang X;Ouyang J;Yang M;Yang H;Han P;Zeng W;Chen Y;Guo Y;Xiao S;Ding N;Huang L
  • 通讯作者：
    Huang L
FUT1基因新cSNPs的鉴别及其对仔猪抗大肠杆菌F18侵染的影响
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国农业科学
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    周利华;舒青龙;彭秋玲;郭源梅;晏学明.
  • 通讯作者：
    晏学明.

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晏学明的其他基金

解析影响江西兴国灰鹅咽袋形成的分子遗传机理
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2020
  • 资助金额：
    35 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
解析影响家鸭翅长主效位点的分子机理
  • 批准号：
    31660302
  • 批准年份：
    2016
  • 资助金额：
    45.0 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目
鉴别仔猪抗大肠杆菌F4ac侵染的MUC13基因因果突变
  • 批准号：
    31460591
  • 批准年份：
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    52.0 万元
  • 项目类别：
    地区科学基金项目

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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