长爪沙鼠Willis环变异缺失与微卫星多态性及相关基因研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31071988
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    36.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0405.动物资源与保护
  • 结题年份:
    2013
  • 批准年份:
    2010
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

脑血管畸形是脑血管病发生的高危因素。以往的研究表明长爪沙鼠脑底动脉Willis环存在多种变异缺失类型,我们前期研究发现Willis环的变异缺失类型有明显的遗传性,并与某些微卫星位点呈相关性。因此我们推断决定Willis环变异缺失的基因改变引起了连锁微卫星位点的多态性发生,通过这些位点可以找到相关基因。本研究拟通过已筛选出的微卫星位点对Willis环变异缺失不同表型的长爪沙鼠基因组进行相关性分析,筛出与Willis环相关的微卫星位点。以这些位点为探针,对基因组文库进行杂交,应用生物信息学方法对阳性克隆的序列与已知的脑血管畸形相关基因进行同源性分析;同时采用抑制消减杂交技术(SSH)在表达水平上进行分析,从而确定Willis环变异缺失相关基因。本研究将在比较医学层面为脑血管疾病风险评估提供重要依据,为深入研究脑血管畸形发生机制开拓新途径,也将成为长爪沙鼠Willis环变异缺失鉴定的有力工具。

结项摘要

脑血管畸形是脑血管病发生的高危因素。国内外的报道均表明长爪沙鼠脑底动脉Willis环存在多种变异缺失类型,提示长爪沙鼠脑底动脉Willis环是研究脑血管畸形的良好材料。我们前期研究发现Willis环的变异缺失类型有明显的遗传性,并与某些微卫星位点呈相关性。因此我们推断决定Willis环变异缺失的基因改变引起了连锁微卫星位点的多态性发生,通过这些位点可以找到相关基因。鉴于此,本课题开展了以下两部分研究工作:(1)通过已筛选出的137个微卫星位点对Willis环变异缺失不同表型的长爪沙鼠基因组进行相关性分析,经过127只动物验证后发现,有4个微卫星位点位点与Willis环的变异缺失高度相关,其中位点AF200941所扩增出的139bp差异等位基因片段在B型(前交完整后交缺失)与D型(前交完整后交完整)间存在显著性差异,相关系数为0.519,也就是说与后交类型显著相关;位点D6Mit37所扩增出的261bp差异等位基因片段在C型(前交缺失后交缺失)与D型(前交完整后交完整)间存在显著性差异,相关系数为0.400,即与前后交的缺失均相关;位点D16Mit7扩增出的480bp差异等位基因片段在B(前交完整后交缺失)组与C组(前交缺失后交缺失)间存在显著性差异,相关系数为0.423,即与前交缺失相关;位点D13Mit14扩增出的差异等位基因片段300bp在Willis环D型(前交完整后交完整)和B型(前交完整后交缺失)间存在显著性差异,相关系数达0.751,也就是说与后交通支类型显著相关。用不同Willis环类型的长爪沙鼠构建基因组文库,通过这些微卫星序列设计探针进行原位杂交,获得的阳性克隆测序,结果没有发现与血管发育相关的基因。(2)选取不同类型Willis环动物的脑底动脉及其周围组织提取mRNA,合成cDNA后进行抑制削减杂交(SSH),所获差异片段构建了不同类型Willis环差异基因SSH文库6个。对这些SSH文库进行测序后,共获得304个NCBI上已收录的基因,其中血管发育相关基因16个,经RT-PCR和Real-time PCR进一步验证后确定有4个基因在不同Willis环类型中的表达有显著差异,分别为profilin2、gpx4、cystatin C和GNAS。本研究的开展首次在长爪沙鼠中筛选出脑血管畸形相关基因4个,为深入开展脑血管畸形发生机制研究奠定了基础。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
长爪沙鼠脑底动脉Willis环变异缺失类型与脑缺血模型症状相关性分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中国兽医学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    郑振峰;杜小燕;王迎;路静;高丰*;陈振文*
  • 通讯作者:
    陈振文*
长爪沙鼠在幽门螺杆菌、听觉和焦虑症等研究领域的进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    实验动物与比较医学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    谢欣昱;杜小燕*
  • 通讯作者:
    杜小燕*
长爪沙鼠脑底动脉Willis环变异缺失遗传特性分析及脑缺血模型高发群体的初步培育
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    中国比较医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    周好乐;杜小燕;路静;王迎;陈振文*
  • 通讯作者:
    陈振文*
Detected microsatellite polymorphisms in genetically altered inbred mouse strains
在基因改变的近交系小鼠品系中检测到微卫星多态性
  • DOI:
    10.1007/s00438-013-0751-y
  • 发表时间:
    2013-05
  • 期刊:
    Molecular Genetics and Genomics
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Du, Xiaoyan;Cui, Jing;Wang, Chao;Huo, Xueyun;Lu, Jing;Li, Yichen;Chen, Zhenwen
  • 通讯作者:
    Chen, Zhenwen
周龄和激素水平对长爪沙鼠超数排卵效果的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
    中国比较医学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    路静;朱祥宇;王超;王迎;陈振文;杜小燕*
  • 通讯作者:
    杜小燕*

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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
    陈振文
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    --
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    杜小燕

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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