TCN2基因及其致病变异在麻风发病中的分子机制研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81601387
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    17.5万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H1104.炎症、感染与免疫
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31
  • 项目参与者:
    杨宝琦; 暴芳芳; 王真真; 于功奇; 尤家宝; 程秀君; 于文君; 曹静;
  • 关键词:

项目摘要

TCN2 has been identified as one of susceptibility genes of leprosy in our group, and previous studies confirmed that the gene was involved in the NF-κB immune pathways through increasing TCN2 expression. Our previous RNA sequencing and Elisa results showed that TCN2 was over expressed in leprosy; Next generation sequencing confirmed that the rs75680863 located in the coding region of TCN2 correlated with leprosy most; The protein structural analysis suggests that the rs75680863 might play a role in the binding of TCII to the receptor and the stability of TCII. These results indicated that TCN2 may be involved in pathogenesis of leprosy, however, the mechanism of TCN2 gene and its causative variants in the pathogenesis of leprosy remains unclear. To figure out that question, the rare variant rs75680863 will be validated in 1,000 leprosy cases and 1,000 health controls by fine maping; Elisa will be conducted to investigate the TCII expression affected by leprosy infection; to investigate the interaction of TCII with the receptor, molecular experiments such as immunoprecipitation and indirect immunofluorescence assay will be performed; further, luciferase reporter assay and zebrafish model will be performed to elucidate the functional role of both TCN2 and its regulatory variant in the regulation of NF-κB and in the pathogenesis of leprosy.
TCN2为课题组发现的麻风易感基因,既往研究证实该基因通过上调钴胺素转运蛋白表达进而影响NF-κB发挥免疫保护作用。前期转录组测序和血清ELISA结果显示TCN2在麻风病例中表达升高,对该基因进行深度测序发现其编码区域的变异rs75680863与疾病的相关性最强,蛋白结构分析显示该变异可以影响钴胺素转运蛋白的稳定性以及其与受体的结合。以上均提示TCN2及其致病变异在麻风发生、发展中发挥重要作用,具体机制尚待证实。因此课题组后续拟采用体外、体内功能实验对其机理进行阐释,采用ELISA方法研究病例、对照间、不同基因型样本间TCN2蛋白表达差异;免疫共沉淀和共聚焦显微镜技术探讨变异对钴胺素转运蛋白与受体结合的影响;荧光素酶报告实验探讨TCN2基因及其变异位点对NF-κB转录活性的影响;斑马鱼感染模型探讨TCN2变异位点在海鱼分枝杆菌感染致肉芽肿形成中的作用,以及对NF-κB免疫通路的调节作用。

结项摘要

TCN2为课题组发现的麻风易感基因,既往研究证实该基因通过上调钴胺素转运蛋白表达进而影响NF-κB发挥免疫保护作用。前期转录组测序和血清ELISA结果显示TCN2在麻风病例中表达升高,对该基因进行深度测序发现其编码区域的变异rs75680863与疾病的相关性最强,蛋白结构分析显示该变异可以影响钴胺素转运蛋白的稳定性以及其与受体的结合。接下来课题组利用体外细胞感染模型以及qPCR检测发现TCN2差异表达来源于皮损,而非血细胞;体外细胞感染模型以及蛋白印迹检测显示TCN2对p65蛋白入核无影响,课题组进而利用荧光素酶报告实验发现rs75680863变异位点一定程度上影响p65转录活性,推测该变异位点通过其他中间途径影响NF-κB信号通路;为证实上述现象,课题组利用MSD以及体外细胞感染模型发现,麻风患者以及对照PBMC体外麻风菌刺激后,TNF-α(NF-κB下游细胞因子)表达均明显上升,但在加入B12后,对照组TNF-α表达出现一定程度下降,提示rs75680863变异影响B12的转运,进而影响NF-κB下游因子TNF-α的表达,从而调控疾病的发生。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development and evaluation of a droplet digital PCR assay for the diagnosis of paucibacillary leprosy in skin biopsy specimens
用于诊断皮肤活检标本中少杆菌性麻风病的液滴数字 PCR 检测方法的开发和评估
  • DOI:
    10.1371/journal.pntd.0007284
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    PLoS Neglected Tropical Diseases
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Cheng Xiujun;Sun Lele;Zhao Qing;Mi Zihao;Yu Gongqi;Wang Zhenzhen;Sun Yonghu;Wang Chuan;Man Chunhua;Fu Fanghui;Liu Hong;Zhang Furen
  • 通讯作者:
    Zhang Furen
Ⅱ型先天性厚甲症一家系KRT基因突变检测
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国麻风皮肤病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    曹静;孙乐乐;付希安;王真真;于功奇;刘红;张福仁
  • 通讯作者:
    张福仁
Evaluation of Prospective HLA-B13:01 Screening to Prevent Dapsone Hypersensitivity Syndrome in Patients With Leprosy
前瞻性 HLA-B13:01 筛查预防麻风患者氨苯砜超敏综合征的评估
  • DOI:
    10.1111/j.1742-4658.2008.06293.x
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    JAMA Dermatology
  • 影响因子:
    10.9
  • 作者:
    Liu Hong;Wang Zhenzhen;Bao Fangfang;Wang Chuan;Sun Lele;Zhang Huimin;Yu Gongqi;Mi Zihao;Li Jianke;Li Lulu;Zhao Qing;Yue Zhenhua;Zhao Wei;Yu Wenjun;Cao Jing;Xiong Fei;Wang Yaru;Chai Zemin;Cheng Xiujun;Zhang Yuan;Fu Fanghui;Lang Xiaoqiao;Wang Xiaoling;Irwan
  • 通讯作者:
    Irwan
Genome-Wide Analysis of Protein-Coding Variants in Leprosy
麻风病蛋白质编码变异的全基因组分析
  • DOI:
    10.1016/j.jid.2017.08.004
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    Journal of Investigative Dermatology
  • 影响因子:
    6.5
  • 作者:
    Liu Hong;Wang Zhenzhen;Li Yi;Yu Gongqi;Fu Xi'an;Wang Chuan;Liu Wenting;Yu Yongxiang;Bao Fangfang;Irwanto Astrid;Liu Jian;Chu Tongsheng;Andiappan An;Kumar;Maurer Stroh Sebastian;Limviphuvadh Vachiranee;Wang Honglei;Mi Zihao;Sun Yonghu;Sun Lele;Wang Ling
  • 通讯作者:
    Wang Ling
Discovery of 4 exonic and 1 intergenic novel susceptibility loci for leprosy
发现 4 个外显子和 1 个基因间新的麻风易感位点
  • DOI:
    10.1111/cge.13376
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Clinical Genetics
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Wang Z;Mi Z;Wang H;Sun L;Yu G;Fu X;Wang C;Bao F;Yue Z;Zhao Q;Wang N;Cheng X;Liu H;Zhang F
  • 通讯作者:
    Zhang F

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其他文献

北京山区侧柏林蒸散拆分研究
  • DOI:
    10.1029/2020rg000715
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    水土保持学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王渝淞;贾国栋;张永娥;郑鹏飞;朱栩辉;孙乐乐;余新晓
  • 通讯作者:
    余新晓
PPP1R3A基因多态性与中国维吾尔族人群精神分裂症关联性研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    中国神经精神疾病杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    史新玉;安治国;孙乐乐;徐斌;母代斌;傅松年;胡红星;罗晓;杜雯;闫萍;靳路;聂丹;考尔沙尔·艾力木;师咏勇;伊琦忠
  • 通讯作者:
    伊琦忠
单分子荧光共振能量转移用于生物大分子构象动态变化过程研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    分析化学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙乐乐;苏莹莹;高延静;李威;吕慧;李宾;李迪
  • 通讯作者:
    李迪
氯氮平导致代谢异常相关基因研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    国际精神病学杂志
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    史新玉;聂丹;孙乐乐;闫萍;靳路;考尔沙尔·艾力木;伊琦忠
  • 通讯作者:
    伊琦忠
中国建筑业国际化水平度量研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
    土木工程与管理学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    孙乐乐;张伟明;邓小鹏
  • 通讯作者:
    邓小鹏

其他文献

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相似国自然基金

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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