致命鹅膏菌的毒素编码基因克隆及其多态性研究

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项目介绍
AI项目解读

基本信息

  • 批准号:
    31101592
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    22.0万
  • 负责人:
  • 依托单位:
  • 学科分类:
    C1510.食用真菌学
  • 结题年份:
    2014
  • 批准年份:
    2011
  • 项目状态:
    已结题
  • 起止时间:
    2012-01-01 至2014-12-31

项目摘要

剧毒鹅膏菌是毒蘑菇中毒死亡的头号杀手,其含有的鹅膏毒素具有强致死性,但同时又具广阔的应用前景,是医药业和农药业寻找新药物的重要资源。鹅膏毒素的相关研究一直备受关注,但主要集中在生理生化方面,对鹅膏毒素基因的相关研究很少,我国至今仍未见报道。.本项目利用我国特有的致命鹅膏菌为材料,克隆和测定其主要毒素的编码基因,并对编码基因进行序列分析,获取其功能信息。研究致命鹅膏和其他不同毒鹅膏菌毒素编码基因的多态性,分析毒素种类多样性与其编码基因多态性的相关性。同时通过对致命鹅膏菌不同生长时期,其主要毒素编码基因进行检测,探讨毒素编码基因在该菌不同生长时期的表达差异。.本研究将首次解析我国特有剧毒鹅膏菌主要毒素编码基因的序列信息、遗传多样性及其发生规律,研究结果将对建立有毒鹅膏菌的分子生物学快速检测技术,突破鹅膏毒素批量生产,开拓毒素基因药物等方面的应用研究奠定重要基础,具有重要的科学意义和社会意义。

结项摘要

剧毒鹅膏菌是毒蘑菇中毒死亡的头号杀手,其含有的鹅膏毒素既具强致死性,又有广阔的应用前景。项目首次克隆并分析了致命鹅膏Amanita exitialis的α-amanitin和phallacidin的编码基因全长序列;其分别编码35和34个氨基酸前体肽,该前体肽具较保守的上下游区域,中间为7-8个氨基酸组成的可变性高的毒素编码区;通过毒素基因简并引物从致命鹅膏菌基因组DNA中扩增获得了编码9条毒素及相关肽类序列,包括α-amanitin、β-amanitin、phallacidin、amaniexitide等毒素序列,以及三条未知功能的新肽类序列。.为分析剧毒鹅膏毒素基因多态性,项目从致命鹅膏、灰花纹鹅膏、拟灰花纹鹅膏、淡玫红鹅膏、皱盖鹅膏和绿盖鹅膏等6种剧毒鹅膏种类中共获得了54条毒素及相关肽类的基因序列,占目前数据库中已报道的毒素基因家族成员的70.1%。其中有20条序列是编码α-amanitin,5条序列编码β-amanitin,16条序列编码phallacidin,其他13条为未知功能的新肽类序列。研究表明剧毒鹅膏菌含有丰富的肽类毒素相关编码基因,不同的种存在部分相同基因,也存在一些特异性基因。.本项目首次采用qRT-PCR技术分析致命鹅膏子实体四个不同生长时期和三个不同部位毒素α-amanitin编码基因(α-AMA)的表达水平。研究结果表明:α-AMA在致命鹅膏菌的各个生长阶段和不同部位中均可表达,但表达水平不均衡:在四个生长时期中,α-AMA在延伸期初期的整个子实体内具有较高的表达水平;除了延伸期初期外,在其他三个生长时期中均是α-AMA在菌伞中具有最高的表达水平。这说明α-AMA的表达水平是与致命鹅膏菌子实体的生长旺盛程度相关的,与毒素含量变化表现出一致性。.为更深入系统地了解致命鹅膏毒素基因,项目增加了该菌子实体的转录组测序分析,研究共得到25,563,688个高质量序列,注释了27,848个单基因簇,鉴定了27,826个编码基因序列,共发现1,254个SSR和11个毒素基因家族成员的单基因簇。.本项目发表第一标注论文11篇(其中SCI论文5篇),授权专利1项,培养博士研究生1名。研究结果对建立有毒鹅膏菌的分子生物学快速检测技术,突破鹅膏毒素批量生产,开拓毒素基因药物等方面的应用研究奠定重要基础,具有重要的科学意义和社会意义。

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(5)
专利数量(0)
Ganoderma leucocontextum, a new member of the G. lucidum complex from southwestern China
纯白灵芝(Ganoderma leucocontextum),来自中国西南部的灵芝复合体的新成员
  • DOI:
    10.1016/j.myc.2014.03.005
  • 发表时间:
    2015-01-01
  • 期刊:
    MYCOSCIENCE
  • 影响因子:
    1.4
  • 作者:
    Li, Tai-Hui;Hu, Hui-Ping;Tsering, Tamdrin
  • 通讯作者:
    Tsering, Tamdrin
A small cyathiform new species of Clitopilus from Guangdong, China
中国广东斜毛属小型杯形新种
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Mycosystema
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    Deng WQ;Shen YH;Li TH
  • 通讯作者:
    Li TH
The molecular diversity of toxin gene families in lethal Amanita mushrooms
致死性鹅膏菌毒素基因家族的分子多样性
  • DOI:
    10.1016/j.toxicon.2014.02.020
  • 发表时间:
    2014-06-01
  • 期刊:
    TOXICON
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Li, Peng;Deng, Wangqiu;Li, Taihui
  • 通讯作者:
    Li, Taihui
Molecular cloning of α-amanitin and characterization of its expression pattern in different parts and development stages of Amanita exitialis fruitbody
鹅膏菌子实体α-鹅膏菌素的分子克隆及其在不同部位和发育阶段的表达模式表征
  • DOI:
    10.1007/s11557-014-0988-9
  • 发表时间:
    2014-11-01
  • 期刊:
    MYCOLOGICAL PROGRESS
  • 影响因子:
    2.4
  • 作者:
    Li, Peng;Deng, Wang-qiu;Li, Tai-hui
  • 通讯作者:
    Li, Tai-hui
Illumina-based de novo transcriptome sequencing and analysis of emAmanita exitialis /embasidiocarps
基于 Illumina 的从头转录组测序和分析
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
    Gene
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Deng WQ;Li P;Li TH;Song B;Shen YH
  • 通讯作者:
    Shen YH

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其他文献

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    --
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  • 通讯作者:
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  • 期刊:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    贺 勇
中国小蘑菇属三新记录种
  • DOI:
    --
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
    江西农业大学学报
  • 影响因子:
    --
  • 作者:
    陈言柳;裴男才;张林平;邓旺秋;吴 斐;刘 萌
  • 通讯作者:
    刘 萌
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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
    邓旺秋

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华南鹅膏菌物种多样性及其系统发育基因组学研究
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相似国自然基金

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相似海外基金

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AI项目解读示例

课题项目:调控A型流感病毒诱导IFN-β表达的机制研究

AI项目摘要:

本研究聚焦于TRIM2蛋白在A型流感病毒诱导的IFN-β表达中的调控机制。A型流感病毒是全球性健康问题,其感染可导致严重的呼吸道疾病。IFN-β作为关键的抗病毒因子,其表达水平对抗病毒防御至关重要。然而,TRIM2如何调控IFN-β的表达尚未明确。本研究假设TRIM2通过与病毒RNA或宿主因子相互作用,影响IFN-β的产生。我们将采用分子生物学、细胞生物学和免疫学方法,探索TRIM2与A型流感病毒诱导IFN-β表达的关系。预期结果将揭示TRIM2在抗病毒免疫反应中的作用,为开发新的抗病毒策略提供理论基础。该研究对理解宿主抗病毒机制具有重要科学意义,并可能对临床治疗流感病毒感染提供新的视角。

AI项目思路:

科学问题:TRIM2如何调控A型流感病毒诱导的IFN-β表达?
前期研究:已有研究表明TRIM2参与抗病毒反应,但其具体机制尚不明确。
研究创新点:本研究将深入探讨TRIM2在IFN-β表达中的直接作用机制。
技术路线:包括病毒学、分子生物学、细胞培养和免疫检测技术。
关键技术:TRIM2与病毒RNA的相互作用分析,IFN-β启动子活性检测。
实验模型:使用A型流感病毒感染的细胞模型进行研究。

AI技术路线图

        graph TD
          A[研究起始] --> B[文献回顾与假设提出]
          B --> C[实验设计与方法学准备]
          C --> D[A型流感病毒感染模型建立]
          D --> E[TRIM2与病毒RNA相互作用分析]
          E --> F[TRIM2对IFN-β启动子活性的影响]
          F --> G[IFN-β表达水平测定]
          G --> H[TRIM2功能丧失与获得研究]
          H --> I[数据收集与分析]
          I --> J[结果解释与科学验证]
          J --> K[研究结论与未来方向]
          K --> L[研究结束]
      
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