TCN2基因及其致病变异在麻风发病中的分子机制研究
项目介绍
AI项目解读
基本信息
- 批准号:81601387
- 项目类别:青年科学基金项目
- 资助金额:17.5万
- 负责人:
- 依托单位:
- 学科分类:H1104.炎症、感染与免疫
- 结题年份:2019
- 批准年份:2016
- 项目状态:已结题
- 起止时间:2017-01-01 至2019-12-31
- 项目参与者:杨宝琦; 暴芳芳; 王真真; 于功奇; 尤家宝; 程秀君; 于文君; 曹静;
- 关键词:
项目摘要
TCN2 has been identified as one of susceptibility genes of leprosy in our group, and previous studies confirmed that the gene was involved in the NF-κB immune pathways through increasing TCN2 expression. Our previous RNA sequencing and Elisa results showed that TCN2 was over expressed in leprosy; Next generation sequencing confirmed that the rs75680863 located in the coding region of TCN2 correlated with leprosy most; The protein structural analysis suggests that the rs75680863 might play a role in the binding of TCII to the receptor and the stability of TCII. These results indicated that TCN2 may be involved in pathogenesis of leprosy, however, the mechanism of TCN2 gene and its causative variants in the pathogenesis of leprosy remains unclear. To figure out that question, the rare variant rs75680863 will be validated in 1,000 leprosy cases and 1,000 health controls by fine maping; Elisa will be conducted to investigate the TCII expression affected by leprosy infection; to investigate the interaction of TCII with the receptor, molecular experiments such as immunoprecipitation and indirect immunofluorescence assay will be performed; further, luciferase reporter assay and zebrafish model will be performed to elucidate the functional role of both TCN2 and its regulatory variant in the regulation of NF-κB and in the pathogenesis of leprosy.
TCN2为课题组发现的麻风易感基因,既往研究证实该基因通过上调钴胺素转运蛋白表达进而影响NF-κB发挥免疫保护作用。前期转录组测序和血清ELISA结果显示TCN2在麻风病例中表达升高,对该基因进行深度测序发现其编码区域的变异rs75680863与疾病的相关性最强,蛋白结构分析显示该变异可以影响钴胺素转运蛋白的稳定性以及其与受体的结合。以上均提示TCN2及其致病变异在麻风发生、发展中发挥重要作用,具体机制尚待证实。因此课题组后续拟采用体外、体内功能实验对其机理进行阐释,采用ELISA方法研究病例、对照间、不同基因型样本间TCN2蛋白表达差异;免疫共沉淀和共聚焦显微镜技术探讨变异对钴胺素转运蛋白与受体结合的影响;荧光素酶报告实验探讨TCN2基因及其变异位点对NF-κB转录活性的影响;斑马鱼感染模型探讨TCN2变异位点在海鱼分枝杆菌感染致肉芽肿形成中的作用,以及对NF-κB免疫通路的调节作用。
结项摘要
TCN2为课题组发现的麻风易感基因,既往研究证实该基因通过上调钴胺素转运蛋白表达进而影响NF-κB发挥免疫保护作用。前期转录组测序和血清ELISA结果显示TCN2在麻风病例中表达升高,对该基因进行深度测序发现其编码区域的变异rs75680863与疾病的相关性最强,蛋白结构分析显示该变异可以影响钴胺素转运蛋白的稳定性以及其与受体的结合。接下来课题组利用体外细胞感染模型以及qPCR检测发现TCN2差异表达来源于皮损,而非血细胞;体外细胞感染模型以及蛋白印迹检测显示TCN2对p65蛋白入核无影响,课题组进而利用荧光素酶报告实验发现rs75680863变异位点一定程度上影响p65转录活性,推测该变异位点通过其他中间途径影响NF-κB信号通路;为证实上述现象,课题组利用MSD以及体外细胞感染模型发现,麻风患者以及对照PBMC体外麻风菌刺激后,TNF-α(NF-κB下游细胞因子)表达均明显上升,但在加入B12后,对照组TNF-α表达出现一定程度下降,提示rs75680863变异影响B12的转运,进而影响NF-κB下游因子TNF-α的表达,从而调控疾病的发生。
项目成果
期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Development and evaluation of a droplet digital PCR assay for the diagnosis of paucibacillary leprosy in skin biopsy specimens
用于诊断皮肤活检标本中少杆菌性麻风病的液滴数字 PCR 检测方法的开发和评估
- DOI:10.1371/journal.pntd.0007284
- 发表时间:2019
- 期刊:PLoS Neglected Tropical Diseases
- 影响因子:3.8
- 作者:Cheng Xiujun;Sun Lele;Zhao Qing;Mi Zihao;Yu Gongqi;Wang Zhenzhen;Sun Yonghu;Wang Chuan;Man Chunhua;Fu Fanghui;Liu Hong;Zhang Furen
- 通讯作者:Zhang Furen
Ⅱ型先天性厚甲症一家系KRT基因突变检测
- DOI:--
- 发表时间:2017
- 期刊:中国麻风皮肤病杂志
- 影响因子:--
- 作者:曹静;孙乐乐;付希安;王真真;于功奇;刘红;张福仁
- 通讯作者:张福仁
Evaluation of Prospective HLA-B13:01 Screening to Prevent Dapsone Hypersensitivity Syndrome in Patients With Leprosy
前瞻性 HLA-B13:01 筛查预防麻风患者氨苯砜超敏综合征的评估
- DOI:10.1111/j.1742-4658.2008.06293.x
- 发表时间:2019
- 期刊:JAMA Dermatology
- 影响因子:10.9
- 作者:Liu Hong;Wang Zhenzhen;Bao Fangfang;Wang Chuan;Sun Lele;Zhang Huimin;Yu Gongqi;Mi Zihao;Li Jianke;Li Lulu;Zhao Qing;Yue Zhenhua;Zhao Wei;Yu Wenjun;Cao Jing;Xiong Fei;Wang Yaru;Chai Zemin;Cheng Xiujun;Zhang Yuan;Fu Fanghui;Lang Xiaoqiao;Wang Xiaoling;Irwan
- 通讯作者:Irwan
Genome-Wide Analysis of Protein-Coding Variants in Leprosy
麻风病蛋白质编码变异的全基因组分析
- DOI:10.1016/j.jid.2017.08.004
- 发表时间:2017
- 期刊:Journal of Investigative Dermatology
- 影响因子:6.5
- 作者:Liu Hong;Wang Zhenzhen;Li Yi;Yu Gongqi;Fu Xi'an;Wang Chuan;Liu Wenting;Yu Yongxiang;Bao Fangfang;Irwanto Astrid;Liu Jian;Chu Tongsheng;Andiappan An;Kumar;Maurer Stroh Sebastian;Limviphuvadh Vachiranee;Wang Honglei;Mi Zihao;Sun Yonghu;Sun Lele;Wang Ling
- 通讯作者:Wang Ling
Discovery of 4 exonic and 1 intergenic novel susceptibility loci for leprosy
发现 4 个外显子和 1 个基因间新的麻风易感位点
- DOI:10.1111/cge.13376
- 发表时间:2018
- 期刊:Clinical Genetics
- 影响因子:3.5
- 作者:Wang Z;Mi Z;Wang H;Sun L;Yu G;Fu X;Wang C;Bao F;Yue Z;Zhao Q;Wang N;Cheng X;Liu H;Zhang F
- 通讯作者:Zhang F
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