基于具有点击化学活性的环二核苷酸探针分子深入研究环二核苷酸的生理功能

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    21778063
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    65.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    B0701.生物体系分子探针
  • 结题年份:
    2021
  • 批准年份:
    2017
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2018-01-01 至2021-12-31

项目摘要

Bacteria-derived cyclic dinucleotides are considered as promising potent adjuvants in vaccination because they can stimulate the innate immune response in mammalian host cells. However, the discovery of cGAMP(2'-5') demonstrates that mammalian cells can also generate endogenous cyclic dinucleotide, which is a secondary messenger in cGAS-STING pathway for innate immune response. As the receptor protein beyond the immune system, HCN4 can be regulated by cGAMP(2'-5') to affect heart rate. This indicates that there might be more potential receptor proteins of cGAMP(2'-5'), other than STING and HCN4, with unknown biological functions. This project will apply clickable and photo-crosslinkable derivatives of cGAMP(2'-5') as molecular probes, to label and identify all potential receptor proteins of cGAMP(2'-5'). By this unique chemical biology strategy, it would unveil the mystery of cGAMP(2'-5') receptor proteins and elucidate the regulatory mechanism of cGAMP(2'-5') in immune diseases and neurodegenerative diseases, which will bring more comprehensive understanding of biological functions of cGAMP(2'-5'). This might also provide the novel strategies and tools for immunotherapy.
细菌衍生的环二核苷酸能激活哺乳动物宿主细胞的先天性免疫反应,被认为是治疗耐药菌感染的极具潜力的免疫治疗剂。然而cGAMP(2'-5')的发现证实了哺乳动物细胞自身同样能够生成内源性环二核苷酸,并且在先天性免疫信号通路cGAS-STING中发挥着非常重要的第二信使作用。HCN4作为cGAMP(2'-5')在免疫系统之外的另一个受体蛋白,调控着心率,暗示cGAMP(2'-5')可能有其它受体蛋白和其它未知的生物功能。本课题将应用具有点击化学活性和光交联性质的cGAMP(2'-5')探针分子,对cGAMP(2'-5')潜在的受体蛋白进行全面地标记和鉴定,阐明cGAMP(2'-5')调控这些受体蛋白功能的机理。通过上述独特的化学生物学方式将有望发现并揭示cGAMP(2'-5')更多的生物功能,以及在免疫性疾病和神经退化性疾病中的调控机制,从而为寻找新型的免疫治疗方法提供新思路。

结项摘要

环二核苷酸2’3’-cGAMP作为哺乳动物细胞里的第二信使在天然免疫响应中起着非常重要的作用。2’3’-cGAMP能与STING结合引发下游的干扰素和促炎因子的转录水平的上调,来达到去除细胞质DNA这一危险信号。因此关于2’3’-cGAMP的研究绝大多数都是围绕着2’3’-cGAMP的受体蛋白STING进行的。鉴于目前没有一个很有效可行的方法,对于2’3’-cGAMP结合蛋白的认知十分不足。因此申请人设计并利用化学方法合成了2’3’-cGAMP几种光亲和探针分子,来全面鉴定出其在哺乳动物细胞中的结合蛋白,以此来加深和拓宽对2’3’-cGAMP生物功能及其调控机制的了解,有利于为免疫相关疾病提供新的思路和手段。.申请人利用2’3’-cGAMP光亲和探针分子,结合化学生物学手段,在不同的哺乳动物细胞裂解液进行了潜在结合蛋白的鉴定,并对其中一个结合蛋白EF1A1进行了验证。实验结果证实了EF1A1蛋白能与2’3’-cGAMP在体外和细胞内进行高效的结合,和已知受体蛋白STING与2’3’-cGAMP的结合相当,表明EF1A1与2’3’-cGAMP的结合很可能是生理相关的。进一步的研究表明,2’3’-cGAMP倾向与蛋白生物合成延伸过程EF1 complex中的EF1A1结合,而不是游离的EF1A1,并占据了其GTP结合位置,阻止了其与GTP的结合及引起的活化,延缓了EF1A1从EF1 complex中解离并转移到核糖体上的过程,会干扰蛋白生物合成。Puromycin标记蛋白合成实验验证了外源2’3’-cGAMP确实能抑制THP-1细胞的蛋白生物合成,并且这一过程与STING无关,说明这是2’3’-cGAMP不依赖于STING的新的生物功能。.这项研究表明2’3’-cGAMP光亲和探针分子为鉴定和验证2’3’-cGAMP的结合蛋白提供了一种有效便捷的手段。EF1A1被发现是新的2’3’-cGAMP结合蛋白为细胞中存在着其它2’3’-cGAMP结合蛋白提供了有力证据,并且2’3’-cGAMP通过结合EF1A1抑制蛋白生物合成是不依赖于STING的新的生物功能,这为探究2’3’-cGAMP及细菌衍生的环二核苷酸的未知生物功能开拓了新的领域和契机。此外,2’3’-cGAMP作为EF1A1结合的内源性代谢小分子为研发新型的EF1A1抑制剂来调控蛋白生物合成提供了新的思路。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Resource A photoaffinity labeling strategy identified EF1A1 as a binding protein of cyclic dinucleotide 2′3′-cGAMP
光亲和标记策略将 EF1A1 鉴定为环状二核苷酸 2–3–cGAMP 的结合蛋白
  • DOI:
    10.1016/j.chembiol.2021.08.006
  • 发表时间:
    2022-01-20
  • 期刊:
    CELL CHEMICAL BIOLOGY
  • 影响因子:
    8.6
  • 作者:
    Hou, Yingjie;Lu, Heng;Jiang, Hong
  • 通讯作者:
    Jiang, Hong
Protocol for identification and validation of 2'3'-cGAMP-binding proteins by photoaffinity probes.
通过光亲和探针鉴定和验证 2'3'-cGAMP 结合蛋白的方案
  • DOI:
    10.1016/j.xpro.2021.101076
  • 发表时间:
    2022-03-18
  • 期刊:
    STAR protocols
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Hou Y;Lu H;Sun L;Zhang Y;Jiang H
  • 通讯作者:
    Jiang H

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其他文献

其他文献

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AI技术路线图

蒋洪的其他基金

未知赖氨酸长链脂肪酰转移酶的鉴定和生物功能
  • 批准号:
    91753114
  • 批准年份:
    2017
  • 资助金额:
    70.0 万元
  • 项目类别:
    重大研究计划

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知道了

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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