海洋细菌应答DMSP趋化作用的受体鉴定和互作识别机制

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31900089
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    23.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0106.微生物与环境互作
  • 结题年份:
    2022
  • 批准年份:
    2019
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2020-01-01 至2022-12-31

项目摘要

DMSP is the most abundant sulfur-containing organic compound in the marine environment. Marine microbe breaks it down to dimethylsulfide, and release it into the atmosphere. The emitted DMS can act as cloud condensation nuclei, leading to an increasing amount of sunlight reflected back into space, and then affect the global climate. However, the biological function of this reaction for the marine microbes is still unknown. Based on our previous study on Alcaligenes faecalis J481 DMSP lyase knockout mutant showed lost the chemotaxis response to DMSP. This result reveals that DMS is the key signal molecule in the A. faecalis J481 DMSP chemotaxis process. To this end, in this proposal, we attempt to identify the chemoreceptor gene which could recognize DMS from 8 chemoreceptor genes in the A. faecalis J481 genome. And identify the interaction between the receptor and the DMS molecule. Also important is to identify the kinetics data of the receptor-ligand interaction. And also the subcellular localization of the receptor and structure detail analysis based on receptor-ligand co-crystallization. This study will reveal the molecular mechanism interaction between DMS and the receptor during A. faecalis J481 chemotaxis to DMSP. And also provide examples for us to understand DMSP and DMSP lyases in vivo function in the marine environment.
β-二甲基巯基丙酸(DMSP)是海洋环境中重要的含硫有机化合物,会被海洋中的微生物降解并释放出挥发性气体二甲基硫醚(DMS)。DMS进入大气层后可以作为云凝结核,提高云层反射率和降水,进而影响全球气候。然而目前关于该酶促过程的生物学意义所知甚少。在前期研究中发现,粪产碱菌J481中DMSP裂解酶基因dddY的缺失突变株表现出失去对DMSP的趋化作用。表明,DMS是该菌株中对DMSP趋化作用过程中的关键信号分子。本研究拟从8个候选基因中鉴定出该菌株中识别DMS的趋化受体基因,并且通过荧光热变分析法、等温滴定微量热法、蛋白的亚细胞定位以及蛋白质晶体结构解析等方法深入研究受体蛋白与DMS的相互作用机制。本项目的研究结果将解释DMSP趋化作用过程中信号分子DMS与受体的相互作用及其分子机制,同时完善我们对DMSP以及DMSP裂解酶在海洋微生物细胞内的功能。

结项摘要

β-二甲基巯基丙酸(DMSP)是海洋环境中重要的含硫有机化合物,会被海洋中的微生物降解并释放出挥发性气体二甲基硫醚(DMS)。DMS进入大气层后可以作为云凝结核,提高云层反射率和降水,进而影响全球气候。然而目前关于该酶促过程的生物学意义所知甚少。..本研究通过基因组挖掘,从粪产碱菌J481中一共找到了8个趋化受体基因。通过构建双交换敲除菌株以及回补,我们首次鉴定了细菌中能够识别DMS的趋化受体基因。并且通过荧光热变分析以及等温滴定微量热法研究了该受体蛋白与DMS的相互作用机制。本研究结果解释了DMSP趋化作用过程中信号分子DMS与受体的相互作用及其分子机制,同时帮助我们理解对DMSP以及DMSP裂解酶在海洋微生物细胞内的功能。

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
海洋细菌粪产碱菌 J481 中 DMS 趋化受体的鉴定
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    赵丽君;谢珂;杨江科;雷磊
  • 通讯作者:
    雷磊

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  • 期刊:
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  • 作者:
    谭展望;雷磊
  • 通讯作者:
    雷磊

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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