中国近海典型海域BALOs的生态学研究

结题报告
项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    41506179
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    D0604.生物海洋学与海洋生物资源
  • 结题年份:
    2018
  • 批准年份:
    2015
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2016-01-01 至2018-12-31

项目摘要

Bdellovibrio and like organisms (BALOs) are gram-negative, predatory bacteria, they play an important role in altering microbial communities, the pathogen control, and water purification, and so on. Recent studies have found that the BALOs are more diverse than previously known in the ocean, which encourage further research to address questions on the ecological and evolutionary significance of BALOs. This project will focus on the diversity and distribution of BALOs in Chinese coastal waters by culture-dependent methods and culture-independent methods (including qPCR, 16S rRNA gene pyrosequencing). The relationships between BALOs and other host bacteria will also be detected by multivariate laboratory microcosms. From the research, it is expected to illuminate the diversity and community structure of BALOs in typical Chinese coastal waters, to advance understanding the control of BALOs on marine bacterial prey. Furthermore, we shall obtain more new species, which will lay a good foundation for further application research.
BALOs(Bdellovibrio and like organisms)是一类专门以捕食细菌(多为G-菌)为生的寄生性细菌,在细菌种群调控、病原菌的防治及水质的净化等方面具有重要的作用。近年来的研究发现海洋中存在种类繁多的BALOs,其种类多样性及数量都远远超出人们原有的认识,其生态分布及功能亟待深入研究。本项目拟运用传统的分离培养方法、分子方法及高通量测序等方法,分析中国近海典型海域中BALOs的种类组成、数量分布;结合多元混合微生物群落体系模拟培养等方法开展BALOs与其他宿主细菌之间的相互关系研究。通过本项目的实施,可望阐明近海典型海区海洋BALOs的种类组成及数量分布特征,探讨海洋BALOs对海洋宿主细菌的种类和数量的调控作用,为完善 “微食物环”理论及阐释BALOs的生态功能提供理论依据;完善蛭弧菌的系统发育分类学研究,获取具有生物防治价值的海洋BALOs新种质资源。

结项摘要

本项目关于中国近海典型海域BALOs的种群特性及分布研究。.(1)从海水中分离获取84株海洋细菌,并完成分子鉴定工作,归为26属,38种,其中61.9%属于alpha-proteobacteria类群,23.8%属于gamma-proteobacteria类群,11.9%属于Actinobacteria_c类群,2.4%属于Flavobacteria类群。菌株27-11,27-7,27G-34,27-10,27G-7的16S rDNA序列同源性小于或等于97%,可能为新的物种。这些物种类群覆盖度较广,具有一定代表性,皆为海源型土著微生物,为后续蛭弧菌的裂解谱测定及应用研究奠定了物种基础,有助于研究蛭弧菌的裂解特性并筛选出环境友好型的宿主。.(2)完成BALOs7,8,9,10,11,28、HLS和Y22蛭弧菌的分子鉴定工作,BALOs7,8,9,10,11,28和Y22之间的16S rDNA同源性高于98%,与Halobacteriovorax litoralis JS5(T) 具有92.4%的序列同源性,是一个全新的物种,命名为Halobacteriovorax vibrionivorans。其基因组已经测序完成,大小为 3,153,210 bp, GC含量为 35.84 mol%,预测到3047基因,其中 3009是蛋白编码基因, 6个rRNAs 组成两个操纵子, 32个 tRNA基因,分别有1910 和 1255 个蛋白基因可以比对上COG/KOG/NOGs数据和KEGG数据库。HLS与Halobacteriovorax marinus SJ(T)具有98.1%的16S rDNA同源性。菌株BALOs7、BALOs9 、Y22、HLS和LF TCBS 15的GenBank登录号分别为CP027772、QDKL00000000、SGIQ00000000、QOCL00000000和SBIG00000000。所获取的种质和基因资源不仅为蛭弧菌类群的系统发育分析、捕食机制的探索具有重要的理论价值,同时在微生物防控方面也具有巨大的应用潜力。.(3)采用高通量测序及16S rDNA克隆文库法,完成对厦门海域海水蛭弧菌生态分布的调查,确定水域中存在未培养的蛭弧菌类群。这些类群属于低丰度类群,比值小于0.015%。说明蛭弧菌在微生物生态调控中可能扮演着极其特别的调控作用,并为

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Draft Genome Sequence of an Extracellular Protease-Producing Bacterium, Stenotrophomonas bentonitica VV6, Isolated from Arctic Seawater.
从北极海水中分离出的胞外蛋白酶生产细菌 Bentonitica 寡养单胞菌 VV6 的基因组序列草案
  • DOI:
    10.1128/genomea.01610-17
  • 发表时间:
    2018-02-22
  • 期刊:
    Genome announcements
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Chen MX;Li HY;Ye XS;He XY
  • 通讯作者:
    He XY
嗜盐噬菌弧菌BALOs10菌株的分离、鉴定及其裂解谱
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    --
  • 期刊:
    微生物学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    叶晓声;赵何;陈明霞;李和阳;何小玉
  • 通讯作者:
    何小玉
漳州紫泥围垦区海水中弧菌类群研究
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    安徽农业科学
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈明霞;郑计瑞;李和阳
  • 通讯作者:
    李和阳

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其他文献

深圳海域细菌总数及可培养细菌总数的分布及其在环境评价中的应用研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2011
  • 期刊:
    海洋环境科学
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  • 作者:
    李和阳;陈明霞;李刚;郑天凌;郑森林;陈彬
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    陈彬
基于 CPSO 优化的 LADRC 胎面挤出量控制系统研究
  • DOI:
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  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
    桂林理工大学学报
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  • 作者:
    彭子豪;陈明霞;卢澎澎
  • 通讯作者:
    卢澎澎
长江口典型站位浮游细菌类群的组成特征研究
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  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
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  • 作者:
    李和阳;陈明霞;焦念志
  • 通讯作者:
    焦念志
基于模糊自适应PID的卷绕系统张力控制
  • DOI:
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  • 作者:
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  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
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    --
  • 作者:
    陈明霞;张寒;李顺艳
  • 通讯作者:
    李顺艳

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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