古菌Sulfolobus tokodaii甘油醛脱氢酶及其对非磷酸化Entner-Doudoroff糖酵解代谢的调控机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    30900039
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    20.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2012
  • 批准年份:
    2009
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2010-01-01 至2012-12-31

项目摘要

古菌"中心代谢途径"-糖酵解具有独特的代谢路径并由许多特异性糖酵解酶催化。古菌中心代谢途径的研究,对于了解生命的起源、进化以及开发利用新的生物资源具有重要意义。研究表明,泉古菌Sulfolobus属利用Entner-Doudoroff(ED)途径进行糖酵解,其又可分为半磷酸化与非磷酸化的ED途径。然而,对于Sulfolobus属古细菌非磷酸化的ED途径中的一个关键酶-甘油醛脱氢酶,至尽仍不清楚。甘油醛脱氢酶催化古菌非磷酸化ED途径中三碳化合物转化过程的第一步反应-甘油醛氧化为甘油酸。本研究将首次从极端嗜热酸性古菌Sulfolobus tokodaii中克隆、表达可能参与该古菌非磷酸化ED途径的甘油醛脱氢酶基因,并从古菌细胞培养液中对甘油醛脱氢酶进行纯化,详细研究其底物特异性、催化特性、动力学等酶学性质,并揭示其在酶活性水平上对古菌非磷酸化ED糖酵解途径的调控机制。

结项摘要

本项目旨在鉴定参与极端嗜热酸性古菌Sulfolobus tokodaii非磷酸化Entner-Doudoroff葡萄糖酵解途径的甘油醛脱氢酶及其调节机制。为此,我们对古菌Sulfolobus tokodaii进行了培养,提取其基因组并克隆、表达与纯化可能的甘油醛脱氢酶(ST2484,ST0064,ST1116,ST2247)。我们对上述基因的酶学性质进行了研究,发现ST0064基因能催化乙醛、甘油醛、丙醛等一系列醛类底物的氧化,负责该古菌一系列醛类化合物的转化,被称为乙醛脱氢酶(stALDH)。研究发现,除乙醛外,该酶对D甘油醛以及DL甘油醛均具有较强的活性,其辅酶利用效率为NAD>NADP。酶蛋白具有很强的热稳定性,其活性可被氧化剂双氧水及硝化甘油(GTN)抑制,还原剂DTT、硫辛酸以及-巯基乙醇能够恢复被抑制的活性。此外,我们发现辅酶NAD以及NADP能够调节酶的热稳定性以及该酶的酯酶活性。进一步,我们对该蛋白质进行了分子建模,并通过结构模拟与序列分析鉴定了酶的关键催化残基E240与C274,以及酶与辅助因子NAD相互作用的关键氨基酸残基N142,K165,I168和E370。通过突变分析与生化功能验证,揭示了该酶与辅因子相互作用的分子机制。以上研究结果不但为开发高效、环保的工业用醛类化合物转化酶类提供了良好的素材,而且对于进一步研究乙醛脱氢酶这一生物体内重要的有机化合物转化酶类的催化机理以及进化机制具有重要意义。以上结果已发表于极端微生物领域权威杂志《Extremophiles》(影响因子2.941)。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
超嗜热古菌Sulfolobus tokodaii热稳定性乙醛脱氢酶的分子鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    Extremophiles
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    刘波
  • 通讯作者:
    刘波

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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