alpha-香树酯醇的酶法异构机理及其微生物合成

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21676026
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    64.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B08.化学工程与工业化学
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

Amyrin is a natural chemical compounds of the triterpene class which has pentacyclic structures. Amyrin is the cyclization product of 2,3-oxidosqualene catalyzed by amyrin synthase. Amyrin has two isomers which are designated as α-amyrin and β-amyrin. The α-amyrin is the precursor of the important pharmaceutical intermediate ursolic acid. However, the extraction of α-amyrin from plants are expensive because all the known α-amyrin synthases have low catalytic activities and produce a significant amount of β-amyrin by-products. Furthermore, there is no suitable α-amyrin synthases could be utilized to construct an efficient pathway for α-amyrin production. In this project, we will identify the key amino acids and structural domains of α-amyrin synthases for the cyclization and isomerization function through bioinformatics and mutation scanning, and analyze the mechanism of the isomerization function based on the protein structural information. Then, we will optimize the function domain of the α-amyrin synthases through rational design and direct evolution to obtain the mutated synthase which could completely convert 2,3-oxidosqualene to α-amyrin. We will take advantage of the selected mutated synthase to construct the biosynthesis module of α-amyrin de novo, and achieve the complete microbial synthesis of α-amyrin. This proposed project will clarify the mechanism of the enzymatic isomerization of amyrin, and provide novel research methods and artificial design strategies for the microbial synthesis and enzymatic isomerization of natural products which contains different functional isomers.
香树脂醇是五环三萜类化合物,由其合酶环化2,3-氧化鲨烯获得,具有α-型, β-型两种位置异构体,其中α-型是重要生物活性物质熊果酸的前体。目前,因所有已知的α-香树脂醇合酶都会产生大量β-型副产物,且催化效率低,导致由植物提取的α-香树脂醇成本高、价格贵,该酶也不适合其微生物外源合成体系的构建。针对这些问题本项目将通过生物信息学方法结合饱和突变来确定香树脂醇合酶催化环化和异构化反应的关键结构域或氨基酸序列,并根据蛋白质结构来解析同分异构体之间的异构转化机制,进而对香树脂醇合酶的相关结构域进行理性设计和定向进化,以获得能实现从2,3-氧化鲨烯到α-香树脂醇完全转化的香树脂醇合酶突变体,并以此为基础在酵母细胞中构建合成α-香树脂醇所需要的合成模块,实现α-香树脂醇的微生物全合成。项目研究将有助于阐明酶法异构转化机理,为众多具有异构特点的天然产物的酶法转化和微生物合成提供新的研究思路。

结项摘要

香树脂醇是一类五环三萜类化合物,广泛存在于植物中。其中α-香树脂醇和β-香树脂醇是两种同分异构体,分别是熊果酸和齐墩果酸的合成前体,本研究结合代谢工程、蛋白质工程及合成生物学技术,在酿酒酵母中构建α-香树脂醇合成模块。基于组学分析挖掘新基因,利用蛋白质工程改善酶活性,利用代谢工程对合成模块优化与调控,最终实现α-香树脂醇高效生产。主要研究结果如下:(1)对植物数据库进行生物信息学分析,在数据库中挖掘植物α-香树脂醇合酶,为了在枇杷等高产熊果酸植物中挖掘更多的关键基因,我们对枇杷叶片进行转录组学分析,并对组学结果进行拼接组装,利用 NR、NT、KEGG 和 Swissprot 等数据库对基因功能进行注释,得到若干个α-香树脂醇合酶和CYP450氧化酶候选基因,我们对候选基因分别进行表征。最终我们获得来源于枇杷和苹果的两个α-香树脂醇合酶(EjAS和MdOSC1)。(2)提高α-香树脂醇合酶的催化活性,对催化活性最高,产物专一性最好的MdOSC1进行工程改造,对关键氨基酸残基位点进行饱和突变,分别将α-香树脂醇的产量提高了5.6, 7.4和5.3 倍。(3)对酿酒酵母的甲戊二羟酸途径进行优化,提高前体2,3-氧化鲨烯供应,构建来自于白色念珠菌鲨烯单加氧酶ERG1、酿酒酵母ERG20和鲨烯合酶ERG9过表达盒,利用同源重组将过表达基因整合至酵母基因组的rDNA位点,重组菌α-香树脂醇的产量达到50mg/L。(4)优化摇瓶发酵的培养基pH值,葡萄糖浓度和半乳糖浓度,α-香树脂醇的产量提高至240 mg/L。补加6g/L的乙醇使α-香树脂醇的产量提高至315mg/L。采用发酵罐进行补料发酵,使α-香树脂醇的产量提高至1 g/L,比出发菌株的产量提高了约400倍。本研究通过半理性设计提高α-香树脂醇合酶的催化活性,利用代谢工程提高前体供应,同时增强细胞内存储产物能力,有效地提高了酿酒酵母合成α-香树脂醇的产量,为提高萜类化合物在酿酒酵母中的合成提供了借鉴。

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(1)
专利数量(0)
密码子优化策略在异源蛋白表达中的应用
  • DOI:
    10.13345/j.cjb.190280
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杨云彭;马晓焉;霍毅欣
  • 通讯作者:
    霍毅欣
Biofuel production with a stress-resistant and growth phase-independent promoter: mechanism revealed by in vitro transcription assays
使用抗应激和生长阶段独立启动子生产生物燃料:体外转录测定揭示的机制
  • DOI:
    10.1007/s00253-018-8809-8
  • 发表时间:
    2018-03-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Huo, Yi-Xin;Guo, Liwei;Ma, Xiaoyan
  • 通讯作者:
    Ma, Xiaoyan
Reversed paired-gRNA plasmid cloning strategy for efficient genome editing in Escherichia coli
用于在大肠杆菌中进行高效基因组编辑的反向配对 gRNA 质粒克隆策略
  • DOI:
    10.1186/s12934-020-01321-4
  • 发表时间:
    2020-03-10
  • 期刊:
    MICROBIAL CELL FACTORIES
  • 影响因子:
    6.4
  • 作者:
    Ding, Tingting;Huang, Chaoyong;Huo, Yi-Xin
  • 通讯作者:
    Huo, Yi-Xin
Engineering Critical Enzymes and Pathways for Improved Triterpenoid Biosynthesis in Yeast
改进酵母三萜生物合成的关键酶和途径的工程设计
  • DOI:
    10.1021/acssynbio.0c00124
  • 发表时间:
    2020-09-18
  • 期刊:
    ACS SYNTHETIC BIOLOGY
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Guo, Hao;Wang, Huiyan;Huo, Yi-Xin
  • 通讯作者:
    Huo, Yi-Xin
CipA-mediating enzyme self-assembly to enhance the biosynthesis of pyrogallol in Escherichia coli
CipA介导的酶自组装增强大肠杆菌中连苯三酚的生物合成
  • DOI:
    10.1007/s00253-018-9365-y
  • 发表时间:
    2018-12-01
  • 期刊:
    APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    5
  • 作者:
    Huo, Yi-Xin;Ren, Huiyong;Chen, Zhenya
  • 通讯作者:
    Chen, Zhenya

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其他文献

聚氨酯塑料的微生物降解
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    生物工程学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    彭瑞婷;夏孟丽;茹家康;霍毅欣;杨宇
  • 通讯作者:
    杨宇

其他文献

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霍毅欣的其他基金

半理性设计RNA聚合酶提高微生物细胞工厂生产性能
  • 批准号:
    32371489
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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