FHY3介导的拟南芥花发育的网络解析

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项目摘要

Floral stem cells are responsible for producing a defined number of floral organs, and then will be terminated programmatically at a particular developmental stage. Therefore, floral stem cells offer an ideal model to study the temporal control of stem cells maintenance, which is also very significant for the high-yielding of crops. In Arabidopsis floral meristem, WUSCHEL is a key gene for stem cells maintenance; AGAMOUS and other essential genes can repress stem cells maintenance by temporal control of WUSCHEL expression, however, the involved genes and molecular mechanism of this process is still not very clear. Based on an AG weak mutant ag-10 EMS mutagenesis, we screened a mutant with enhanced froral meristem indeterminacy of ag-10. Using map based cloning we detected a premature mutant occurring in FHY3 coding region; transgenic plant with over-expression of this gene and allele analysis show rescued or enhanced phenotype respectively, which suggested the mutation was responsible for mutant defect; in situ hybridization assay show the WUSCHEL expression was delayed due to the loss of function of FHY3.In this study, we will study the function of FHY3 and figure out the FHY3 target genes and their function in stem cells maintenance and determinacy by using a combinational approach of genetics , next generation sequencing and bioinformatics , our goal is to reveal the FHY3 mediated molecular net work in floral development, especially in floral meristem maintenance and determinacy.
植物花干细胞负责产生特定数目的花器官后其干细胞活性被程序性终止,因此花干细胞是研究干细胞时序性调控的理想模型,同时对其调控机理的研究对作物高产也具有重要意义。在拟南芥的花分生组织中,WUSCHEL是调控花干细胞活性的关键基因;AGAMOUS和其它基因可通过时序性调控WUSCHEL的表达而抑制干细胞的活性,参与该过程的基因及分子机制还不很清楚。我们前期工作中利用一个AGAMOUS弱突变体ag-10,通过EMS诱变,筛选出一个花干细胞活性增强的突变体。图位克隆表明FHY3基因发生了终止突变,转基因恢复和等位基因验证表明该基因参与了花干细胞活性的调控;原位杂交证明该基因可调控WUS的表达。本研究将通过遗传学及高通量测序等多种分子生物学技术来研究FHY3在花干细胞维持和分化中的作用机制,最终通过FHY3靶基因的鉴定及功能分析揭示FHY3介导的花发育及干细胞分化的分子网络体系。

结项摘要

植物所有组织器官均来源于分生组织/干细胞。花序分生组织是一个维持和分化的过程。当所有的花器官的原基由花干细胞产生后,花干细胞就要被及时终止。转录因子FHY3是光信号转导中关键基因,且通过转录激活作用调控植物的营养生长。在本研究中我们发现FHY3在花序分生组织的分化及茎顶端分生组织的维持中起着重要。利用全基因组ChIP-seq和RNA-seq技术,我们鉴定出在FHY3花序中的几百个靶基因,且FHY3对它们具有转录抑制作用;其中CLAVATA3 (CLV3), SEPALLATA1 (SEP1), and SEP2 均是FHY3的靶基因。在fhy3 ag-10背景下超表达SEP2能部分削弱其增强的分生组织活性表型。在茎顶端分生组织,FHY3能够直接抑制CLV3从而调控WUS来影响干细胞活性。在花序分生组织中,FHY3抑制CLV3但激活SEP2来促使花序分生组织的终止。光抑制CLV3的表达,但在fhy3,phytochrome B 突变体背景下CLV3对光不敏感,暗示FHY3参与了光调控分生组织活性的生物过程。我们的结果揭示了FHY3在花分生组织维持和分化中的分子机理,阐明了转录因子在不同的器官和发育进程中功能的不同。

项目成果

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专利数量(0)
Retrotransposon-mediated DELLA transcriptional reprograming underlies semi-dominant dwarfism in foxtail millet
逆转录转座子介导的 DELLA 转录重编程是谷子半显性矮化的基础
  • DOI:
    10.1016/j.cj.2018.12.008
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    The Crop Journal
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Meicheng Zhao;Hui Zhi;Xue Zhang;Guanqing Jia;Xianmin Diao
  • 通讯作者:
    Xianmin Diao
FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL3 activates SEPALLATA2 but inhibits CLAVATA3 to regulate meristem determinacy and maintenance in Arabidopsis
FAR-RED ELONGATED HYPOCOTYL3 激活 SEPALLATA2 但抑制 CLAVATA3 以调节拟南芥分生组织的决定性和维持
  • DOI:
    10.1073/pnas.1602960113
  • 发表时间:
    2016-08-16
  • 期刊:
    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
  • 影响因子:
    11.1
  • 作者:
    Li, Dongming;Fu, Xing;Liu, Xigang
  • 通讯作者:
    Liu, Xigang

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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