基于组学策略研究EGCG在人源菌群小鼠结肠的代谢通路

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31671855
  • 项目类别:
    面上项目
  • 资助金额:
    63.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C2005.食品与肠道菌群
  • 结题年份:
    2020
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2020-12-31

项目摘要

The emerging research has spotlighted the interaction between dietary polyphenols and colonic flora. However,relatively little is know about the mechanism of the interaction due to the complexity of the intestinal flora and the diversity of its metabolism. This research aims to intervene the gut microbiota with epigallocatechin gallate (EGCG) in human-associated mice (HFA). Metabonomics of phenolics were analyzed in this intervention. Then, a possible metabolic pathway of EGCG was built, based on former studies, using molecular simulation. In the meanwhile, differentially expressed genes were determined by metatrascriptomics analysis. These genes were tested in the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) to find a best math using approximate matching algorithm. In addition, key functional genes were marked by screening the functional genes. Based on the newly built pathway, BLAST, and existing research data, key flora were screened out among those that were up-regulated after EGCG intervention. The selected flora were separated by EGCG enriched and pure culture technology to investigated the interaction among gut flora, key genes, and metabolites. This interaction may further reveal how dietary polyphenol may affect human's health through gut microbiota.
膳食多酚与肠道菌群的相互作用及其对健康的影响已成为膳食与健康领域的热点问题。然而,由于肠道菌群的多样性和代谢的复杂性,导致我们对于膳食多酚在结肠与菌群互作知之甚少。本研究采用EGCG对人源菌群小鼠结肠菌群进行干涉,对酚类物质的代谢组学进行分析,然后通过分子模拟,结合前人研究结果构建EGCG的可能代谢途径;并用宏转录组学技术分析获得差异表达基因,采用近似匹配算法进行数据挖掘,在KEGG的代谢网络中寻找距离最近的最佳匹配,进而结合上调的表达基因的功能注释筛选关键功能基因,完成EGCG代谢通路草图的绘制。在此基础上,结合BLAST比对分析和原有研究基础,在受EGCG干涉后上调的菌群中,筛选可能的关键菌群,并通过EGCG体外富集和纯培养技术分离部分相关菌群进行验证,阐明结肠菌群-关键基因-代谢产物之间的相互关系,为进一步揭示多酚通过与肠道菌群互作影响人体健康的作用机制打下基础。

结项摘要

本研究通过构建HFA小鼠模型,分别饲喂普通纯化饲料和粗饲料,发现粗饲料饲养小鼠肠道菌群与人粪便菌群结构更相似。通过高脂纯化饲料构建HFA肥胖小鼠模型并采用EGCG膳食干预,发现EGCG以浓度依赖性方式促进脂肪代谢及肝脏损伤修复,并显著改变了肥胖小鼠肠道菌群结构,其中0.8%EGCG处理后,Peptostreptococcaceae科及 Romboutsia和Blautia属细菌明显增加。通过HPLC-MS分析代谢物差异,发现采用0.8%的EGCG干涉8周后,小鼠粪便中除了2.5min出现EGC物质峰外,在14-23.5min期间还出现了5-(3,5-dihydroxyphenyl)-γ-valerolactone 等7个不同的物质峰。肠道菌群主要介导EGCG最终转化成γ-戊内酯、戊酮酸、戊酸类等物质。.采用黑曲霉RAF106菌株对EGCG进行体外生物转化研究发现,酵母粉可显著促进EGCG生物转化,而葡萄糖起到显著抑制效果,这种结果可能是通过影响RAF106菌株单宁酶活性实现的,加入酵母粉24 h后,单宁酶活性是对照组的3.1倍,而葡萄糖加入后对其影响不大,继续发酵至48h和96h后,酶活则分别下降49.46%和32.67%。将RAF106与EGCG在YE培养液共孵育120h,代谢组测序分析发现EGCG被转化为6-Methoxyluteolin 3'-glucoside等6种黄酮类代谢物。经转录组分析发现,EGCG处理后共有1394个差异表达基因,其中上调653个,下调741个。利用KEGG分析其代谢或信号途径,发现这些差异基因主要与代谢、遗传信息加工、信号传导、细胞过程及发育系统密切相关。.研究发现EGCG诱导启动了黑曲霉cdc42-ste11-Fus3这条MAPK信号相关途径的表达,Rga1、Cdc42、Ste11、Fus3/MpkB、Ste50、Slt2/Spm1均明显上调,磷脂酰肌醇信号途径的Plc1、mTOR信号途径的NPRL2均下降。利用基因操作技术,获得MAPK激酶Fus3编码基因fus3敲除株Δfus3,通过与野生菌株生长及EGCG转化比较,证实EGCG是通过激活Fus3-MAPK级联通路调控黑曲霉生长,且该级联通路正向调控黑曲霉对茶多酚生物转化过程。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(3)
Roles of Three HSF Domain-Containing Proteins in Mediating Heat-Shock Protein Genes and Sustaining Asexual Cycle, Stress Tolerance, and Virulence in Beauveria bassiana.
三种含有 HSF 结构域的蛋白质在介导白僵菌热休克蛋白基因和维持无性周期、胁迫耐受性和毒力中的作用
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.01677
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Zhou G;Ying SH;Hu Y;Fang X;Feng MG;Wang J
  • 通讯作者:
    Wang J
微生物介导的EGCG生物转化及其代谢物活性研究进展
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    食品科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    杜敏如;房倩安;廖振林;方祥;王洁
  • 通讯作者:
    王洁
Comparison of Bacterial Diversity Between Two Traditional Starters and the Round-Koji-Maker Starter for Traditional Cantonese Chi-Flavor Liquor Brewing.
两种传统广式酒曲与圆曲曲的细菌多样性比较
  • DOI:
    10.3389/fmicb.2018.01053
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Frontiers in microbiology
  • 影响因子:
    5.2
  • 作者:
    Wang J;Zhong Q;Yang Y;Li H;Wang L;Tong Y;Fang X;Liao Z
  • 通讯作者:
    Liao Z
无菌动物在饮食干涉肠道菌群研究中的应用
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
    中国实验动物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    董飒爽;曾本华;王洁;魏泓;方祥
  • 通讯作者:
    方祥
EGCG对高脂饮食诱导的肥胖HFA小鼠脂质代谢的影响
  • DOI:
    10.13982/j.mfst.1673-9078.2018.1.003
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    现代食品科技
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    胡凌;曾本华;王洁;董飒爽;廖振林;王丽;魏泓;方祥
  • 通讯作者:
    方祥

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其他文献

食源亚历山大藻核糖体DNA分子特征及其产毒特性的遗传差异
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    --
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 影响因子:
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  • 通讯作者:
    童贻刚
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    王丽
固沙樟子松种子萌发与幼苗生长对干旱胁迫的响应及抗旱性评价
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
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  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    王东丽;张日升;方祥;王凯;吴叶礼;秦崧悦;龙丹丹;沈海鸥
  • 通讯作者:
    沈海鸥
茶多酚饮食对HFA小鼠肠道菌群和脂肪代谢的影响
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
    中国食品学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    张晓婧;廖振林;方祥;魏泓
  • 通讯作者:
    魏泓

其他文献

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方祥的其他基金

基于噬菌体扰动研究小鼠结肠菌群的膳食调控机制
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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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