疾病相关氨基酸变异与生物功能关系的模型建立、软件开发与高通量计算分析

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号：
    20872107
  • 项目类别：
    面上项目
  • 资助金额：
    31.0万
  • 负责人：
    沈百荣
  • 依托单位：
    苏州大学
  • 学科分类：
    B0702.生物分子的化学生物学
  • 结题年份：
    2011
  • 批准年份：
    2008
  • 项目状态：
    已结题
  • 起止时间：
    2009-01-01 至2011-12-31

项目摘要

人类疾病大多是由于变异引起的，蛋白质中的氨基酸变异是其中主要原因之一。国际上多年的研究已经积累了大量的数据，这些疾病相关的氨基酸变异已被收集为各种数据库，然而这些数据并没有得到很好的解释和应用。与此相关的生物问题如：(1)什么样的变异会导致疾病？(2)为什么这样的变异会导致疾病，其分子机制是什么？.为了回答这些问题，本课题将通过假设（假设1：功能位点在进化上是保守的；假设2：疾病相关的变异位点都是功能位点）建立合理的生物信息学模型和算法，开发相应的软件工具用于进一步的疾病相关氨基酸变异的分析或者蛋白质功能预测。.在后基因组时代，功能基因组的研究是主要特征之一，由于疾病相关变异与功能之间的关系十分紧密,理解两者的关系将对基因或蛋白质的生物功能分析至关重要。本研究的实施将会加深对疾病的分子机制的理解，有助于疾病诊断与合理的药物设计，减少实验研究工作量，同时对生物工程也有重要的意义。

结项摘要

项目成果

期刊论文数量（4）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（3）
专利数量（0）
Review of Computer-Aided Models for Predicting Collagen Stability
预测胶原蛋白稳定性的计算机辅助模型综述
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Current Computer-Aided Drug Design
  • 影响因子：
    1.7
  • 作者：
    Gonzalez-Diaz; Humberto;Shen; Bairong;Podda; Gianni;Concu; Riccardo
  • 通讯作者：
    Riccardo
Computational Analysis of Amino Acid Mutation: A Proteome Wide Perspective
氨基酸突变的计算分析：蛋白质组的广阔视角
  • DOI：
    10.2174/157016409789973734
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    Current Proteomics
  • 影响因子：
    0.8
  • 作者：
    Shen; Bairong;Chen; Jiajia
  • 通讯作者：
    Jiajia
Effects of Time Point Measurement on the Reconstruction of Gene Regulatory Networks
时间点测量对基因调控网络重建的影响
  • DOI：
    10.3390/molecules15085354
  • 发表时间：
    2010-08-04
  • 期刊：
    Molecules
  • 影响因子：
    4.6
  • 作者：
    Yan W;Zhu H;Yang Y;Chen J;Zhang Y;Shen B
  • 通讯作者：
    Shen B

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  • 作者：
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其他文献

Co-B 非晶态合金中电子转移问题的量子化学研究
  • DOI：
    --
  • 发表时间：
    --
  • 期刊：
    化学物理学报
  • 影响因子：
    --
  • 作者：
    方志刚;沈百荣;范康年
  • 通讯作者：
    范康年

其他文献

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AI技术路线图

沈百荣的其他基金

基于网络分析寻找前列腺癌相关microRNA生物标志物
  • 批准号：
    31470821
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  • 项目类别：
    面上项目
前列腺癌诊断、分级和预后相关的生物分子网络的构建和数学模拟
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    91230117
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  • 项目类别：
    面上项目
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  • 批准号：
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  • 批准年份：
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  • 资助金额：
    10.0 万元
  • 项目类别：
    专项基金项目

相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目：调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要：

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题，其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子，其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而，TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用，影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法，探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用，为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义，并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路：

科学问题：TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达？
前期研究：已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应，但其具体机制尚不明确。
研究创新点：本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线：包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术：TRIM2与病毒RNA的相互作用分析，IFN-β启动子活性检测。
实验模型：使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
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