代谢工程改造枯草芽孢杆菌合成N-乙酰神经氨酸关键问题的研究

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AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31600068
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    21.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C0104.微生物遗传与生物合成
  • 结题年份:
    2019
  • 批准年份:
    2016
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2017-01-01 至2019-12-31

项目摘要

N-acetylneuraminic acid (NeuAc) is one of the most important sialic acid, which has been widely used as nutraceutical and drug intermediate with wide range of applications and market. Microbial fermentation is a promising method to produce NeuAc in green and sustainable manners compared to traditional extraction method and chemical synthesis approach. However, unknown effects of different NeuAc synthetic pathway on glycolysis, insufficient dephosphorylation of intermediate N-acetylglucosamine-6-phosphate (GlcNAc6P), and imbalance between NeuAc synthesis and cell growth limit efficient NeuAc production. In this project, we plan to solve the abovementioned problems. To this end, we plan to use a GlcNAc overproducing B. subtilis strain BSGN as the initial host, which was obtained from our previous work. Firstly, effects of NeuAc aldolase pathway and NeuAc synthase pathway on glycolysis will be investigated for balancing NeuAc synthetic pathway and glycolysis. Next, mechanism of dephosphorylation of intracellular phosphosugar will be studied to identify and verify key phosphatase for GlcNAc6P dephosphorylation. Finally, to obtain the optimal strategies for balancing NeuAc synthesis and cell growth, metabolic flux distribution of central carbon metabolism and NeuAc synthetic pathway will be optimized. The strategy developed in this project and mechanism elucidated in this study will be useful for unraveling regulation mechanism of related pathway and metabolic engineering for other nutraceutical production.
N-乙酰神经氨酸(NeuAc)是一种重要的唾液酸类化合物,作为营养化学品和药物中间体具有广泛的应用。微生物发酵法是替代传统提取法和化学合成法实现绿色、可持续生产NeuAc的重要方法。然而由于不同NeuAc合成途径对糖酵解途径的影响不明确、中间代谢产物N-乙酰氨基葡萄糖-6-P(GlcNAc6P)去磷酸调控机制未知,以及NeuAc合成与细胞生长不平衡这三个问题的存在,导致NeuAc合成效率低。本课题针对以上三个问题,以申请人前期研究中得到的一株产GlcNAc重组枯草芽孢杆菌作为出发菌株,解析NeuAc合成途径对糖酵解途径的影响,平衡NeuAc途径与糖酵解途径;揭示枯草芽孢杆菌磷酸糖去磷酸调控机理,获得GlcNAc6P高效磷酸酶,平衡NeuAc合成途径;调控碳中心代谢途径,平衡细胞生长与NeuAc合成。本研究采用的策略与阐明的相关机制将为代谢调控其它营养化学品合成途径的提供方法和理论上的参考。

结项摘要

N-乙酰神经氨酸(NeuAc)是一种重要的唾液酸类化合物,作为营养化学品和药物中间体具有广泛的应用。微生物发酵法是替代传统提取法和化学合成法实现绿色、可持续生产NeuAc的重要方法。然而由于不同NeuAc合成途径对糖酵解途径的影响不明确、中间代谢产物N-乙酰氨基葡萄糖-6-P(GlcNAc6P)去磷酸调控机制未知,以及NeuAc合成与细胞生长不平衡这三个问题的存在,导致NeuAc合成效率低。本项目枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)作为研究对象,首先,通过构建NeuAc合酶(NeuB)和NeuAc醛缩酶两条合成途径,发现NeuB途径可以获得0.33 g/L的NeuAc;通过在基因组和质粒上表达关键酶AGE和NeuB实验发现,质粒表达产量达到0.33 g/L,显著高于在基因组表达水平的0.05 g/L。其次,筛选验证了分别来源于大肠杆菌和枯草芽孢杆菌的共6个去磷酸化酶,发现仅有来源于大肠杆菌的YqaB酶是以GlcNAc6为底物,当在枯草芽孢杆菌中过表达YqaB时,NeuAc、ManNAc和GlcNAc分别提升36.4%、96.5%和35.4%,至0.45 g/L、0.28 g/L和0.88 g/L。然后,通过模块化工程将GlcNAc和磷酸烯醇式丙酮酸模块的不同供应强度进行组合,当GlcNAc和PEP模块都达到最高强度时,NeuAc产量和合成速率分别为1.65 g/L,显著提高NeuAc合成效率。最后,通过敲除丙酮酸激酶(Pyk),弱化中心代谢,引入异源ED途径,平衡细胞生长和产物合成,使NeuAc产量达到1.87 g/L;进一步通过选取不同强度RBS,微调YtsJ基因表达,优化苹果酸对于PEP和丙酮酸供给的平衡,使得NeuAc产量最终达到2.18 g/L,葡萄糖得率提高到59.82 mg/g。本项目完成了产NeuAc食品安全级菌株枯草芽孢杆菌的构建,为发酵法规模化制备N-乙酰神经氨酸奠定了基础。同时,本项目阐明的机理和相关代谢工程改造策略将为其它营养化学品的代谢调控机理研究提供方法和理论上的参考。

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(4)
Pathway Engineering of Bacillus subtilis for Enhanced N-Acetylneuraminic Acid Production via Whole-Cell Biocatalysis
通过全细胞生物催化增强 N-乙酰神经氨酸生产的枯草芽孢杆菌途径工程
  • DOI:
    10.1002/biot.201800682
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Biotechnology Journal
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Zhao Lin;Tian Rongzhen;Shen Qingyang;Liu Yanfeng;Liu Long;Li Jianghua;Du Guocheng
  • 通讯作者:
    Du Guocheng
Synthetic N-terminal coding sequences for fine-tuning gene expression and metabolic engineering in Bacillus subtilis
用于微调枯草芽孢杆菌基因表达和代谢工程的合成 N 端编码序列
  • DOI:
    10.1016/j.ymben.2019.07.001
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    Metabolic Engineering
  • 影响因子:
    8.4
  • 作者:
    Tian Rongzhen;Liu Yanfeng;Chen Junrong;Li Jianghua;Liu Long;Du Guocheng;Chen Jian
  • 通讯作者:
    Chen Jian
Synthetic Biology Toolbox and Chassis Development in Bacillus subtilis
枯草芽孢杆菌合成生物学工具箱和底盘开发
  • DOI:
    10.1016/j.tibtech.2018.10.005
  • 发表时间:
    2019-05-01
  • 期刊:
    TRENDS IN BIOTECHNOLOGY
  • 影响因子:
    17.3
  • 作者:
    Liu, Yanfeng;Liu, Long;Chen, Jian
  • 通讯作者:
    Chen, Jian
Modular pathway engineering of key carbon-precursor supply-pathways for improved N-acetylneuraminic acid production in Bacillus subtilis
用于改善枯草芽孢杆菌 N-乙酰神经氨酸生产的关键碳前体供应途径的模块化途径工程
  • DOI:
    10.1002/bit.26743
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
    Biotechnology and Bioengineering
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Zhang Xiaolong;Liu Yanfeng;Liu Long;Wang Miao;Li Jianghua;Du Guocheng;Chen Jian
  • 通讯作者:
    Chen Jian
Metabolic engineering of Bacillus subtilis fueled by systems biology: Recent advances and future directions
系统生物学推动的枯草芽孢杆菌代谢工程:最新进展和未来方向
  • DOI:
    10.1016/j.biotechadv.2016.11.003
  • 发表时间:
    2017-01-01
  • 期刊:
    BIOTECHNOLOGY ADVANCES
  • 影响因子:
    16
  • 作者:
    Liu, Yanfeng;Li, Jianghua;Liu, Long
  • 通讯作者:
    Liu, Long

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  • 作者:
    李超;刘延峰;艾丽昆
  • 通讯作者:
    艾丽昆

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课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

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          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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