蜜蜂以色列急性麻痹病毒聚合酶及其蛋白引物VPg复合物的结构与功能研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31802147
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    27.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1708.养蜂学
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2018
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2019-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Israeli acute paralysis virus (IAPV) is a single-stranded positive sense RNA virus from Dicistroviridae family, and the honeybee-infecting virus is related to Colony Collapse Disorder (CCD), posing a threat to apiculture and pollination. Although the studies on world epidemic, distribution, and evolution of IAPV were progressed, the fundamental research, especially the key replication protein-polymerase, was left far behind, hindering the investigation on virus replication and prevention. In the sequence analysis and initial crystal screen assay, we identified dicistrovirus specific polymerase characters and obtained an IAPV polymerase crystallization condition. Based on this, we seek to solve the crystal structures of IAPV polymerase and its complex with the protein primer VPg, characterize its enzymatic properties, and reveal its structure-and-function relationship. The expected results will not only provide a theoretical basis for the pathogenesis of dicistrovirus, but also furnish technical support for antiviral drug development targeting polymerase.
蜜蜂以色列急性麻痹病毒(IAPV)是属于双顺反子病毒科的单股正链RNA病毒,感染后可引起蜂群崩溃,严重威胁着养蜂业与授粉产业的健康发展。虽然IAPV的世界流行、分布与进化研究取得了较大进展,但是包括复制核心蛋白聚合酶在内的基础研究极为滞后,阻碍着对该病毒复制机制和病害防控的研究。通过对IAPV聚合酶深入分析,我们发现以IAPV为代表的双顺反子病毒聚合酶具有不同于其他RNA病毒聚合酶的序列特征,并且在预实验中我们筛选到了IAPV聚合酶的结晶条件。在此基础上,我们将采用X射线晶体学方法解析IAPV聚合酶及其蛋白引物VPg复合物的三维结构,通过生物化学手段研究该聚合酶的催化特征,最终阐释聚合酶在IAPV致病过程中的作用与功能。这不仅为IAPV及同类蜜蜂病毒的致病机制提供了理论指导,也为深入开展抗病毒药物开发提供技术支持。

结项摘要

蜜蜂以色列急性麻痹病毒(IAPV)是蜂群崩溃症(Colony Collapse Disorder,CCD)的重要诱因,给养蜂业和农业生产造成严重的影响。本项目旨在阐明IAPV依赖RNA的RNA聚合酶(RdRP)的结构特征与催化特性。在本项目的资助下完成了IAPV病毒RdRP两种截短体三维结构的解析,并建立起一套完整的体外生化表征体系。通过结构解析与分析发现IAPV RdRP采用经典的单股正链RNA病毒RdRP的杯状右手模型,但也存在一些具有种属特异性的区域。随后通过酶活表征实验对一些关键的分子间相互作用界面及关键区域进行了功能表征。相关研究成果阐明了IAPV RdRP的结构特征与催化特性,为后续研究奠定了良好基础,并为开发靶向聚合酶的干预策略提供新思路。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
A Structure-Function Diversity Survey of the RNA-Dependent RNA Polymerases From the Positive-Strand RNA Viruses
正链 RNA 病毒的 RNA 依赖性 RNA 聚合酶的结构功能多样性调查
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2019.01945
  • 发表时间:
    2019-08-22
  • 期刊:
    FRONTIERS IN MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Jia, Hengxia;Gong, Peng
  • 通讯作者:
    Gong, Peng
A nucleobase-binding pocket in a viral RNA-dependent RNA polymerase contributes to elongation complex stability
病毒RNA依赖性RNA聚合酶中的核碱基结合口袋有助于延长复合物的稳定性
  • DOI:
    10.1093/nar/gkz1170
  • 发表时间:
    2020-02-20
  • 期刊:
    NUCLEIC ACIDS RESEARCH
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Shi, Wei;Ye, Han-Qing;Gong, Peng
  • 通讯作者:
    Gong, Peng
Structural insight into the length-dependent binding of ssDNA by SP_0782 from Streptococcus pneumoniae, reveals a divergence in the DNA-binding interface of PC4-like proteins
对肺炎链球菌 SP_0782 与 ssDNA 的长度依赖性结合的结构深入了解,揭示了 PC4 样蛋白的 DNA 结合界面的差异
  • DOI:
    10.1093/nar/gkz1045
  • 发表时间:
    2019-11
  • 期刊:
    Nucleic Acids Research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Lu Guoliang;Li Shuangli;Fang Xiang;Ramelot Theresa A.;Kennedy Michael A.;Zhou Xin;Gong Peng;Zhang Xu;Liu Maili;Zhu Jiang;Yang Yunhuang
  • 通讯作者:
    Yang Yunhuang
An induced-fit de novo initiation mechanism suggested by a pestivirus RNA-dependent RNA polymerase.
瘟病毒 RNA 依赖性 RNA 聚合酶提出的诱导拟合从头启动机制
  • DOI:
    10.1093/nar/gkab666
  • 发表时间:
    2021-09-07
  • 期刊:
    Nucleic acids research
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Zhang BY;Liu W;Jia H;Lu G;Gong P
  • 通讯作者:
    Gong P

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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