猪链球菌噬菌体穿孔素(holin)的膜拓扑结构与功能解析

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31172381
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    61.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1809.临床兽医学
  • 结题年份:
    2015
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

猪链球菌2型是重要的人兽共患病原菌,菌株多呈严重耐药和多重耐药,抗生素应用面临挑战,基于噬菌体的抗菌策略再现潜力。噬菌体穿孔素(Holin)具有介导细菌裂解的功能,但猪链球菌噬菌体的裂菌机制尚不清楚。本研究将聚焦猪链球菌噬菌体穿孔素,通过构建穿孔素重组λ噬菌体,基于大肠杆菌遗传体系,采用半胱氨酸定点突变扫描技术,解析穿孔素的膜拓扑结构;通过定位突变,分析穿孔素的双起始基序,揭示穿孔素不同跨膜区、功能域及关键氨基酸对触发细菌裂解的作用;构建穿孔素-GFP表达系统,应用反卷积荧光显微镜,观察穿孔素在细胞膜上的实时定位特征;采用化学交联技术和原子力显微镜,分析穿孔素在细胞内外的寡聚形式、成孔形状、孔径大小等,解析穿孔素的成孔模式。通过研究,初步揭示猪链球菌噬菌体穿孔素介导的裂解触发机制,为研发基于噬菌体裂解系统的新型抗菌制剂提供理论依据和技术支撑,也为研究革兰阳性菌噬菌体的裂菌触发机制提供参考。

结项摘要

穿孔素(holin)是由噬菌体编码的裂菌相关功能蛋白,具有抗菌应用潜能,但国内外对猪链球菌噬菌体穿孔素鲜有研究。本项目聚焦猪链球菌噬菌体穿孔素(HolSMP)的结构与功能,系统分析了穿孔素的基因结构和双起始基序,明确了穿孔素的亚细胞定位,解析了穿孔素膜拓扑结构与胞外裂菌功能,揭示了穿孔素的膜成孔特征,初步阐明了猪链球菌噬菌体穿孔素的触发裂菌机制。.基于生物信息学分析发现,穿孔素基因(HolSMP)定位于裂解酶基因(LySMP)上游,位于基因组7267-7695位,全长429bp。HolSMP基因可补偿穿孔素基因缺陷型λ 噬菌体的噬菌斑形成功能。该基因在大肠杆菌中表达可导致细菌裂解,并且能量毒素氰化钾可提前触发HolSMP形成跨膜通道,引起菌体裂解。同时穿孔素HolSMP和裂解酶LySMP的共表达可迅速触发细菌裂解,发挥胞内协同裂菌功能。.HolSMP的转录与表达特征显示,噬菌体感染宿主菌后20min,HolSMP基因开始转录和表达,于60min时达峰值,呈现触发裂菌特征。基于膜蛋白提取技术、蛋白免疫印迹分析和基于GFP-HolSMP融合蛋白的共聚焦显微镜观察,发现HolSMP定位于细胞膜,其动态变化特征呈现λ 噬菌体穿孔素的触发裂菌模式。.穿孔素HolSMP含有10个由“ATG”编码的甲硫氨酸,以前5个“ATG”为起始密码子的HolSMP片段均可导致裂菌,其中以第五个“ATG” 为起始密码子的,其触发裂菌时间点提前20 min,而该密码子发生突变后却又导致裂菌触发延迟15 min。提示HolSMP具有与λ 噬菌体穿孔素S基因相似的穿孔素-抗穿孔素(holin-antiholin) “双起始”基序。.基于半胱氨酸定点突变扫描技术(SCAM)解析了穿孔素HolSMP的膜拓扑结构,揭示了穿孔素的关键氨基酸在膜内外的分布特征。发现G35C、T80C和Y105C三个关键位点分布于细胞膜内,分别参与形成三个跨膜区。其N-端和C-端均位于膜外,其中N-端位于细菌细胞周质,C-端位于细胞质,提示HolSMP具有Ⅰ型穿孔素的结构特征。进一步研究发现,缺失任一跨膜区均会导致穿孔素活性降低或丧失,而且,跨膜区单个氨基酸突变亦显著影响穿孔素功能,提示穿孔素裂菌功能对其编码序列十分敏感。.基于HolSMP的触发裂菌特点、双起始基序特征和膜拓扑结构,提示其具有类似λ噬菌体穿孔素的触发裂菌机制。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
[Current advance in the topological structure and function of holin encoded by bacteriophage lambda--a review]
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    Acta Microbiologica Sinica
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Y. Shi;J. Sun
  • 通讯作者:
    J. Sun
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  • DOI:
    --
  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杜斌;邹绮;严亚贤;孙建和
  • 通讯作者:
    孙建和
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  • DOI:
    10.1186/1743-422x-9-70
  • 发表时间:
    2012-03-22
  • 期刊:
    Virology journal
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Shi Y;Yan Y;Ji W;Du B;Meng X;Wang H;Sun J
  • 通讯作者:
    Sun J
猪链球菌二氢硫辛酰胺脱氢酶的原核表达及其粘附相关功能初探
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    上海交通大学学报(农业科学版)
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张静;孙建和
  • 通讯作者:
    孙建和
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应用噬菌体溶素破坏动物病原体猪链球菌形成的生物膜
  • DOI:
    10.1128/aem.05151-11
  • 发表时间:
    2011-12-01
  • 期刊:
    APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
  • 影响因子:
    4.4
  • 作者:
    Meng, Xiangpeng;Shi, Yibo;Yan, Yaxian
  • 通讯作者:
    Yan, Yaxian

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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