染色体19q13.3围绕DNA修复基因亚区域的肺癌基因组关联研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    81072384
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    30.0万
  • 负责人：
    尹娇杨
  • 依托单位：
    沈阳医学院
  • 学科分类：
    H3010.非传染病流行病学
  • 结题年份：
    2013
  • 批准年份：
    2010
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2011-01-01 至2013-12-31

项目摘要

采用HapMap tag SNPs间接策略及目前国际多采用的两阶段研究设计：进行中国东北地区汉族群体肺癌病例-对照区域性基因组关联分析：聚焦在染色体19q13.3亚区域ERCC1到ERCC2 70kb范围的4个基因：ERCC1、ASE-1、RAI及ERCC2, 全面考虑其完整基因的常见变异及特异组合的常见单体型（域）/双体型，及其与吸烟等环境因素相互作用与肺癌的关联，重点在于构建染色体19q13.3亚区域肺癌易感性连锁不平衡精细图谱（未见报道）及关联验证，进一步精细定位：与肺癌发生强烈相关联的主要易感性基因的DNA序列范围及效应器，并将中国汉族群体与丹麦高加索群体相对比：是否具有同样的与肺癌（癌症）发生紧密相关的古老单体型（域）或"年轻"的、具有群体特异性的单体型（域）。为进一步的功能研究、临床化疗药物抵抗的相关性研究及中国人肺癌的发生、预防、诊断、治疗策略提供理论基础和科学依据。

结项摘要

为精细定位中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因(ERCC2, PPP1R13L, CD3EAP and ERCC1)亚区域潜在的肺癌病因及关联序列，项目(批准号：81072384)执行了中国群体肺癌病例-对照chr19q13.3涉及此四个相关基因亚区域的基因组关联分析。采用 HapMap tag SNPs 间接策略, 逐一分析各个基因及总体基因联合分析，初步定位可能的风险序列范围，进一步采用精细制图策略，执行了此染色体亚区域横跨71.654kb范围的精细图谱研究，对于单一位点五种遗传模型分析提示：7个紧密相邻的SNPs(PPP1R13L rs1970764, rs1005165, CD3EAP rs967591, rs735482, rs1007616, rs62109563, and ERCC1 rs3212965)显示了与肺癌发生风险有意义的相关联；基因-基因-环境相互作用MDR模型分析提示：吸烟持续性和ERCC2、PPP1R13及ERCC1 htSNPs遗传变异高序相互作用的效应是肺癌发生风险的强烈预报器；首次对中国群体(亚洲人/黄种人)此亚区特异性高风险双体型复制研究提示：高加索群体验证报道的癌症相关高风险双体型的部分组成成份：PPP1R13L rs1970764 和CD3EAP rs967591的变异等位基因可能是中国群体(亚洲人/黄种人)中肺癌发生的风险因素，但因其高风险双体型在中国群体(亚洲人/黄种人)的罕见，不可能是该人种的肺癌风险因素；中国群体(亚洲人/黄种人)chr19q13.3相关四个基因亚区域的精细图谱研究提示：增强肺癌易感性效应器的中心区域定位于：围绕从PPP1R13L intron8 rs1970764到CD3EAP 3' near gene rs62109563的23.173kb范围。项目首次在国际上系统研究及定位绘制完成了中国人(亚洲人/黄种人)染色体19q13.3相关四个基因亚区域的肺癌(癌症)易感性连锁不平衡/精细图谱。目前，本项目研究成果已发表Carcinogenesis，Mutat Res，Environ Mol Mutagen，Lung Cancer等国际SCI期刊论文7篇(累积SCI影响因子约：22.611)。

项目成果

期刊论文数量（7）
专著数量（0）
科研奖励数量（3）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
HapMap-based study of a region encompassing ERCC1 and ERCC2 related to lung cancer susceptibility in a Chinese population
基于 HapMap 的 ERCC1 和 ERCC2 区域与中国人群肺癌易感性相关的研究
  • DOI：
    10.1016/j.mrfmmm.2011.05.003
  • 发表时间：
    2011-08-01
  • 期刊：
    MUTATION RESEARCH-FUNDAMENTAL AND MOLECULAR MECHANISMS OF MUTAGENESIS
  • 影响因子：
    2.3
  • 作者：
    Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Song, Tiehua
  • 通讯作者：
    Song, Tiehua
HapMap-based study identifies risk sub-region on chromosome 19q13.3 in relation to lung cancer among Chinese
基于 HapMap 的研究确定了染色体 19q13.3 上与中国人肺癌相关的风险亚区域
  • DOI：
    10.1016/j.canep.2013.09.016
  • 发表时间：
    2013-12-01
  • 期刊：
    CANCER EPIDEMIOLOGY
  • 影响因子：
    2.6
  • 作者：
    Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Ma, Jian
  • 通讯作者：
    Ma, Jian
A specific diplotype defined by PPP1R13L rs1970764, CD3EAP rs967591 and ERCC1 rs11615 and lung cancer risk in a Chinese population
PPP1R13L rs1970764、CD3EAP rs967591 和 ERCC1 rs11615 定义的特定双倍型与中国人群的肺癌风险
  • DOI：
    10.1016/j.lungcan.2012.01.001
  • 发表时间：
    2012-06-01
  • 期刊：
    LUNG CANCER
  • 影响因子：
    5.3
  • 作者：
    Yin, Jiaoyang;Vogel, Ulla;Li, Xinxin
  • 通讯作者：
    Li, Xinxin

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--"}}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--" }}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--"}}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

其他文献

其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI：
    {{ item.doi || "--" }}
  • 发表时间：
    {{ item.publish_year || "--"}}
  • 期刊：
    {{ item.journal_name }}
  • 影响因子：
    {{ item.factor || "--" }}
  • 作者：
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者：
    {{ item.author }}
empty
内容获取失败，请点击重试
重试联系客服
title开始分析
查看分析示例
此项目为已结题，我已根据课题信息分析并撰写以下内容，帮您拓宽课题思路：

AI项目思路

AI技术路线图

尹娇杨的其他基金

中国人染色体19q13.2-3区域DNA修复等基因单核苷酸多态及其单体型与肺癌发生风险研究
  • 批准号：
    30571016
  • 批准年份：
    2005
  • 资助金额：
    8.0 万元
  • 项目类别：
    面上项目

相似国自然基金

{{ item.name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 批准年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}

相似海外基金

{{ item.name }}
{{ item.translate_name }}
  • 批准号：
    {{ item.ratify_no }}
  • 财政年份：
    {{ item.approval_year }}
  • 资助金额：
    {{ item.support_num }}
  • 项目类别：
    {{ item.project_type }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者：{{ showInfoDetail.author }}

知道了

AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
关闭
close
客服二维码