染色体19p13.1区域位点与中国女性三阴乳腺癌遗传易感性的研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81302487
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份:
    2016
  • 批准年份:
    2013
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2014-01-01 至2016-12-31

项目摘要

Breast cancer is a heterogeneous disease that can be divided into distinct subtypes including triple-negative. Triple-negative breast cancer (TNBC) related to poor prognosis has emerged as being of particular clinical and public health significance disease. Recently, A GWAS among European Caucasians has found that 19p13.1 is a TNBC susceptibility locus. It provides further evidence that triple-negative tumors and other subtypes likely arise through distinct etiologic pathways. However, there is a big difference in genetic structure, incidence and environmental among different races, and it is still unclear for the association between 19p13.1 and risk of TNBC in Chinese women. Therefore, it is very necessary to identify the genetic locus of 19p13.1 associated with TNBC among Chinese women. Based on Asian breast cancer GWAS, our group will firstly conduct a case-control study comprising 1000 TNBC cases and 1000 healthy controls to make fine mapping and scanning 19p13.1 locus in Chinese women. We will screen the specific SNPs associated with TNBC among Chinese women, as well as to explore the association of the region's SNPs and prognosis of TNBC. Then, we will make the validation in another 1000 TNBC cases and 1000 healthy controls to confirm the significant SNPs associated with TNBC risk. Our results will provide important evidences to demonstrate the difference of the potential genetic locus of 19p13.1 associated with TNBC in the different races. In addition, we will analyze interactions of SNP-SNP and gene-environment, which will provide valuable etiology clues to TNBC and important basis to the further functional study and new biomarker's discovery.
三阴乳腺癌是一类具有明显病因异质性的乳腺癌亚型,因缺乏有效的治疗手段预后较差,目前已成为具有重要临床和公共卫生意义的疾病。最近欧洲白人的GWAS研究发现19p13.1是三阴乳腺癌的易感区域,可能通过不同病因途径而起作用。然而,不同人种的遗传结构、发病率和环境暴露等因素存在较大差异,该易感区域与中国女性三阴乳腺癌的关系尚不清楚。本课题组拟在前期开展的亚洲乳腺癌GWAS研究基础上,首次在中国女性中开展1000对三阴乳腺癌病例对照研究,对染色体19p13.1区域进行精细定位扫描,进一步识别该区域国人特异的病因位点,探索该区域SNPs与三阴乳腺癌预后的关系。研究结果将在另外1000对独立人群验证,比较中国女性与欧洲白人易感位点的差异,论证该区域三阴乳腺癌易感位点在不同人种的作用,分析SNP之间以及SNP与环境因素的交互作用,为三阴乳腺癌的病因学研究、SNP功能验证和探索新的分子标志物提供重要依据。

结项摘要

三阴乳腺癌是一类具有明显病因异质性的乳腺癌亚型,可能出现通过不同的病因途径而起作用。由于不同人种的遗传结构,发病率,环境暴露等均存在较大差异,因此在中国人群中进行三阴乳腺癌易感性的研究,进一步识别和确定的国人病因位点,探索影响三阴乳腺癌遗传以及为未来开展功能的研究均是非常重要而且有意义的工作。近期国外GWAS研究在欧洲白人中发现19p13.1是三阴乳腺癌的易感区域,但该易感区域与中国女性三阴乳腺癌的关系尚不清楚。本研究利用Sequenom MassARRAY平台检测1000对中国三阴乳腺癌病例和健康对照中染色体19p13.1中200kb区域中所选出的28个tagSNP的基因型频率,进一步识别该区域国人特异的易感位点,分析SNP与环境因素的交互作用。结果显示:我们发现OCEL1基因rs2288542 位点频率分布与中国女性三阴乳腺癌发病风险显著相关,“C”等位基因型显著增加三阴乳腺癌发病风险(OR:1.576,95%CI:1.353-1.835)。同时我们在与环境交互作用分析中发现,与经常锻炼的妇女相比,携带rs2288542中“C”等位基因型的不经常体育锻炼妇女发生三阴乳腺癌风险更高,具有明显交互作用,为进一步的病因学解释提供了宝贵线索,也为下一步探索三阴乳腺癌的病因学研究、SNP功能验证和新的分子标志物提供重要依据。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(1)
科研奖励数量(1)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Histological Assessment of Tumor Tissue Samples via the Mirror Image Method
通过镜像法对肿瘤组织样本进行组织学评估
  • DOI:
    10.1089/bio.2014.0093
  • 发表时间:
    2015-02-01
  • 期刊:
    BIOPRESERVATION AND BIOBANKING
  • 影响因子:
    1.6
  • 作者:
    Li, Haixin;Guo, Yan;Chen, Kexin
  • 通讯作者:
    Chen, Kexin
Comparative genomic analysis reveals bilateral breast cancers are genetically independent.
比较基因组分析显示双侧乳腺癌在遗传上是独立的
  • DOI:
    10.18632/oncotarget.5569
  • 发表时间:
    2015-10-13
  • 期刊:
    Oncotarget
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Song F;Li X;Song F;Zhao Y;Li H;Zheng H;Gao Z;Wang J;Zhang W;Chen K
  • 通讯作者:
    Chen K

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其他文献

利用miRNA芯片研究胃癌发病相关的miRNA及下游信号通路分析
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    全国肿瘤流行病学和肿瘤病因学学术会议论文集
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    刘奔;王涛;郑红;李海欣;张丽娜;陈可欣;杨达;张微
  • 通讯作者:
    张微
半干旱矿区作物对土壤含水率和圆锥指数的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    安徽农业科学
  • 影响因子:
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  • 作者:
    李海欣;郄晨龙;雷少刚;陶文旷
  • 通讯作者:
    陶文旷
ASD患儿血清叶酸及其代谢产物与维生素B12水平的病例对照研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
    中国学校卫生
  • 影响因子:
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  • 作者:
    韩盼盼;姜喜涛;李海欣;武丽杰
  • 通讯作者:
    武丽杰

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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