计算机辅助影像定量解码胰腺神经内分泌肿瘤全基因组学的研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    81571750
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    56.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    H2708.医学图像数据处理、分析与可视化
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2019-12-31

项目摘要

Gene targeting drug is an effective treatment for pancreatic neuroendocrine tumor (P - NETs). Because of the actual and spatial heterogeneity in tumors, biopsy, which merely extracts and analyzes a small part of the tumor tissue, cannot be applied for comprehensive tumor gene detection. Besides, genetic mutations may easily occur during the treatment of tumor. Tumor genome analysis, searching for individual specific therapeutic targets and real-time monitoring the changes in gene is the key to accurate P - NETs treatment. To overcome this problem, this study intends to apply bioinformatics technology, using computer semi-automatic quantitative decoding technology, for the extraction of quantitative imaging characteristics in structure and function imaging of P - NETs tumors, and to analyze the correlations between the imaging features and the tumor gene, in order to find the quantitative imaging features and different combinations of the features that can reflect the related gene of P-NETs. Therefore to build up a forecasting model of P - NETs related gene expression based on the imaging features, and to verify the accuracy of the forecasting model through independent prospective P - NETs samples, for the exploration of replacing molecular markers with noninvasive imaging markers, and for realizing real-time monitoring of tumor gene, which provides the basis for gene targeting therapy.
基因靶向药物是胰腺神经内分泌肿瘤(P-NETs)是有效的治疗方法。由于肿瘤具有实际和空间的异质性,通过活检只能提取和分析一小部分肿瘤组织,不能全面检测肿瘤的基因特征;同时,治疗过程中肿瘤易出现的基因突变。进行肿瘤全基因组分析,寻找个体特异性治疗靶点,实时监测基因的改变是实现P-NETs精准治疗的关键。针对这一难题,本研究拟借助生物信息学技术,利用计算机半自动化定量解码的技术,提取P-NETs肿瘤结构成像和功能成像特征中的定量影像特征,分析各影像特征与肿瘤基因的相关性,寻找能反映P-NETs相关基因的定量影像特征及不同特征的组合,进而建立基于影像特征预测P-NETs相关基因表达的预测模型,并通过独立的前瞻性P-NETs样本验证该模型预测的准确性,探索以非侵袭性的影像标志物替代分子标志物。实现肿瘤基因的影像实时监测,为基因靶向治疗提供依据。

结项摘要

基因靶向药物治疗是胰腺神经内分泌肿瘤(pancreatic neuroendocrine neoplasms,PNENs)的有效治疗方法,进行基因分析,寻找个体特异性治疗靶点,实时监测基因的改变是实现PNENs精准治疗的关键。然而,PNENs的基因表达在时间和空间上具有异质性。活检只能提取和分析一小部分肿瘤组织,不能全面检测肿瘤的基因特征。针对上述难题,本研究借助生物信息学技术,克服传统影像学方法的局限性,利用计算机深度学习提取PNENs的定量影像特征,分析各影像特征与肿瘤基因表达的相关性,进而建立基于影像特征预测PNENs相关基因表达的预测模型。.本研究利用高性能计算机深度学习的分析方法,对PNENs病灶的影像特征进行了全方位的提取和分析,分析影像特征与PNENs的系列生物学行为的相关性,包括基因表达、病理分级、术后复发转移、预后(PFS)等方法,成功建立基于定量CT影像特征预测PNENs基因表达、病理分级、术后复发转移、预后等计算机预测模型。同时,为验证模型的准确性,课题组采用其他研究中心的数据进行第三方独立验证。研究结果表明,这些预测模型的准确性、敏感度及特异度均在80%左右,部分模型的准确性接近90%,值得临床应用推广。本研究成功利用无创性的影像标志物预测肿瘤的生物学行为,尤其是基因表达情况,为PNENs的基因靶向治疗提供可靠的依据,辅助临床决策。.课题组同时成功开发胰腺肿瘤、PNENs肝脏转移瘤的CT图像计算机自动分割模型,准确性在85%以上,为减少医师图像分割的工作量、提高图像分割的准确性提供理想的平台。.在PNENs的基因靶向治疗、生物制剂治疗、弥漫性肝转移的疗效评估标准方面,本研究也进行了一系列探索,包括疗效评价标准的选择、评价最佳阈值的选择、肝转移瘤总体体积及密度变化评估等,为PNENs病灶的治疗疗效评估方案提供更充分可靠的参考。.本研究成功建立以影像学为基础的疾病预测模型,探索无创性影像标志物预测肿瘤的生物学行为的方法,指导个体化精准治疗。该模式为治疗决策提供高质量的智力支持,有望成为疾病诊断与治疗的新方向。

项目成果

期刊论文数量(37)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Prediction of type 2 diabetes mellitus using noninvasive MRI quantitation of visceral abdominal adiposity tissue volume
使用内脏腹部脂肪组织体积的无创 MRI 定量预测 2 型糖尿病
  • DOI:
    10.21037/qims.2019.06.01
  • 发表时间:
    2019-06-01
  • 期刊:
    QUANTITATIVE IMAGING IN MEDICINE AND SURGERY
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Wang, Meng;Luo, Yanji;Feng, Shi-Ting
  • 通讯作者:
    Feng, Shi-Ting
Combined Volumetric and Density Analyses of Contrast-Enhanced CT Imaging to Assess Drug Therapy Response in Gastroenteropancreatic Neuroendocrine Diffuse Liver Metastasis
对比增强 CT 成像的体积和密度联合分析评估胃肠胰神经内分泌弥漫性肝转移的药物治疗反应
  • DOI:
    10.1155/2018/6037273
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Contrast Media and Molecular Imaging
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Wang Yi;Huang Kun;Chen Jie;Luo Yanji;Zhang Yu;Jia Yingmei;Xu Ling;Chen Minhu;Huang Bingsheng;Ni Dong;Li Zi-Ping;Feng Shi-Ting
  • 通讯作者:
    Feng Shi-Ting
Evaluation of intestinal tuberculosis by multi-slice computed tomography enterography.
多层螺旋CT肠造影评价肠结核
  • DOI:
    10.1186/s12879-015-1325-x
  • 发表时间:
    2015-12-22
  • 期刊:
    BMC infectious diseases
  • 影响因子:
    3.7
  • 作者:
    Zhao J;Cui MY;Chan T;Mao R;Luo Y;Barua I;Chen M;Li ZP;Feng ST
  • 通讯作者:
    Feng ST
Prediction of sorafenib treatment-related gene expression for hepatocellular carcinoma: preoperative MRI and histopathological correlation
肝细胞癌索拉非尼治疗相关基因表达的预测:术前 MRI 和组织病理学相关性
  • DOI:
    10.1007/s00330-018-5882-4
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    EUROPEAN RADIOLOGY
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Dong, Zhi;Huang, Kun;Feng, Shi-Ting
  • 通讯作者:
    Feng, Shi-Ting
Ability of DWI to characterize bowel fibrosis depends on the degree of bowel inflammation
DWI 表征肠纤维化的能力取决于肠道炎症的程度
  • DOI:
    10.1007/s00330-018-5860-x
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    EUROPEAN RADIOLOGY
  • 影响因子:
    5.9
  • 作者:
    Li, Xue-hua;Mao, Ren;Feng, Shi-Ting
  • 通讯作者:
    Feng, Shi-Ting

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其他文献

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  • 通讯作者:
    冯仕庭
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  • 发表时间:
    2013
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    中华胃肠外科杂志
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  • 作者:
    彭振鹏;孙灿辉;罗宴吉;董帜;李雪华;李子平;冯仕庭
  • 通讯作者:
    冯仕庭

其他文献

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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