中国汉族人群先天性脊柱侧凸TBX6候选基因多态性与相关蛋白质学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81171673
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    60.0万
  • 负责人：
    仉建国
  • 依托单位：
    中国医学科学院北京协和医院
  • 学科分类：
    H0601.运动系统结构、功能和发育异常
  • 结题年份：
    2015
  • 批准年份：
    2011
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2012-01-01 至2015-12-31

项目摘要

先天性脊柱侧凸(Congenital scoliosis,CS) 是一种高致残率、高死亡率的小儿脊柱畸形之一，其确切病因不清。相当多证据已经证明CS是一种多基因遗传病，我们在上一个国家自然科学基金项目资助下(批准号: 30672137）研究发现并确证了TBX6基因多态性与中国汉族人群CS遗传易感性具有高度关联，引发并锁定TBX6基因作为候选基因展开CS发病机制的研究设想。本研究拟通过比较携带TBX6候选基因的CS患者30例和对照组血清标本30例、通过CyDye染料交叉标记双向电泳，筛选出2倍上调表达的差异蛋白、然后进行质谱分析鉴定、基因多态性验证（RT-PCR/ PCR,HRM 和Taq-Man）分析，以期在蛋白质水平阐述候选基因TBX6可能具有CS遗传易感性关联的致病作用，完善与发病机制具有关联的病因学假说。最终从蛋白质水平阐述中国汉族人群CS的发病机制，为其诊断和防治提供科学证据。

结项摘要

按照项目的研究计划，课题组首先对中国汉族人群先天性脊柱侧凸患者的基因异常进行研究。通过对166例散发先天性脊柱侧凸患者与正常人群的对照研究，我们发现有17例患者存在TBX6的无义突变。通过家系研究发现单纯的TBX6无义突变并不能导致先天性脊柱侧凸发病。进一步我们发现TBX6亚效等位基因与TBX6无义突变联合作用可导致部分CS的发生。相关研究成果发表在New England Journal of Medicine 杂志。. 课题组使用比较蛋白质组学研究方法对15例CS患者以及正常对照的血清蛋白质进行研究，发现先天性性脊柱侧凸患者和对照组血清中有155个蛋白质差异点，两者之间的差异有统计学意义。其中62个点在CS血清中表达上调，93个点表达下调。. 蛋白质差异点经质谱分析，IPI-HUMAN数据库鉴定出16个差异蛋白。相关研究结果在课题组孙武博士毕业论文中发表。在血清蛋白质组学研究实验过程以及结果分析中课题组发现血清蛋白质易受其他因素干扰，故而进一步选择间充质干细胞为CS患者与正常人群蛋白质组学对比研究的研究对象。课题组收集并建立了30例CS患者骨髓间充质干细胞标本库。课题组对5例先天性脊柱侧凸患者以及5例年龄、性别匹配的正常对照人群的骨髓间充质干细胞进行蛋白质组学对比研究。实验主要采用反向色谱分离及LC-MS 质谱分析方法进行蛋白质鉴定，选择差异显著(P<0.05)的蛋白质结果报告。研究发现先天性脊柱侧凸患者同正常对照相比共鉴定出210个差异蛋白，其中上调的蛋白质有61个，下调的有149个。. 课题组还使用miRNA芯片技术首次对CS患者与正常人群的血清miRNA进行了对比研究。实验分别使用3例分节障碍型、3例形成障碍型CS患者与正常对照进行对比研究。本研究首次对CS患者进行血清miRNA微阵列芯片研究，发现CS患者的血清miRNA与正常人存在差异，并成功构建了CS患者与正常对照组患者血清差异miRNA资料库。研究发现：分节障碍型先天性脊柱侧凸患者同正常对照相比上调的miRNA有 54个，下调的有42个；形成障碍型先天性脊柱侧凸患者同正常对照组相比上调的miRNA 有19个，下调的有28个。相关研究成果在课题组博士王升儒博士毕业论文中发表。

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Association of LMX1A Genetic Polymorphisms With Susceptibility to Congenital Scoliosis in Chinese Han Population
LMX1A基因多态性与中国汉族先天性脊柱侧弯易感性的关系
  • DOI：
    10.1097/brs.0000000000000536
  • 发表时间：
    2014-10-01
  • 期刊：
    SPINE
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    wu, Nan;Yuan, Suomao;Wu, Zhihong
  • 通讯作者：
    Wu, Zhihong
Identification of Differential Genes Expression Profiles and Pathways of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells of Adolescent Idiopathic Scoliosis Patients by Microarray and Integrated Gene Network Analysis
微阵列和整合基因网络分析鉴定青少年特发性脊柱侧凸患者骨髓间充质干细胞的差异基因表达谱和通路
  • DOI：
    10.1097/brs.0000000000001394
  • 发表时间：
    2016-05
  • 期刊：
    Spine
  • 影响因子：
    3
  • 作者：
    仉建国
  • 通讯作者：
    仉建国
TBX6 null variants and a common hypomorphic allele in congenital scoliosis.
TBX6 无效变异和先天性脊柱侧凸中常见的低等位基因。
  • DOI：
    10.1056/nejmoa1406829
  • 发表时间：
    2015-01-22
  • 期刊：
    The New England journal of medicine
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    Wu N;Ming X;Xiao J;Wu Z;Chen X;Shinawi M;Shen Y;Yu G;Liu J;Xie H;Gucev ZS;Liu S;Yang N;Al-Kateb H;Chen J;Zhang J;Hauser N;Zhang T;Tasic V;Liu P;Su X;Pan X;Liu C;Wang L;Shen J;Shen J;Chen Y;Zhang T;Zhang J;Choy KW;Wang J;Wang Q;Li S;Zhou W;Guo J;Wang Y;Zhang C;Zhao H;An Y;Zhao Y;Wang J;Liu Z;Zuo Y;Tian Y;Weng X;Sutton VR;Wang H;Ming Y;Kulkarni S;Zhong TP;Giampietro PF;Dunwoodie SL;Cheung SW;Zhang X;Jin L;Lupski JR;Qiu G;Zhang F
  • 通讯作者：
    Zhang F

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其他文献

先天性脊柱侧凸伴发畸形的临床特点分析
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    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
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  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    吴南;张元强;王连雷;赵森;林茂;王升儒;林莞锋;王以朋;沈建雄;吴志宏;邱贵兴;仉建国
  • 通讯作者：
    仉建国
双生长棒技术治疗早发性1型神经纤维瘤病营养不良型脊柱侧凸的疗效分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
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  • 影响因子：
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  • 作者：
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  • 通讯作者：
    林莞峰
退变性脊柱侧凸的临床特点与影像学分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中国脊柱脊髓杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    邱贵兴;赵丽娟;宋海峰;仉建国;田野;沈建雄;王以朋;赵宏;吴志宏
  • 通讯作者：
    吴志宏
经皮椎间孔入路脊柱内镜下单侧减压治疗 腰椎管狭窄症临床疗效及非手术侧下肢症状观察研究
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    --
  • 发表时间：
    2019
  • 期刊：
    中国修复重建外科杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    李子全;余可谊;王以朋;仉建国
  • 通讯作者：
    仉建国
中国汉族人群Trp2等位基因多态性与椎间盘退变性疾病的关联分析
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    中华医学杂志
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    闫家智;宋海峰;仉建国;费琦;吴志宏;刘正;李书纲;邱贵兴
  • 通讯作者：
    邱贵兴

其他文献

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仉建国的其他基金

先天性脊柱侧凸合并泌尿系统畸形的基因组学分析及机制研究
  • 批准号：
  • 批准年份：
    2021
  • 资助金额：
    55 万元
  • 项目类别：
    面上项目
TBX6相关先天性脊柱侧凸致病机制多组学联合分析研究
  • 批准号：
    81972037
  • 批准年份：
    2019
  • 资助金额：
    55 万元
  • 项目类别：
    面上项目
TBX6相关先天性脊柱侧凸基因组重复拷贝数变异的隐蔽结构及潜在突变机制研究
  • 批准号：
    81672123
  • 批准年份：
    2016
  • 资助金额：
    60.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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